MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter capsulatus SB 1003 plasmid pRCB133

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014035	CGGAA	2	10	34	43	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014035	CGCCC	2	10	502	511	0 %	0 %	20 %	80 %	294679056
3	NC_014035	AGCGC	2	10	1034	1043	20 %	0 %	40 %	40 %	294679057
4	NC_014035	CCGGC	2	10	1424	1433	0 %	0 %	40 %	60 %	294679057
5	NC_014035	CCGAA	2	10	2126	2135	40 %	0 %	20 %	40 %	294679058
6	NC_014035	GCGCG	2	10	2838	2847	0 %	0 %	60 %	40 %	294679059
7	NC_014035	CCGGC	2	10	3376	3385	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_014035	CGCGG	2	10	4020	4029	0 %	0 %	60 %	40 %	294679060
9	NC_014035	TCGGC	2	10	5517	5526	0 %	20 %	40 %	40 %	294679062
10	NC_014035	ACCCC	2	10	5610	5619	20 %	0 %	0 %	80 %	294679062
11	NC_014035	CAGAT	2	10	6211	6220	40 %	20 %	20 %	20 %	294679063
12	NC_014035	GCAGC	2	10	6672	6681	20 %	0 %	40 %	40 %	294679063
13	NC_014035	CGCGG	2	10	10356	10365	0 %	0 %	60 %	40 %	294679067
14	NC_014035	CCGGA	2	10	11601	11610	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014035	GCCCG	2	10	17103	17112	0 %	0 %	40 %	60 %	294679078
16	NC_014035	CGCGA	2	10	17512	17521	20 %	0 %	40 %	40 %	294679079
17	NC_014035	CGCGG	2	10	18308	18317	0 %	0 %	60 %	40 %	294679081
18	NC_014035	CGCGG	2	10	18761	18770	0 %	0 %	60 %	40 %	294679081
19	NC_014035	CCTCG	2	10	20126	20135	0 %	20 %	20 %	60 %	294679083
20	NC_014035	CAGCG	2	10	20824	20833	20 %	0 %	40 %	40 %	294679085
21	NC_014035	CCGCC	2	10	22186	22195	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22	NC_014035	CTGAC	2	10	22748	22757	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014035	CACCG	2	10	23214	23223	20 %	0 %	20 %	60 %	294679090
24	NC_014035	GTGCG	2	10	24192	24201	0 %	20 %	60 %	20 %	294679091
25	NC_014035	TCGCC	2	10	26554	26563	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_014035	GTTTG	2	10	26951	26960	0 %	60 %	40 %	0 %	294679096
27	NC_014035	GCGCC	2	10	27391	27400	0 %	0 %	40 %	60 %	294679096
28	NC_014035	GCGCC	2	10	29420	29429	0 %	0 %	40 %	60 %	294679099
29	NC_014035	GCCCA	2	10	29791	29800	20 %	0 %	20 %	60 %	294679099
30	NC_014035	CGGAT	2	10	30991	31000	20 %	20 %	40 %	20 %	294679101
31	NC_014035	TCATG	2	10	33519	33528	20 %	40 %	20 %	20 %	294679103
32	NC_014035	CCCCG	2	10	35106	35115	0 %	0 %	20 %	80 %	294679104
33	NC_014035	CCCAG	2	10	35383	35392	20 %	0 %	20 %	60 %	294679105
34	NC_014035	CGGCG	2	10	38057	38066	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014035	GGGTC	2	10	39038	39047	0 %	20 %	60 %	20 %	294679108
36	NC_014035	CTCTT	2	10	39554	39563	0 %	60 %	0 %	40 %	294679108
37	NC_014035	GCGCC	2	10	40634	40643	0 %	0 %	40 %	60 %	294679110
