MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 chromosome

Total Repeats: 2705

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014032	CCGGC	2	10	534	543	0 %	0 %	40 %	60 %	294505817
2	NC_014032	GCCCC	2	10	5404	5413	0 %	0 %	20 %	80 %	294505821
3	NC_014032	GTTCG	2	10	5432	5441	0 %	40 %	40 %	20 %	294505821
4	NC_014032	CCCAC	2	10	5958	5967	20 %	0 %	0 %	80 %	294505821
5	NC_014032	CTCGA	2	10	6949	6958	20 %	20 %	20 %	40 %	294505822
6	NC_014032	GGCCC	2	10	7998	8007	0 %	0 %	40 %	60 %	294505823
7	NC_014032	TCGCG	2	10	9547	9556	0 %	20 %	40 %	40 %	294505826
8	NC_014032	CTCGC	2	10	9949	9958	0 %	20 %	20 %	60 %	294505826
9	NC_014032	CGACG	2	10	16199	16208	20 %	0 %	40 %	40 %	294505831
10	NC_014032	TCGCT	2	10	18764	18773	0 %	40 %	20 %	40 %	294505834
11	NC_014032	GTCCT	2	10	18949	18958	0 %	40 %	20 %	40 %	294505834
12	NC_014032	TCGTT	2	10	21073	21082	0 %	60 %	20 %	20 %	294505835
13	NC_014032	GTTGA	2	10	24057	24066	20 %	40 %	40 %	0 %	294505840
14	NC_014032	GCCCG	2	10	26807	26816	0 %	0 %	40 %	60 %	294505841
15	NC_014032	CGCGC	2	10	27837	27846	0 %	0 %	40 %	60 %	294505842
16	NC_014032	GCCCG	2	10	27959	27968	0 %	0 %	40 %	60 %	294505842
17	NC_014032	GAGCG	2	10	29473	29482	20 %	0 %	60 %	20 %	294505844
18	NC_014032	GGCAA	2	10	38349	38358	40 %	0 %	40 %	20 %	294505855
19	NC_014032	CACCT	2	10	39162	39171	20 %	20 %	0 %	60 %	294505855
20	NC_014032	GCCGA	2	10	39977	39986	20 %	0 %	40 %	40 %	294505856
21	NC_014032	CGAAG	2	10	43670	43679	40 %	0 %	40 %	20 %	294505859
22	NC_014032	CGCCC	2	10	45381	45390	0 %	0 %	20 %	80 %	294505862
23	NC_014032	GCCCG	2	10	46109	46118	0 %	0 %	40 %	60 %	294505863
24	NC_014032	CGTTC	2	10	46456	46465	0 %	40 %	20 %	40 %	294505864
25	NC_014032	GCGCG	2	10	48465	48474	0 %	0 %	60 %	40 %	294505865
26	NC_014032	GGCCG	2	10	48989	48998	0 %	0 %	60 %	40 %	294505865
27	NC_014032	CCAGC	2	10	49910	49919	20 %	0 %	20 %	60 %	294505866
28	NC_014032	TCCGC	2	10	50697	50706	0 %	20 %	20 %	60 %	294505868
29	NC_014032	CGCAG	2	10	51020	51029	20 %	0 %	40 %	40 %	294505868
30	NC_014032	AGACG	2	10	53305	53314	40 %	0 %	40 %	20 %	294505869
31	NC_014032	GCGCC	2	10	53584	53593	0 %	0 %	40 %	60 %	294505869
32	NC_014032	TACGC	2	10	54962	54971	20 %	20 %	20 %	40 %	294505870
33	NC_014032	CGGGG	2	10	55685	55694	0 %	0 %	80 %	20 %	294505871
34	NC_014032	CCGGC	2	10	58896	58905	0 %	0 %	40 %	60 %	294505874
35	NC_014032	GCCTC	2	10	59252	59261	0 %	20 %	20 %	60 %	294505874
36	NC_014032	TCGCG	2	10	61167	61176	0 %	20 %	40 %	40 %	294505876
37	NC_014032	TCTCG	2	10	61444	61453	0 %	40 %	20 %	40 %	294505876
38	NC_014032	CTCGT	2	10	62834	62843	0 %	40 %	20 %	40 %	294505877
39	NC_014032	TCGCG	2	10	62850	62859	0 %	20 %	40 %	40 %	294505877
