MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Kyrpidia tusciae DSM 2912 chromosome

Total Repeats: 485

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014098	TCGTG	2	10	10624	10633	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014098	GCAAG	2	10	11104	11113	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014098	GGGAG	2	10	11730	11739	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014098	CCGAG	2	10	12142	12151	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014098	AGAGG	2	10	12990	12999	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014098	GAAGT	2	10	14208	14217	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014098	TGGCG	2	10	25956	25965	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014098	GATCG	2	10	25994	26003	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014098	TTCGG	2	10	26077	26086	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014098	TCCCG	2	10	26449	26458	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_014098	ACCGG	2	10	46859	46868	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014098	TCCCT	2	10	53966	53975	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_014098	GAGGG	2	10	54114	54123	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014098	GGCTG	2	10	66992	67001	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014098	GGGGC	2	10	78160	78169	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014098	CGAGG	2	10	81538	81547	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014098	GGGAA	2	10	88413	88422	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014098	TGGGG	2	10	93723	93732	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014098	GCCCG	2	10	102375	102384	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_014098	GGGGA	2	10	108923	108932	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014098	TCGTG	2	10	110405	110414	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014098	GCAAG	2	10	110885	110894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014098	GGGAG	2	10	111511	111520	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014098	CCGAG	2	10	111923	111932	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014098	AGAGG	2	10	112804	112813	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014098	GAAGT	2	10	114022	114031	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014098	AGAAA	2	10	117332	117341	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014098	AGGAC	2	10	119590	119599	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014098	GAGAG	2	10	127373	127382	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014098	GATGG	2	10	129683	129692	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014098	GGGGA	2	10	136511	136520	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014098	GGCAG	2	10	174499	174508	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014098	CGGGA	2	10	174538	174547	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014098	ATATC	2	10	187072	187081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014098	GAAGC	2	10	192569	192578	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014098	GGCTG	2	10	200611	200620	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014098	CGGCC	2	10	201511	201520	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_014098	CAGAC	2	10	215674	215683	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014098	TCGTT	2	10	219821	219830	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014098	ATGGG	2	10	227754	227763	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014098	AGGCC	2	10	228601	228610	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_014098	GTTAT	2	10	234405	234414	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014098	AGTCG	2	10	234513	234522	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014098	GAGGG	2	10	234905	234914	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014098	TCCTG	2	10	259145	259154	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_014098	TCAAA	2	10	261406	261415	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014098	AGATC	2	10	265488	265497	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014098	GATGA	2	10	289176	289185	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014098	CTATA	2	10	293017	293026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014098	TTGAA	2	10	304319	304328	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014098	GCCGC	2	10	304842	304851	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_014098	GGTAT	2	10	305300	305309	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014098	GGCCG	2	10	315328	315337	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014098	TCGGA	2	10	315565	315574	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014098	CGGCG	2	10	336539	336548	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014098	GAAAA	2	10	336632	336641	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014098	CAGGT	2	10	336743	336752	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014098	TCGAA	2	10	347400	347409	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014098	CTTCT	2	10	347465	347474	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014098	ACCCG	2	10	350537	350546	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_014098	GCCGG	3	15	353763	353777	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_014098	CCTTT	2	10	360926	360935	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014098	TCGGA	2	10	374490	374499	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014098	GTTCT	2	10	374838	374847	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014098	AATGA	2	10	375809	375818	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014098	CACAG	2	10	379594	379603	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014098	GCGGG	2	10	407854	407863	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014098	CCACC	2	10	412221	412230	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
69	NC_014098	GCGCT	2	10	416584	416593	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014098	GACGA	2	10	429947	429956	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014098	TTCCG	2	10	444793	444802	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_014098	AACGC	2	10	456373	456382	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_014098	ACGTG	2	10	460968	460977	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014098	TGAGA	2	10	483399	483408	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014098	GAATG	2	10	483463	483472	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014098	GGATC	2	10	509250	509259	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014098	GGACG	2	10	516938	516947	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014098	CCGGG	2	10	522621	522630	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014098	AACCG	2	10	530660	530669	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014098	TCGAA	2	10	530863	530872	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014098	ACCGA	2	10	537132	537141	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014098	TTATA	2	10	543804	543813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014098	CCGGC	2	10	543933	543942	