MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter capsulatus SB 1003 chromosome

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014034	ATACCC	2	12	96252	96263	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014034	GTTTCC	2	12	145384	145395	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014034	ATCCGG	2	12	164587	164598	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014034	CTTTTG	2	12	165708	165719	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014034	GGGCGG	2	12	199899	199910	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014034	CTTTGC	2	12	199991	200002	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014034	CAGCTT	2	12	251227	251238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014034	GCAGAG	2	12	284361	284372	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014034	AAAAGC	2	12	320427	320438	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014034	AATCAA	2	12	422214	422225	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014034	GCCCCG	2	12	433597	433608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014034	GACATG	2	12	450481	450492	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014034	TCGCGC	2	12	454868	454879	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014034	GCTTTC	2	12	457918	457929	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014034	GCGGGG	2	12	466164	466175	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014034	CAAAGG	2	12	468942	468953	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014034	GCCGGG	2	12	483904	483915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014034	CAGGGA	2	12	483931	483942	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014034	CGGGGG	2	12	487144	487155	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014034	GGATCG	2	12	534146	534157	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014034	GCCCCG	2	12	567977	567988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_014034	CCGCGG	2	12	572332	572343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014034	GTCTCC	2	12	652900	652911	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014034	GACCGA	2	12	671411	671422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014034	TTTGGG	2	12	720846	720857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014034	TTCCGG	2	12	793420	793431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014034	GCTGCG	2	12	794302	794313	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014034	GCCAAA	2	12	800527	800538	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014034	GCCTTT	2	12	818992	819003	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014034	CTGCCG	2	12	821408	821419	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014034	TTGCCC	2	12	828100	828111	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014034	ATCCGG	2	12	831319	831330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014034	CGGGGC	2	12	936671	936682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014034	CGGGGA	2	12	978788	978799	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014034	TCGCGG	2	12	979268	979279	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014034	ATCCGG	2	12	1008318	1008329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014034	CTGCCT	2	12	1055047	1055058	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014034	GATTTT	2	12	1095706	1095717	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014034	CTGGGC	2	12	1103099	1103110	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014034	TGCGGC	2	12	1132266	1132277	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014034	CCGCAA	2	12	1149382	1149393	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014034	CGCGGG	2	12	1211129	1211140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014034	CCGCGC	2	12	1243826	1243837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014034	TTTGCC	2	12	1260677	1260688	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014034	GGGCCG	2	12	1305544	1305555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014034	CCGGCC	2	12	1327165	1327176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014034	TGCTCC	2	12	1333661	1333672	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014034	GCTATC	2	12	1343714	1343725	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014034	TTTGCC	2	12	1356430	1356441	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014034	GCGCCG	2	12	1370530	1370541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014034	GCGATG	2	12	1398255	1398266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014034	TTGCGG	2	12	1432585	1432596	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014034	TCCGCC	2	12	1433143	1433154	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014034	TGTGAT	2	12	1442874	1442885	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014034	GCCCGC	2	12	1444911	1444922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014034	AGGGGC	2	12	1444957	1444968	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014034	GCCTGC	2	12	1511510	1511521	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014034	ATCCGG	2	12	1518342	1518353	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014034	GCCCGA	2	12	1519600	1519611	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014034	GGCGAG	2	12	1519684	1519695	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014034	GAAGGG	2	12	1519761	1519772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014034	GCCAGC	2	12	1524392	1524403	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014034	GGCACG	2	12	1531158	1531169	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014034	CCGATG	2	12	1617308	1617319	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014034	AGGGGC	2	12	1722900	1722911	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014034	GCTGCC	2	12	1724032	1724043	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014034	GGCCGG	2	12	1746045	1746056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014034	CCGGCC	2	12	1780087	1780098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014034	GGCCCG	2	12	1784717	1784728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014034	TGCGAC	2	12	1813012	