40	NC_014032	TTTTC	2	10	63594	63603	0 %	80 %	0 %	20 %	294505877
41	NC_014032	TCGCG	2	10	67286	67295	0 %	20 %	40 %	40 %	294505880
42	NC_014032	ACGAG	2	10	69101	69110	40 %	0 %	40 %	20 %	294505881
43	NC_014032	CCGCC	2	10	72241	72250	0 %	0 %	20 %	80 %	294505883
44	NC_014032	CGACG	2	10	72431	72440	20 %	0 %	40 %	40 %	294505883
45	NC_014032	GCACC	2	10	72593	72602	20 %	0 %	20 %	60 %	294505883
46	NC_014032	CGGCG	2	10	72908	72917	0 %	0 %	60 %	40 %	294505883
47	NC_014032	GGCCA	2	10	76517	76526	20 %	0 %	40 %	40 %	294505886
48	NC_014032	GCGCC	2	10	77176	77185	0 %	0 %	40 %	60 %	294505886
49	NC_014032	GAAGG	2	10	81346	81355	40 %	0 %	60 %	0 %	294505891
50	NC_014032	GAATT	2	10	81778	81787	40 %	40 %	20 %	0 %	294505891
51	NC_014032	GCTCC	2	10	82744	82753	0 %	20 %	20 %	60 %	294505893
52	NC_014032	GCCGT	2	10	83170	83179	0 %	20 %	40 %	40 %	294505894
53	NC_014032	CCGGC	2	10	83813	83822	0 %	0 %	40 %	60 %	294505894
54	NC_014032	GTTTC	2	10	85294	85303	0 %	60 %	20 %	20 %	294505895
55	NC_014032	GGACG	2	10	86263	86272	20 %	0 %	60 %	20 %	294505895
56	NC_014032	CTCCG	2	10	86695	86704	0 %	20 %	20 %	60 %	294505895
57	NC_014032	ATCGA	2	10	87240	87249	40 %	20 %	20 %	20 %	294505895
58	NC_014032	GGCGC	2	10	88160	88169	0 %	0 %	60 %	40 %	294505896
59	NC_014032	GGGGC	2	10	88477	88486	0 %	0 %	80 %	20 %	294505896
60	NC_014032	GGGAA	2	10	88490	88499	40 %	0 %	60 %	0 %	294505896
61	NC_014032	GTGGG	2	10	88624	88633	0 %	20 %	80 %	0 %	294505897
62	NC_014032	CTCGT	2	10	89254	89263	0 %	40 %	20 %	40 %	294505897
63	NC_014032	CGGCG	2	10	89777	89786	0 %	0 %	60 %	40 %	294505897
64	NC_014032	GGGAC	2	10	90270	90279	20 %	0 %	60 %	20 %	294505898
65	NC_014032	AGCTG	2	10	90301	90310	20 %	20 %	40 %	20 %	294505898
66	NC_014032	CGGCG	2	10	92218	92227	0 %	0 %	60 %	40 %	294505899
67	NC_014032	CGGTC	2	10	92738	92747	0 %	20 %	40 %	40 %	294505900
68	NC_014032	GTGGA	2	10	92902	92911	20 %	20 %	60 %	0 %	294505900
69	NC_014032	TCGGG	2	10	94301	94310	0 %	20 %	60 %	20 %	294505900
70	NC_014032	CGGTG	2	10	95906	95915	0 %	20 %	60 %	20 %	294505902
71	NC_014032	CTTCG	2	10	97132	97141	0 %	40 %	20 %	40 %	294505903
72	NC_014032	CGGCA	2	10	98068	98077	20 %	0 %	40 %	40 %	294505905
73	NC_014032	GGGCG	2	10	100071	100080	0 %	0 %	80 %	20 %	294505905
74	NC_014032	CGGGG	2	10	101521	101530	0 %	0 %	80 %	20 %	294505906
75	NC_014032	GCTCA	2	10	105884	105893	20 %	20 %	20 %	40 %	294505908
76	NC_014032	GAGCG	2	10	106874	106883	20 %	0 %	60 %	20 %	294505908
77	NC_014032	ACCGA	2	10	107447	107456	40 %	0 %	20 %	40 %	294505908
78	NC_014032	CGCCC	2	10	109195	109204	0 %	0 %	20 %	80 %	294505909
79	NC_014032	CAGTG	2	10	111290	111299	20 %	20 %	40 %	20 %	294505910
