MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter capsulatus SB 1003 chromosome

Total Repeats: 4164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014034	TCGTT	2	10	463	472	0 %	60 %	20 %	20 %	294675558
2	NC_014034	CGGCG	2	10	1776	1785	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014034	CTGCG	2	10	2341	2350	0 %	20 %	40 %	40 %	294675559
4	NC_014034	GCGCC	2	10	3145	3154	0 %	0 %	40 %	60 %	294675560
5	NC_014034	CGATC	2	10	4903	4912	20 %	20 %	20 %	40 %	294675561
6	NC_014034	CGCGG	2	10	6439	6448	0 %	0 %	60 %	40 %	294675561
7	NC_014034	GACCG	2	10	6629	6638	20 %	0 %	40 %	40 %	294675562
8	NC_014034	ACGCG	2	10	8266	8275	20 %	0 %	40 %	40 %	294675564
9	NC_014034	CTGCG	2	10	10811	10820	0 %	20 %	40 %	40 %	294675565
10	NC_014034	TGGGC	2	10	11869	11878	0 %	20 %	60 %	20 %	294675566
11	NC_014034	CGCGG	2	10	12663	12672	0 %	0 %	60 %	40 %	294675567
12	NC_014034	GCGCC	2	10	13393	13402	0 %	0 %	40 %	60 %	294675568
13	NC_014034	AGCGC	2	10	13690	13699	20 %	0 %	40 %	40 %	294675568
14	NC_014034	CGCGG	2	10	13725	13734	0 %	0 %	60 %	40 %	294675568
15	NC_014034	CCGAG	2	10	16476	16485	20 %	0 %	40 %	40 %	294675571
16	NC_014034	TGCGC	2	10	21667	21676	0 %	20 %	40 %	40 %	294675575
17	NC_014034	GCCTC	2	10	24758	24767	0 %	20 %	20 %	60 %	294675577
18	NC_014034	GAACC	2	10	24997	25006	40 %	0 %	20 %	40 %	294675577
19	NC_014034	CGGCG	2	10	25164	25173	0 %	0 %	60 %	40 %	294675577
20	NC_014034	GGATC	2	10	26393	26402	20 %	20 %	40 %	20 %	294675578
21	NC_014034	TGCCC	2	10	26818	26827	0 %	20 %	20 %	60 %	294675579
22	NC_014034	TCTTT	2	10	28255	28264	0 %	80 %	0 %	20 %	294675580
23	NC_014034	GGGGC	2	10	28291	28300	0 %	0 %	80 %	20 %	294675580
24	NC_014034	GCGCT	2	10	28423	28432	0 %	20 %	40 %	40 %	294675580
25	NC_014034	GCCGC	2	10	28828	28837	0 %	0 %	40 %	60 %	294675581
26	NC_014034	GGCCG	2	10	30629	30638	0 %	0 %	60 %	40 %	294675582
27	NC_014034	CGGCC	2	10	31905	31914	0 %	0 %	40 %	60 %	294675583
28	NC_014034	GCCCG	2	10	32663	32672	0 %	0 %	40 %	60 %	294675583
29	NC_014034	CCGCG	2	10	32979	32988	0 %	0 %	40 %	60 %	294675583
30	NC_014034	CCGGG	2	10	35585	35594	0 %	0 %	60 %	40 %	294675584
31	NC_014034	CGGCG	2	10	36728	36737	0 %	0 %	60 %	40 %	294675586
32	NC_014034	TCCGA	2	10	38460	38469	20 %	20 %	20 %	40 %	294675588
33	NC_014034	GCATG	2	10	38827	38836	20 %	20 %	40 %	20 %	294675589
34	NC_014034	CCGGT	2	10	39367	39376	0 %	20 %	40 %	40 %	294675590
35	NC_014034	CCCGG	2	10	39628	39637	0 %	0 %	40 %	60 %	294675590
36	NC_014034	CGTCA	2	10	41700	41709	20 %	20 %	20 %	40 %	294675592
37	NC_014034	CCAGA	2	10	43729	43738	40 %	0 %	20 %	40 %	294675594
38	NC_014034	GATCA	2	10	43876	43885	40 %	20 %	20 %	20 %	294675594
39	NC_014034	GCCGT	2	10	46321	46330	0 %	20 %	40 %	40 %	294675595
40	NC_014034	CGCGG	2	10	50314	50323	0 %	0 %	60 %	40 %	294675597
41	NC_014034	GCCGG	2	10	52466	52475	0 %	0 %	60 %	40 %	294675599
42	NC_014034	GTTAA	2	10	52718	52727	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014034	GCGCA	2	10	53131	53140	20 %	0 %	40 %	40 %	294675600
44	NC_014034	TGCGC	2	10	54187	54196	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014034	TGACG	2	10	54544	54553	20 %	20 %	40 %	20 %	294675601
46	NC_014034	CGATC	2	10	58478	58487	20 %	20 %	20 %	40 %	294675606
47	NC_014034	GCGAT	2	10	60987	60996	20 %	20 %	40 %	20 %	294675609
48	NC_014034	GCGGT	2	10	61136	61145	0 %	20 %	60 %	20 %	294675609