38	NC_014035	CATCG	2	10	42426	42435	20 %	20 %	20 %	40 %	294679112
39	NC_014035	AGCGC	2	10	45262	45271	20 %	0 %	40 %	40 %	294679113
40	NC_014035	CGGGC	2	10	45398	45407	0 %	0 %	60 %	40 %	294679113
41	NC_014035	GGGCA	2	10	45427	45436	20 %	0 %	60 %	20 %	294679113
42	NC_014035	TGCGC	2	10	47737	47746	0 %	20 %	40 %	40 %	294679115
43	NC_014035	ATGCG	2	10	49202	49211	20 %	20 %	40 %	20 %	294679116
44	NC_014035	CGGCC	2	10	52313	52322	0 %	0 %	40 %	60 %	294679119
45	NC_014035	CAGGA	2	10	52997	53006	40 %	0 %	40 %	20 %	294679121
46	NC_014035	GGCCA	2	10	53879	53888	20 %	0 %	40 %	40 %	294679121
47	NC_014035	GGTCA	2	10	54443	54452	20 %	20 %	40 %	20 %	294679122
48	NC_014035	AGCCC	2	10	56705	56714	20 %	0 %	20 %	60 %	294679125
49	NC_014035	GCCAG	2	10	57283	57292	20 %	0 %	40 %	40 %	294679126
50	NC_014035	GGGCA	2	10	57347	57356	20 %	0 %	60 %	20 %	294679126
51	NC_014035	GCGCC	2	10	58935	58944	0 %	0 %	40 %	60 %	294679127
52	NC_014035	GGATC	2	10	60035	60044	20 %	20 %	40 %	20 %	294679128
53	NC_014035	GCCAC	2	10	60590	60599	20 %	0 %	20 %	60 %	294679128
54	NC_014035	ATCGC	2	10	60778	60787	20 %	20 %	20 %	40 %	294679128
55	NC_014035	GCGCC	2	10	61241	61250	0 %	0 %	40 %	60 %	294679128
56	NC_014035	CAGGG	2	10	61852	61861	20 %	0 %	60 %	20 %	294679129
57	NC_014035	CGTCA	2	10	62544	62553	20 %	20 %	20 %	40 %	294679129
58	NC_014035	GCCGG	2	10	63628	63637	0 %	0 %	60 %	40 %	294679130
59	NC_014035	CGATG	2	10	64423	64432	20 %	20 %	40 %	20 %	294679131
60	NC_014035	CCGGC	2	10	64806	64815	0 %	0 %	40 %	60 %	294679132
61	NC_014035	CAGAA	2	10	66767	66776	60 %	0 %	20 %	20 %	294679136
62	NC_014035	GGGGC	2	10	67787	67796	0 %	0 %	80 %	20 %	294679136
63	NC_014035	TCGGC	2	10	68072	68081	0 %	20 %	40 %	40 %	294679137
64	NC_014035	CATGC	2	10	68148	68157	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014035	GCCGT	2	10	68677	68686	0 %	20 %	40 %	40 %	294679138
66	NC_014035	GCGCC	2	10	68939	68948	0 %	0 %	40 %	60 %	294679138
67	NC_014035	GCCAG	2	10	69287	69296	20 %	0 %	40 %	40 %	294679138
68	NC_014035	AGCCC	2	10	69311	69320	20 %	0 %	20 %	60 %	294679138
69	NC_014035	CGGAT	2	10	69406	69415	20 %	20 %	40 %	20 %	294679138
70	NC_014035	CGTCA	2	10	69881	69890	20 %	20 %	20 %	40 %	294679139
71	NC_014035	CGGGC	2	10	70978	70987	0 %	0 %	60 %	40 %	294679140
72	NC_014035	CGGGG	2	10	71455	71464	0 %	0 %	80 %	20 %	294679141
73	NC_014035	GGCGT	2	10	72759	72768	0 %	20 %	60 %	20 %	294679143
74	NC_014035	TGACC	2	10	73190	73199	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014035	GGCGA	2	10	73817	73826	20 %	0 %	60 %	20 %	294679144
76	NC_014035	CGCGG	2	10	75561	75570	0 %	0 %	60 %	40 %	294679145
