MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Kyrpidia tusciae DSM 2912 chromosome

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014098	CAGCGG	2	12	22250	22261	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014098	CCAAGG	2	12	78143	78154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014098	CTCTTT	2	12	85580	85591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014098	AGTCAA	2	12	117421	117432	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014098	GGTGGG	2	12	175164	175175	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014098	GCCCGT	2	12	176266	176277	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014098	GAAAAA	2	12	185550	185561	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014098	AAGGCC	2	12	203727	203738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014098	GCCCCG	2	12	209659	209670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014098	GAGGGG	2	12	287371	287382	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014098	TCTCTG	2	12	292281	292292	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014098	CAAACC	2	12	347230	347241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014098	AGGGAT	2	12	348437	348448	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014098	GGGGAG	2	12	396256	396267	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014098	GTTTGG	2	12	426814	426825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014098	ACTGAG	2	12	444955	444966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014098	CAAACC	2	12	530693	530704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014098	TCCACT	2	12	538568	538579	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014098	ACGGCG	2	12	600975	600986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014098	GTGTGA	2	12	624746	624757	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014098	CCCTTG	2	12	631717	631728	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014098	GGAGCC	2	12	735213	735224	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014098	GAGCCG	2	12	735612	735623	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014098	TCACGG	2	12	789134	789145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014098	CGTTTG	2	12	790801	790812	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014098	CCTATA	2	12	803493	803504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014098	AGGGGG	2	12	815775	815786	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014098	GTGTGG	2	12	821636	821647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014098	AGGGGG	2	12	829542	829553	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014098	TGCCCG	2	12	840582	840593	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014098	CAAATG	2	12	847676	847687	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014098	ACGACA	2	12	860807	860818	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014098	TTGATA	2	12	861428	861439	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014098	GACTCC	2	12	868898	868909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014098	GCTGGC	2	12	868937	868948	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014098	GCTGGC	2	12	870617	870628	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014098	GGGTGT	2	12	879746	879757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014098	ATCCGG	2	12	925320	925331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014098	ACGCTG	2	12	989810	989821	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014098	GATACA	2	12	1025553	1025564	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014098	GAGGGG	2	12	1037373	1037384	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014098	CAAACC	2	12	1049713	1049724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014098	TATCAC	2	12	1076963	1076974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014098	CACAAT	2	12	1143224	1143235	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014098	ATGCTT	2	12	1165501	1165512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014098	GCGTTT	2	12	1168069	1168080	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014098	GTTCGT	2	12	1300154	1300165	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014098	CGGCCC	2	12	1335958	1335969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014098	AGCGCC	2	12	1348534	1348545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014098	GTTCTT	2	12	1357152	1357163	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014098	AAGCGA	2	12	1359269	1359280	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014098	ATGGGG	2	12	1384744	1384755	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014098	CAAGGG	2	12	1395417	1395428	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014098	CGGAGG	2	12	1445175	1445186	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014098	GGCCGG	2	12	1474420	1474431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014098	GGGGTG	2	12	1496862	1496873	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014098	TGGGAA	2	12	1576692	1576703	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014098	CGGGGG	2	12	1601795	1601806	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014098	ACATCC	2	12	1646044	1646055	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014098	GAAAGG	2	12	1653247	1653258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014098	GGGTGT	2	12	1678433	1678444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014098	TAATTA	2	12	1689348	1689359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014098	CTTTCC	2	12	1692904	1692915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014098	TGACCG	2	12	1704037	1704048	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014098	TCTCCT	2	12	1743475	1743486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014098	CAAACC	2	12	1754096	1754107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014098	CGAAAG	2	12	1765533	1765544	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014098	GAACAC	2	12	1785686	1785697	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014098	CTCTAT	2	12	1797484	1797495	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014098	TCCCGT	2	12	1805373	1805384	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014098	CCGGCT	2	12	1827339	1827350	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014098	GCCACG	2	12	1852483	1852494	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014098	GCCGGG	2	12	1886468	1886479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014098	ACAGTA	2	12	1891551	1891562	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014098	AGCGGA	2	12	1899194	1899205	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014098	CAAACC	2	12	1909340	1909351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014098	CCATCG	2	12	1928280	1928291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014098	CCCTCT	2	12	1970709	1970720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_014098	GGGGGA	2	12	2054779	2054790	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014098	GGATTG	2	12	2057416	2057427	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014098	TTCGCT	2	12	2079145	2079156	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014098	GTTCAC	2	12	2103635	2103646	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014098	CCATGT	2	12	2103727	2103738	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014098	ATCTTT	2	12	2117335	2117346	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014098	GATCAA	2	12	2122741	2122752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014098	ACTGGC	2	12	2207100	2207111	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014098	AACCAA	2	12	2258137	2258148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014098	CATCTC	2	12	2275427	2275438	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014098	CAAACC	2	12	2286772	2286783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014098	GAACCC	2	12	2291197	2291208	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014098	ATCCAC	2	12	2301363	2301374	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014098	CAAACC	2	12	2301969	2301980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014098	CCGACC	2	12	2318873	2318884	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014098	GCTTCG	2	12	2334827	2334838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014098	CAAATG	2	12	2341175	2341186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014098	ACTTTC	2	12	2417120	2417131	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014098	CATTCC	2	12	2433355	2433366	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014098	TAGAGG	2	12	2497141	2497152	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014098	ATCGGA	2	12	2521796	2521807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014098	CCTAGT	2	12	2536245	2536256	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014098	GGCGAT	2	12	2575525	2575536	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014098	GCCCCG	2	12	2577512	2577523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014098	CGCCTC	2	12	2614112	2614123	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014098	CGTGAT	2	12	2701214	2701225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014098	TCCTTG	2	12	2721019	2721030	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014098	AGGGAT	2	12	2721450	2721461	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014098	TCCCGG	2	12	2722524	2722535	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014098	ACCCGT	2	12	2760557	2760568	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014098	GAACCT	2	12	2765297	2765308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014098	CCGGTT	2	12	2767705	2767716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014098	CACGCA	2	12	2788452	2788463	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014098	AAGCGC	2	12	2820895	2820906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014098	TGCTAT	2	12	2833737	2833748	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014098	GCGAAT	2	12	2852546	2852557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014098	TCCCAA	2	12	2853568	2853579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014098	CCCGGG	2	12	2898498	2898509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014098	TGCTTT	2	12	2899559	2899570	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014098	CCACCC	2	12	2902405	2902416	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
119	NC_014098	CGGATT	2	12	2903284	2903295	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014098	CCATGA	2	12	2906542	2906553	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014098	GGTTTG	2	12	2920915	2920926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014098	CCGCCC	2	12	2939515	2939526	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
123	NC_014098	GTGAAA	2	12	2988111	2988122	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014098	TGGAAG	2	12	3000108	3000119	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014098	CCGTTT	2	12	3027429	3027440	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014098	CGACCG	2	12	3035017	3035028	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014098	CAAGGC	2	12	3035107	3035118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014098	CCTCCC	2	12	3084243	3084254	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
129	NC_014098	ACAACC	2	12	3109538	3109549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014098	CGCCCG	2	12	3115499	3115510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014098	TCGGCG	2	12	3139763	3139774	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014098	GAGCCG	2	12	3149428	3149439	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014098	CCGGGT	2	12	3197790	3197801	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014098	GAAGGG	2	12	3242150	3242161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014098	CAGGAA	2	12	3262889	3262900	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_014098	GGCACG	2	12	3267923	3267934	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014098	CCCGGT	2	12	3337978	3337989	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014098	ATGAAC	2	12	3356026	3356037	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.