80	NC_014032	GCCGG	2	10	112755	112764	0 %	0 %	60 %	40 %	294505911
81	NC_014032	GGACG	2	10	116909	116918	20 %	0 %	60 %	20 %	294505914
82	NC_014032	CGGGC	2	10	117105	117114	0 %	0 %	60 %	40 %	294505914
83	NC_014032	CCCAC	2	10	118313	118322	20 %	0 %	0 %	80 %	294505915
84	NC_014032	ACGCC	2	10	118397	118406	20 %	0 %	20 %	60 %	294505915
85	NC_014032	CGGAG	2	10	124664	124673	20 %	0 %	60 %	20 %	294505916
86	NC_014032	CTTTC	2	10	124809	124818	0 %	60 %	0 %	40 %	294505917
87	NC_014032	AAAAC	2	10	125321	125330	80 %	0 %	0 %	20 %	294505918
88	NC_014032	TGGCG	2	10	126170	126179	0 %	20 %	60 %	20 %	294505918
89	NC_014032	GGCAG	2	10	126184	126193	20 %	0 %	60 %	20 %	294505918
90	NC_014032	GGCGC	2	10	126973	126982	0 %	0 %	60 %	40 %	294505919
91	NC_014032	CTCTC	2	10	127438	127447	0 %	40 %	0 %	60 %	294505920
92	NC_014032	CGGTC	2	10	128605	128614	0 %	20 %	40 %	40 %	294505922
93	NC_014032	ACAGA	2	10	128746	128755	60 %	0 %	20 %	20 %	294505922
94	NC_014032	GCCGG	2	10	129230	129239	0 %	0 %	60 %	40 %	294505922
95	NC_014032	CGACG	2	10	129530	129539	20 %	0 %	40 %	40 %	294505922
96	NC_014032	GCGCC	2	10	134038	134047	0 %	0 %	40 %	60 %	294505927
97	NC_014032	CGGGC	2	10	134645	134654	0 %	0 %	60 %	40 %	294505927
98	NC_014032	AACGG	2	10	134780	134789	40 %	0 %	40 %	20 %	294505927
99	NC_014032	CGGGG	2	10	134928	134937	0 %	0 %	80 %	20 %	294505927
100	NC_014032	CGGCC	2	10	135571	135580	0 %	0 %	40 %	60 %	294505927
101	NC_014032	CGGGA	2	10	136206	136215	20 %	0 %	60 %	20 %	294505928
102	NC_014032	CCGCT	2	10	138195	138204	0 %	20 %	20 %	60 %	294505928
103	NC_014032	CCGGG	2	10	138940	138949	0 %	0 %	60 %	40 %	294505928
104	NC_014032	CGGCG	2	10	139247	139256	0 %	0 %	60 %	40 %	294505928
105	NC_014032	AAGAC	2	10	140533	140542	60 %	0 %	20 %	20 %	294505929
106	NC_014032	GAGTG	2	10	141701	141710	20 %	20 %	60 %	0 %	294505930
107	NC_014032	CGGGC	2	10	142071	142080	0 %	0 %	60 %	40 %	294505930
108	NC_014032	GCGGG	2	10	143144	143153	0 %	0 %	80 %	20 %	294505932
109	NC_014032	CGCGA	2	10	143546	143555	20 %	0 %	40 %	40 %	294505932
110	NC_014032	GAGGG	2	10	143742	143751	20 %	0 %	80 %	0 %	294505932
111	NC_014032	TGACG	2	10	146482	146491	20 %	20 %	40 %	20 %	294505936
112	NC_014032	GGGAC	2	10	147336	147345	20 %	0 %	60 %	20 %	294505936
113	NC_014032	CGGGA	2	10	148341	148350	20 %	0 %	60 %	20 %	294505936
114	NC_014032	CGGAG	2	10	149042	149051	20 %	0 %	60 %	20 %	294505936
115	NC_014032	TCGGC	2	10	149808	149817	0 %	20 %	40 %	40 %	294505936
116	NC_014032	GCCCG	2	10	150919	150928	0 %	0 %	40 %	60 %	294505936
117	NC_014032	TCGCC	2	10	152560	152569	0 %	20 %	20 %	60 %	294505936
