MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter capsulatus SB 1003 plasmid pRCB133

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014035	CGGG	2	8	1492	1499	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014035	TGGG	2	8	8298	8305	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014035	CGCC	2	8	21641	21648	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_014035	ATCC	2	8	21686	21693	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014035	TCGA	3	12	21700	21711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014035	GCAG	2	8	26610	26617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014035	CTGG	2	8	31959	31966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014035	CCCG	2	8	32020	32027	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_014035	GCGG	2	8	38075	38082	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014035	GACC	2	8	38183	38190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014035	AAAT	2	8	45510	45517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014035	GGTC	2	8	46610	46617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014035	TGCT	2	8	46980	46987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014035	ACCG	2	8	48055	48062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014035	GGCC	2	8	50218	50225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014035	TGGC	2	8	50365	50372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014035	AAGG	2	8	52639	52646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014035	CGCC	2	8	73200	73207	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_014035	GATC	2	8	73224	73231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014035	CGAC	2	8	73331	73338	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014035	CGGG	2	8	73381	73388	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014035	GACG	2	8	73436	73443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014035	AGCT	2	8	73457	73464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014035	AAAG	2	8	73508	73515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014035	CGGG	2	8	77342	77349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014035	TGCA	2	8	77427	77434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014035	GGGC	2	8	79946	79953	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014035	AAGC	2	8	83227	83234	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014035	GTCT	2	8	95916	95923	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014035	GCAG	2	8	104681	104688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014035	GGAA	2	8	104689	104696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014035	CTGC	2	8	104702	104709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014035	TCGT	2	8	115435	115442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014035	GTTC	2	8	116123	116130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014035	ACCG	2	8	120704	120711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014035	CCGA	2	8	120746	120753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014035	CAGG	2	8	122374	122381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014035	CTGG	2	8	122551	122558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014035	TTTG	2	8	123772	123779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014035	ACCC	2	8	130064	130071	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_014035	CCGG	2	8	130295	130302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.