77	NC_014035	TCGGG	2	10	75779	75788	0 %	20 %	60 %	20 %	294679145
78	NC_014035	AGGCC	2	10	76358	76367	20 %	0 %	40 %	40 %	294679145
79	NC_014035	CGAGC	2	10	76793	76802	20 %	0 %	40 %	40 %	294679145
80	NC_014035	TGGCC	2	10	78454	78463	0 %	20 %	40 %	40 %	294679146
81	NC_014035	ATGCC	2	10	79773	79782	20 %	20 %	20 %	40 %	294679148
82	NC_014035	TGCGC	2	10	80253	80262	0 %	20 %	40 %	40 %	294679149
83	NC_014035	GCGCC	2	10	81367	81376	0 %	0 %	40 %	60 %	294679150
84	NC_014035	CTGGC	2	10	82639	82648	0 %	20 %	40 %	40 %	294679153
85	NC_014035	GCGTC	2	10	82950	82959	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014035	CCCGG	2	10	83373	83382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_014035	CCCGA	2	10	84263	84272	20 %	0 %	20 %	60 %	294679155
88	NC_014035	CGGTG	2	10	84303	84312	0 %	20 %	60 %	20 %	294679155
89	NC_014035	CCCGA	2	10	84586	84595	20 %	0 %	20 %	60 %	294679155
90	NC_014035	TGCCG	2	10	85459	85468	0 %	20 %	40 %	40 %	294679156
91	NC_014035	GGACA	2	10	86622	86631	40 %	0 %	40 %	20 %	294679157
92	NC_014035	CGGGC	2	10	87532	87541	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014035	CGATC	2	10	88449	88458	20 %	20 %	20 %	40 %	294679160
94	NC_014035	CGCGG	2	10	90661	90670	0 %	0 %	60 %	40 %	294679161
95	NC_014035	GGGCC	2	10	91203	91212	0 %	0 %	60 %	40 %	294679162
96	NC_014035	GCCGG	2	10	91428	91437	0 %	0 %	60 %	40 %	294679162
97	NC_014035	AGCGC	2	10	92882	92891	20 %	0 %	40 %	40 %	294679163
98	NC_014035	CGGTG	2	10	93522	93531	0 %	20 %	60 %	20 %	294679163
99	NC_014035	CCCCT	2	10	93645	93654	0 %	20 %	0 %	80 %	294679163
100	NC_014035	CGGCG	2	10	93701	93710	0 %	0 %	60 %	40 %	294679163
101	NC_014035	GACCC	2	10	93810	93819	20 %	0 %	20 %	60 %	294679164
102	NC_014035	GTCCG	2	10	94198	94207	0 %	20 %	40 %	40 %	294679164
103	NC_014035	GGCCA	2	10	94403	94412	20 %	0 %	40 %	40 %	294679164
104	NC_014035	CTCAT	2	10	94560	94569	20 %	40 %	0 %	40 %	294679164
105	NC_014035	CGCAT	2	10	94713	94722	20 %	20 %	20 %	40 %	294679164
106	NC_014035	CAGCG	2	10	95789	95798	20 %	0 %	40 %	40 %	294679164
107	NC_014035	GCCGC	2	10	95965	95974	0 %	0 %	40 %	60 %	294679165
108	NC_014035	GCGCG	2	10	95997	96006	0 %	0 %	60 %	40 %	294679165
109	NC_014035	CGGTC	2	10	96354	96363	0 %	20 %	40 %	40 %	294679165
110	NC_014035	CCGGC	2	10	96651	96660	0 %	0 %	40 %	60 %	294679165
111	NC_014035	TCTGA	2	10	97099	97108	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014035	TGCGC	2	10	97699	97708	0 %	20 %	40 %	40 %	294679166
113	NC_014035	CCCTG	2	10	99267	99276	0 %	20 %	20 %	60 %	294679167
114	NC_014035	CGACC	2	10	101340	101349	20 %	0 %	20 %	60 %	294679169
115	NC_014035	CCAGC	2	10	103054	103063	20 %	0 %	20 %	60 %	294679171