49	NC_014034	CCGGT	2	10	63289	63298	0 %	20 %	40 %	40 %	294675611
50	NC_014034	CTGTC	2	10	63405	63414	0 %	40 %	20 %	40 %	294675611
51	NC_014034	CTGGC	2	10	63720	63729	0 %	20 %	40 %	40 %	294675611
52	NC_014034	CTCGC	2	10	65044	65053	0 %	20 %	20 %	60 %	294675613
53	NC_014034	GATGC	2	10	65281	65290	20 %	20 %	40 %	20 %	294675613
54	NC_014034	TCGGC	2	10	65594	65603	0 %	20 %	40 %	40 %	294675613
55	NC_014034	GCCGA	2	10	65845	65854	20 %	0 %	40 %	40 %	294675613
56	NC_014034	CGATT	2	10	67894	67903	20 %	40 %	20 %	20 %	294675615
57	NC_014034	CGATC	2	10	68077	68086	20 %	20 %	20 %	40 %	294675615
58	NC_014034	CGCGG	2	10	68584	68593	0 %	0 %	60 %	40 %	294675615
59	NC_014034	GTTGC	2	10	73050	73059	0 %	40 %	40 %	20 %	294675620
60	NC_014034	GCCTT	2	10	73724	73733	0 %	40 %	20 %	40 %	294675621
61	NC_014034	CGCGG	2	10	74561	74570	0 %	0 %	60 %	40 %	294675621
62	NC_014034	ATCGA	2	10	74720	74729	40 %	20 %	20 %	20 %	294675622
63	NC_014034	CCGCG	2	10	75052	75061	0 %	0 %	40 %	60 %	294675622
64	NC_014034	CCGGG	2	10	75738	75747	0 %	0 %	60 %	40 %	294675622
65	NC_014034	CCAGG	2	10	76508	76517	20 %	0 %	40 %	40 %	294675623
66	NC_014034	GGAAA	2	10	76559	76568	60 %	0 %	40 %	0 %	294675623
67	NC_014034	GAAAA	2	10	76629	76638	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014034	GCATC	2	10	79049	79058	20 %	20 %	20 %	40 %	294675627
69	NC_014034	CTGGG	2	10	79302	79311	0 %	20 %	60 %	20 %	294675627
70	NC_014034	CCCCG	2	10	79740	79749	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
71	NC_014034	TGCCC	2	10	80673	80682	0 %	20 %	20 %	60 %	294675628
72	NC_014034	TGACC	2	10	81143	81152	20 %	20 %	20 %	40 %	294675629
73	NC_014034	GGTCA	2	10	81495	81504	20 %	20 %	40 %	20 %	294675629
74	NC_014034	GGCGG	2	10	81737	81746	0 %	0 %	80 %	20 %	294675629
75	NC_014034	CCGCG	2	10	82456	82465	0 %	0 %	40 %	60 %	294675630
76	NC_014034	GGCGT	2	10	84333	84342	0 %	20 %	60 %	20 %	294675632
77	NC_014034	CGTCA	2	10	84635	84644	20 %	20 %	20 %	40 %	294675632
78	NC_014034	TGCCG	2	10	87105	87114	0 %	20 %	40 %	40 %	294675634
79	NC_014034	CCGCG	2	10	87348	87357	0 %	0 %	40 %	60 %	294675634
80	NC_014034	GACAC	2	10	87478	87487	40 %	0 %	20 %	40 %	294675634
81	NC_014034	CGCAG	2	10	88029	88038	20 %	0 %	40 %	40 %	294675635
82	NC_014034	TGAGA	2	10	88772	88781	40 %	20 %	40 %	0 %	294675636
83	NC_014034	CCGCA	2	10	91831	91840	20 %	0 %	20 %	60 %	294675640
84	NC_014034	CCCCG	2	10	93242	93251	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
85	NC_014034	CCCTT	2	10	93306	93315	0 %	40 %	0 %	60 %	294675642
86	NC_014034	GGGCA	2	10	94183	94192	20 %	0 %	60 %	20 %	294675642
87	NC_014034	GCGCT	2	10	94231	94240	0 %	20 %	40 %	40 %	294675642
88	NC_014034	AAGGG	2	10	96150	96159	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014034	TGCCG	2	10	96231	96240	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014034	GCGCG	2	10	96427	96436	0 %	0 %	60 %	40 %	294675645
91	NC_014034	TCGGC	2	10	97031	97040	0 %	20 %	40 %	40 %	294675646
92	NC_014034	CCGGG	2	10	97803	97812	0 %	0 %	60 %	40 %	294675647
93	NC_014034	GCGCG	2	10	100788	100797	0 %	0 %	60 %	40 %	294675651
94	NC_014034	CGGCG	2	10	101937	101946	0 %	0 %	60 %	40 %	294675652
95	NC_014034	AGGTC	2	10	101996	102005	20 %	20 %	40 %	20 %	294675652
96	NC_014034	GCCCC	2	10	102257	102266	0 %	0 %	20 %	80 %	294675652
97	NC_014034	CGCGG	2	10	102565	102574	0 %	0 %	60 %	40 %	294675652
