MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter capsulatus SB 1003 chromosome

Total Repeats: 58587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014034	CGA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675558
2	NC_014034	TCG	3	9	727	735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675558
3	NC_014034	GCC	3	9	759	767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675558
4	NC_014034	CGC	2	6	768	773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675558
5	NC_014034	GGC	2	6	819	824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675558
6	NC_014034	GAA	2	6	1047	1052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294675558
7	NC_014034	TTC	2	6	1053	1058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294675558
8	NC_014034	CCG	2	6	1105	1110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675558
9	NC_014034	GTC	2	6	1176	1181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675558
10	NC_014034	GCC	2	6	1245	1250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675558
11	NC_014034	CAC	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294675558
12	NC_014034	CCG	2	6	1433	1438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675558
13	NC_014034	GAG	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294675558
14	NC_014034	ACC	2	6	1572	1577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294675558
15	NC_014034	GCG	2	6	1598	1603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675558
16	NC_014034	ACG	2	6	1623	1628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675558
17	NC_014034	CGA	2	6	1652	1657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675558
18	NC_014034	TGA	2	6	1660	1665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294675558
19	NC_014034	GCT	2	6	1697	1702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675558
20	NC_014034	CGC	2	6	1848	1853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675559
21	NC_014034	GCG	2	6	1893	1898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675559
22	NC_014034	GGT	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675559
23	NC_014034	CGG	2	6	2036	2041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675559
24	NC_014034	TGC	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675559
25	NC_014034	GAC	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675559
26	NC_014034	GCG	3	9	2104	2112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675559
27	NC_014034	GGC	2	6	2114	2119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675559
28	NC_014034	CGC	2	6	2214	2219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675559
29	NC_014034	GAG	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294675559
30	NC_014034	TGC	2	6	2390	2395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675559
31	NC_014034	GCT	2	6	2460	2465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675559
32	NC_014034	CGG	2	6	2605	2610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675559
33	NC_014034	CGA	2	6	2700	2705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675559
34	NC_014034	CGA	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675559
35	NC_014034	CTG	2	6	2815	2820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675559
36	NC_014034	CTC	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294675559
37	NC_014034	CGG	2	6	2912	2917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675559
38	NC_014034	TGC	2	6	2994	2999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675560
39	NC_014034	GAG	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294675560
40	NC_014034	CGG	2	6	3173	3178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675560
41	NC_014034	GCC	2	6	3281	3286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675560
42	NC_014034	GTT	2	6	3307	3312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294675560
43	NC_014034	GGC	2	6	3358	3363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675560
44	NC_014034	GCG	3	9	3370	3378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675560
45	NC_014034	GCC	2	6	3491	3496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675560
46	NC_014034	TGA	2	6	3540	3545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294675560
47	NC_014034	CGG	2	6	3554	3559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675560
48	NC_014034	GCG	2	6	3596	3601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675560
49	NC_014034	CGG	2	6	3612	3617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675560
50	NC_014034	GCG	2	6	3676	3681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675560
51	NC_014034	GGC	2	6	3691	3696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675560
52	NC_014034	CTG	2	6	3812	3817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675560
53	NC_014034	TGC	2	6	3852	3857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675560
54	NC_014034	CGC	2	6	3871	3876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675560
55	NC_014034	GCG	2	6	3892	3897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675560
56	NC_014034	GGC	2	6	3898	3903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675560
57	NC_014034	TGA	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294675560
58	NC_014034	TGG	2	6	4032	4037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675560
59	NC_014034	GCC	2	6	4041	4046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675560
60	NC_014034	GAA	2	6	4147	4152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294675561
61	NC_014034	CGA	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675561
62	NC_014034	GTC	2	6	4277	4282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675561
63	NC_014034	CGA	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675561
64	NC_014034	CGG	2	6	4416	4421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675561
65	NC_014034	TCA	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675561
66	NC_014034	CAA	2	6	4462	4467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294675561
67	NC_014034	CGA	2	6	4471	4476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675561
68	NC_014034	GGC	2	6	4478	4483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675561
69	NC_014034	GGT	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675561
70	NC_014034	ACC	2	6	4691	4696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294675561