118	NC_014032	TCGGT	2	10	153985	153994	0 %	40 %	40 %	20 %	294505938
119	NC_014032	ACGCG	2	10	159390	159399	20 %	0 %	40 %	40 %	294505943
120	NC_014032	CGATT	2	10	159884	159893	20 %	40 %	20 %	20 %	294505944
121	NC_014032	GCAGT	2	10	163768	163777	20 %	20 %	40 %	20 %	294505945
122	NC_014032	CGGAT	2	10	165006	165015	20 %	20 %	40 %	20 %	294505947
123	NC_014032	CGTCC	2	10	165098	165107	0 %	20 %	20 %	60 %	294505947
124	NC_014032	GACCG	2	10	165153	165162	20 %	0 %	40 %	40 %	294505947
125	NC_014032	CGTCT	2	10	165836	165845	0 %	40 %	20 %	40 %	294505948
126	NC_014032	CGACA	2	10	166213	166222	40 %	0 %	20 %	40 %	294505948
127	NC_014032	GGACG	2	10	167337	167346	20 %	0 %	60 %	20 %	294505948
128	NC_014032	GACCT	2	10	168119	168128	20 %	20 %	20 %	40 %	294505948
129	NC_014032	CGGAA	2	10	171324	171333	40 %	0 %	40 %	20 %	294505950
130	NC_014032	GATCG	2	10	171342	171351	20 %	20 %	40 %	20 %	294505950
131	NC_014032	ATTGA	2	10	176374	176383	40 %	40 %	20 %	0 %	294505954
132	NC_014032	GGACG	2	10	176831	176840	20 %	0 %	60 %	20 %	294505954
133	NC_014032	CTTCG	2	10	177793	177802	0 %	40 %	20 %	40 %	294505955
134	NC_014032	TCGAG	2	10	177978	177987	20 %	20 %	40 %	20 %	294505955
135	NC_014032	CGGGA	2	10	181378	181387	20 %	0 %	60 %	20 %	294505962
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248	NC_014032	GGGCA	2	10	335524	335533	20 %	0 %	60 %	20 %	294506096
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254	NC_014032	CCGTC	2	10	342154	342163	0 %	20 %	20 %	60 %	294506100
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261	NC_014032	AGCGC	2	10	355122	355131	20 %	0 %	40 %	40 %	294506111
262	NC_014032	GCTGG	2	10	355573	355582	0 %	20 %	60 %	20 %	294506111
263	NC_014032	GAGCC	2	10	358934	358943	20 %	0 %	40 %	40 %	294506113
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382	NC_014032	GCCGC	2	10	509714	509723	0 %	0 %	40 %	60 %	294506240
383	NC_014032	GGCCG	2	10	509974	509983	0 %	0 %	60 %	40 %	294506240
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385	NC_014032	GCCGC	2	10	511420	511429	0 %	0 %	40 %	60 %	294506242
386	NC_014032	GCCGT	2	10	511560	511569	0 %	20 %	40 %	40 %	294506242
387	NC_014032	CACCG	2	10	514470	514479	20 %	0 %	20 %	60 %	294506243
388	NC_014032	TCGGC	2	10	514648	514657	0 %	20 %	40 %	40 %	294506243
389	NC_014032	GCCTC	2	10	514887	514896	0 %	20 %	20 %	60 %	294506243
390	NC_014032	CCGTC	2	10	515479	515488	0 %	20 %	20 %	60 %	294506243
391	NC_014032	GGGCG	2	10	515498	515507	0 %	0 %	80 %	20 %	294506243
392	NC_014032	GGCGC	2	10	517490	517499	0 %	0 %	60 %	40 %	294506246
393	NC_014032	CGGCG	2	10	517789	517798	0 %	0 %	60 %	40 %	294506246
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