98	NC_014034	GCCGG	2	10	103940	103949	0 %	0 %	60 %	40 %	294675654
99	NC_014034	GGTCA	2	10	105811	105820	20 %	20 %	40 %	20 %	294675655
100	NC_014034	CCGCC	2	10	105937	105946	0 %	0 %	20 %	80 %	294675655
101	NC_014034	GTCGT	2	10	106442	106451	0 %	40 %	40 %	20 %	294675655
102	NC_014034	CCGGG	2	10	107061	107070	0 %	0 %	60 %	40 %	294675656
103	NC_014034	GCCGC	2	10	109164	109173	0 %	0 %	40 %	60 %	294675659
104	NC_014034	GATCG	2	10	110436	110445	20 %	20 %	40 %	20 %	294675660
105	NC_014034	ACCGG	2	10	111343	111352	20 %	0 %	40 %	40 %	294675660
106	NC_014034	GCCGC	2	10	111647	111656	0 %	0 %	40 %	60 %	294675661
107	NC_014034	CCCCG	2	10	112789	112798	0 %	0 %	20 %	80 %	294675662
108	NC_014034	GGGCA	2	10	113289	113298	20 %	0 %	60 %	20 %	294675663
109	NC_014034	CCGGA	2	10	113413	113422	20 %	0 %	40 %	40 %	294675663
110	NC_014034	CGGCG	2	10	114493	114502	0 %	0 %	60 %	40 %	294675664
111	NC_014034	ATCGC	2	10	115028	115037	20 %	20 %	20 %	40 %	294675665
112	NC_014034	CGGCG	2	10	115438	115447	0 %	0 %	60 %	40 %	294675665
113	NC_014034	CCGGC	2	10	116199	116208	0 %	0 %	40 %	60 %	294675667
114	NC_014034	GCCGC	2	10	116561	116570	0 %	0 %	40 %	60 %	294675667
115	NC_014034	CCCGG	2	10	116586	116595	0 %	0 %	40 %	60 %	294675667
116	NC_014034	GCGGT	2	10	116802	116811	0 %	20 %	60 %	20 %	294675667
117	NC_014034	CCGCG	2	10	120268	120277	0 %	0 %	40 %	60 %	294675670
118	NC_014034	CGGCG	2	10	121935	121944	0 %	0 %	60 %	40 %	294675672
119	NC_014034	CCGTT	2	10	123620	123629	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014034	ATCAG	2	10	123810	123819	40 %	20 %	20 %	20 %	294675675
121	NC_014034	GATCT	2	10	124698	124707	20 %	40 %	20 %	20 %	294675676
122	NC_014034	AGGGC	2	10	125681	125690	20 %	0 %	60 %	20 %	294675677
123	NC_014034	CTCAT	2	10	126277	126286	20 %	40 %	0 %	40 %	294675677
124	NC_014034	CAGAT	2	10	126767	126776	40 %	20 %	20 %	20 %	294675678
125	NC_014034	TCGGC	2	10	127098	127107	0 %	20 %	40 %	40 %	294675678
126	NC_014034	CCGCC	2	10	127971	127980	0 %	0 %	20 %	80 %	294675678
127	NC_014034	GGTTC	2	10	128070	128079	0 %	40 %	40 %	20 %	294675679
128	NC_014034	CGTCC	2	10	129001	129010	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_014034	TCGCC	2	10	129361	129370	0 %	20 %	20 %	60 %	294675680
130	NC_014034	GCGCA	2	10	130085	130094	20 %	0 %	40 %	40 %	294675680
131	NC_014034	GCCCA	2	10	130257	130266	20 %	0 %	20 %	60 %	294675681
132	NC_014034	CGCAG	2	10	132624	132633	20 %	0 %	40 %	40 %	294675683
133	NC_014034	CGCAA	2	10	132959	132968	40 %	0 %	20 %	40 %	294675683
134	NC_014034	AACGG	2	10	133896	133905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014034	GCTGG	2	10	134421	134430	0 %	20 %	60 %	20 %	294675685
136	NC_014034	CGGCG	2	10	135289	135298	0 %	0 %	60 %	40 %	294675686
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138	NC_014034	GCCGC	2	10	138665	138674	0 %	0 %	40 %	60 %	294675688
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165	NC_014034	TTGAT	2	10	165255	165264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014034	ATCCC	2	10	165441	165450	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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250	NC_014034	CCTTT	2	10	270200	270209	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
251	NC_014034	ATCGC	2	10	270278	270287	20 %	20 %	20 %	40 %	294675791
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