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_014098	TTTTG	2	10	548872	548881	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014098	AGACA	2	10	548968	548977	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014098	CGATA	2	10	565320	565329	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014098	TCCGG	2	10	573988	573997	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014098	GGGGA	2	10	578128	578137	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014098	GGCCG	2	10	595137	595146	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014098	TATCG	2	10	597285	597294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014098	GCAGA	2	10	598675	598684	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014098	CATCA	2	10	600724	600733	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014098	GATCG	2	10	610590	610599	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014098	GGAGA	2	10	610603	610612	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014098	GCTCC	2	10	618872	618881	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_014098	CGGGT	2	10	620949	620958	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014098	GAAAG	3	15	633684	633698	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014098	GGGGT	2	10	634386	634395	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014098	CTGTG	2	10	634681	634690	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014098	GGAGG	2	10	638119	638128	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014098	CGGTG	2	10	653479	653488	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014098	TCCTC	2	10	657259	657268	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
103	NC_014098	GTTTC	2	10	657390	657399	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014098	AGTCC	2	10	666125	666134	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014098	GTTTC	2	10	667236	667245	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014098	CACAG	2	10	674306	674315	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014098	TTGCT	2	10	676223	676232	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014098	CTTTT	2	10	677549	677558	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014098	ATTCG	2	10	677722	677731	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014098	GAAAA	2	10	677875	677884	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014098	GTATG	2	10	685773	685782	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014098	GTGTG	2	10	695436	695445	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014098	GCTGG	2	10	712495	712504	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014098	GGGGA	2	10	712523	712532	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014098	CCGAA	2	10	718767	718776	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014098	GAGCG	2	10	735937	735946	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014098	CCGGC	2	10	736265	736274	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_014098	GCAGG	2	10	780704	780713	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014098	ACTGA	2	10	781479	781488	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014098	GAGGG	2	10	782185	782194	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014098	GGCTC	2	10	785491	785500	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014098	CGGAC	2	10	786896	786905	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014098	TTTCC	2	10	787107	787116	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_014098	GGAAA	2	10	789825	789834	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014098	TGCCC	2	10	789977	789986	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_014098	CCGCC	2	10	791085	791094	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
127	NC_014098	TGCCC	2	10	793330	793339	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_014098	GAGCC	2	10	803357	803366	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014098	CGGGA	2	10	814404	814413	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014098	TCGGT	2	10	818449	818458	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014098	GAAGA	2	10	829941	829950	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014098	CTATA	2	10	830991	831000	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014098	TGTTT	2	10	843722	843731	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014098	ACTTT	2	10	844820	844829	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014098	CAGCT	2	10	847602	847611	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014098	GAATG	2	10	850119	850128	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014098	GCTGC	2	10	854577	854586	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_014098	GTCCT	2	10	854837	854846	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_014098	GTGGC	2	10	861369	861378	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014098	CAGCG	2	10	864338	864347	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_014098	GTCGC	2	10	869136	869145	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_014098	ACGGC	2	10	879914	879923	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_014098	GGGTT	2	10	884399	884408	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014098	CGGGA	2	10	897251	897260	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014098	CTCCC	2	10	897605	897614	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
146	NC_014098	CTCCC	2	10	904977	904986	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
147	NC_014098	CCTTA	2	10	907500	907509	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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285	NC_014098	TTTAT	2	10	2130418	2130427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_014098	TTTCA	2	10	2172775	2172784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_014098	TCGTA	2	10	2183099	2183108	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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293	NC_014098	AAGCG	2	10	2219064	2219073	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
294	NC_014098	TTTCC	2	10	2222056	2222065	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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302	NC_014098	GTCCG	2	10	2301349	2301358	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
303	NC_014098	TCGAA	2	10	2302139	2302148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
304	NC_014098	CTTCT	2	10	2302204	2302213	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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422	NC_014098	AGCAG	2	10	2986352	2986361	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
423	NC_014098	GAACA	2	10	2990114	2990123	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
424	NC_014098	TATTG	2	10	2990252	2990261	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_014098	CCCCT	2	10	3368217	3368226	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
482	NC_014098	GGATC	2	10	3369871	3369880	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
483	NC_014098	AACCC	2	10	3372703	3372712	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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485	NC_014098	CCGCC	2	10	3382988	3382997	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.