116	NC_014035	CCAGC	2	10	103099	103108	20 %	0 %	20 %	60 %	294679171
117	NC_014035	GACCG	2	10	103435	103444	20 %	0 %	40 %	40 %	294679172
118	NC_014035	AGCGC	2	10	103591	103600	20 %	0 %	40 %	40 %	294679172
119	NC_014035	GCCGG	2	10	104027	104036	0 %	0 %	60 %	40 %	294679173
120	NC_014035	CACCG	2	10	106074	106083	20 %	0 %	20 %	60 %	294679176
121	NC_014035	GGGGC	2	10	106318	106327	0 %	0 %	80 %	20 %	294679177
122	NC_014035	GCCGA	2	10	106605	106614	20 %	0 %	40 %	40 %	294679177
123	NC_014035	GCCGC	2	10	106742	106751	0 %	0 %	40 %	60 %	294679177
124	NC_014035	TCGCG	2	10	106879	106888	0 %	20 %	40 %	40 %	294679177
125	NC_014035	CGGCC	2	10	107126	107135	0 %	0 %	40 %	60 %	294679178
126	NC_014035	GACCA	2	10	107734	107743	40 %	0 %	20 %	40 %	294679178
127	NC_014035	GCCCG	2	10	108898	108907	0 %	0 %	40 %	60 %	294679179
128	NC_014035	TCGCG	2	10	108981	108990	0 %	20 %	40 %	40 %	294679179
129	NC_014035	GCCCC	2	10	108991	109000	0 %	0 %	20 %	80 %	294679179
130	NC_014035	ATTTG	2	10	112508	112517	20 %	60 %	20 %	0 %	294679183
131	NC_014035	CCAGA	2	10	113117	113126	40 %	0 %	20 %	40 %	294679184
132	NC_014035	GAGAG	2	10	114139	114148	40 %	0 %	60 %	0 %	294679185
133	NC_014035	AGGGC	2	10	114269	114278	20 %	0 %	60 %	20 %	294679186
134	NC_014035	GCCGC	2	10	114352	114361	0 %	0 %	40 %	60 %	294679186
135	NC_014035	GGGCC	2	10	114941	114950	0 %	0 %	60 %	40 %	294679186
136	NC_014035	CCGAT	2	10	115121	115130	20 %	20 %	20 %	40 %	294679186
137	NC_014035	GAAAA	2	10	117393	117402	80 %	0 %	20 %	0 %	294679189
138	NC_014035	GCGCC	2	10	117831	117840	0 %	0 %	40 %	60 %	294679190
139	NC_014035	GAAAA	2	10	118163	118172	80 %	0 %	20 %	0 %	294679190
140	NC_014035	GCGCG	2	10	118266	118275	0 %	0 %	60 %	40 %	294679190
141	NC_014035	GGTCG	2	10	118288	118297	0 %	20 %	60 %	20 %	294679190
142	NC_014035	CCGCG	2	10	118680	118689	0 %	0 %	40 %	60 %	294679190
143	NC_014035	GGCCG	2	10	119898	119907	0 %	0 %	60 %	40 %	294679191
144	NC_014035	TGCGC	2	10	121467	121476	0 %	20 %	40 %	40 %	294679194
145	NC_014035	CGACA	2	10	122478	122487	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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148	NC_014035	CCTGC	2	10	123716	123725	0 %	20 %	20 %	60 %	294679196
149	NC_014035	GCCTC	2	10	125992	126001	0 %	20 %	20 %	60 %	294679198
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151	NC_014035	AAATC	2	10	126969	126978	60 %	20 %	0 %	20 %	294679200
152	NC_014035	GGCGC	2	10	128198	128207	0 %	0 %	60 %	40 %	294679201
153	NC_014035	CGGCG	2	10	129332	129341	0 %	0 %	60 %	40 %	294679202
154	NC_014035	GCCGC	2	10	129876	129885	0 %	0 %	40 %	60 %	294679202

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.