1813023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014034	GGCGCA	2	12	1844772	1844783	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014034	TCAAAG	2	12	1846823	1846834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014034	TCTGCC	2	12	1851700	1851711	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014034	GGCGCG	2	12	1853619	1853630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014034	AGCGTT	2	12	1854956	1854967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014034	CAGGCA	2	12	1964249	1964260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014034	TCTTTT	2	12	1964373	1964384	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014034	AGGCGG	2	12	1968130	1968141	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014034	CACGGG	2	12	1982910	1982921	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014034	CGGCCC	2	12	2003058	2003069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014034	TTCATG	2	12	2010190	2010201	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014034	CCCGGC	2	12	2144930	2144941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014034	CCGTCA	2	12	2155387	2155398	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014034	GTTCAG	2	12	2162276	2162287	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014034	TTGGGG	2	12	2208700	2208711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014034	GGCGCG	2	12	2225131	2225142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014034	AAGCGG	2	12	2231708	2231719	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014034	GTTAAG	2	12	2246962	2246973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014034	CACCGC	2	12	2256297	2256308	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014034	GGTTTT	2	12	2256603	2256614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014034	CGCAGG	2	12	2257142	2257153	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014034	GACGCC	2	12	2265654	2265665	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014034	TCACCG	2	12	2311795	2311806	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014034	GCGCGA	2	12	2328548	2328559	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014034	ACACAA	2	12	2337398	2337409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014034	GTTTTC	2	12	2343317	2343328	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014034	GTTTTC	2	12	2343332	2343343	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014034	GCGCCC	2	12	2348711	2348722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014034	GGCCGG	2	12	2375512	2375523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014034	CGCCCC	2	12	2414296	2414307	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
101	NC_014034	GCCCGC	2	12	2422163	2422174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_014034	CAAGGC	2	12	2545998	2546009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014034	CGCCTC	2	12	2546096	2546107	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014034	ACGCTT	2	12	2574426	2574437	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014034	CGGGTC	2	12	2576626	2576637	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014034	AAAGCC	2	12	2577202	2577213	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014034	CCCGGC	2	12	2577330	2577341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014034	GACCCG	2	12	2590289	2590300	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014034	GACAGC	2	12	2617754	2617765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014034	GCCCGT	2	12	2641033	2641044	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014034	TGCAGG	2	12	2671414	2671425	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014034	CCCCCT	2	12	2690326	2690337	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
113	NC_014034	CGATCC	2	12	2765402	2765413	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014034	GGAGCA	2	12	2810771	2810782	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014034	CGTCCC	2	12	2840378	2840389	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_014034	GGCCCG	2	12	2857777	2857788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014034	GGGCCG	2	12	2874628	2874639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014034	TGAACC	2	12	2889551	2889562	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014034	GCCAGC	2	12	2902047	2902058	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014034	GGCGCA	2	12	2931148	2931159	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014034	TCACCC	2	12	2940750	2940761	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014034	GCCCCG	2	12	2948557	2948568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014034	GAAACG	2	12	2958687	2958698	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014034	GACAGT	2	12	2970449	2970460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014034	GCCCCT	2	12	2976055	2976066	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014034	GAAGCG	2	12	2992232	2992243	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014034	GCGCAA	2	12	3004702	3004713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014034	TTTTGC	2	12	3008256	3008267	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014034	CGGGGC	2	12	3028895	3028906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014034	TGAACC	2	12	3040797	3040808	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014034	ATGAAA	2	12	3079845	3079856	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014034	GCAACG	2	12	3123375	3123386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014034	GCAACG	2	12	3129100	3129111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014034	CAAACG	2	12	3141957	3141968	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014034	TTGGTG	2	12	3169545	3169556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_014034	GCCCCG	2	12	3173054	3173065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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140	NC_014034	GCGCCC	2	12	3173581	3173592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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147	NC_014034	CCCCGC	2	12	3363112	3363123	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.