71	NC_014034	GCG	2	6	4848	4853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675561
72	NC_014034	TGG	2	6	4958	4963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675561
73	NC_014034	TGC	2	6	4986	4991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675561
74	NC_014034	CAA	2	6	4999	5004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294675561
75	NC_014034	GGC	2	6	5021	5026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675561
76	NC_014034	TCC	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294675561
77	NC_014034	GAG	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294675561
78	NC_014034	TCG	2	6	5301	5306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675561
79	NC_014034	ATC	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675561
80	NC_014034	GCC	2	6	5339	5344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675561
81	NC_014034	GAA	2	6	5503	5508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294675561
82	NC_014034	TGC	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675561
83	NC_014034	CGA	2	6	5629	5634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675561
84	NC_014034	TCA	2	6	5670	5675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675561
85	NC_014034	GCT	2	6	5713	5718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675561
86	NC_014034	CTT	3	9	5725	5733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294675561
87	NC_014034	GCC	2	6	5782	5787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675561
88	NC_014034	GCC	2	6	5837	5842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675561
89	NC_014034	CAT	2	6	5908	5913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675561
90	NC_014034	GCG	2	6	5956	5961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675561
91	NC_014034	GGC	2	6	6010	6015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675561
92	NC_014034	GCT	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675561
93	NC_014034	GGC	2	6	6129	6134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675561
94	NC_014034	GCG	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675561
95	NC_014034	TGC	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675561
96	NC_014034	GCG	2	6	6229	6234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675561
97	NC_014034	CAC	2	6	6247	6252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294675561
98	NC_014034	AGG	2	6	6351	6356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294675561
99	NC_014034	TCT	2	6	6495	6500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294675561
100	NC_014034	TGG	2	6	6519	6524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675561
101	NC_014034	CGG	2	6	6649	6654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675562
102	NC_014034	GTC	2	6	6779	6784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675562
103	NC_014034	CCG	2	6	6812	6817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675562
104	NC_014034	CCG	2	6	6867	6872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675562
105	NC_014034	ACG	2	6	6975	6980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675562
106	NC_014034	GCG	2	6	7047	7052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675562
107	NC_014034	CAT	2	6	7060	7065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675562
108	NC_014034	GCG	2	6	7093	7098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675562
109	NC_014034	CTT	2	6	7117	7122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294675562
110	NC_014034	CGC	2	6	7144	7149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675562
111	NC_014034	TCA	3	9	7286	7294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675563
112	NC_014034	AAG	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294675563
113	NC_014034	GTC	2	6	7306	7311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675563
114	NC_014034	GCG	2	6	7316	7321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675563
115	NC_014034	CAC	2	6	7324	7329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294675563
116	NC_014034	ATG	2	6	7372	7377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294675563
117	NC_014034	CTT	2	6	7380	7385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294675563
118	NC_014034	CTG	2	6	7387	7392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675563
119	NC_014034	GCT	2	6	7398	7403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675563
120	NC_014034	CGA	2	6	7454	7459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675563
121	NC_014034	GGC	2	6	7483	7488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675563
122	NC_014034	CGG	2	6	7500	7505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675563
123	NC_014034	TCT	2	6	7514	7519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294675563
124	NC_014034	GCG	2	6	7598	7603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675563
125	NC_014034	AGG	2	6	7610	7615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294675563
126	NC_014034	TCG	2	6	7754	7759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675563
127	NC_014034	TTC	2	6	7762	7767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294675563
128	NC_014034	CCG	2	6	7802	7807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675563
129	NC_014034	GAA	2	6	7866	7871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294675563
130	NC_014034	TGC	2	6	7913	7918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675563
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132	NC_014034	CAA	2	6	8067	8072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294675563
133	NC_014034	TTG	2	6	8089	8094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294675563
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256	NC_014034	CGC	3	9	15112	15120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675569
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259	NC_014034	CAT	2	6	15240	15245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675570
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263	NC_014034	CGC	2	6	15366	15371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675570
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288	NC_014034	GCC	2	6	17134	17139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675571
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