MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM600

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014031	CATAAA	2	12	42	53	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294505705
2	NC_014031	ACAGAA	2	12	2910	2921	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014031	AGTACA	2	12	3121	3132	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014031	TATAAA	2	12	5720	5731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294505709
5	NC_014031	TTAACA	2	12	5792	5803	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294505709
6	NC_014031	GTTAGG	2	12	7285	7296	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294505712
7	NC_014031	ATACTA	2	12	9893	9904	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294505714
8	NC_014031	ATTGAA	2	12	10171	10182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294505714
9	NC_014031	AACATT	2	12	12561	12572	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294505717
10	NC_014031	TTTACA	2	12	13548	13559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294505718
11	NC_014031	TCCTAA	2	12	14335	14346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505719
12	NC_014031	ACTGCT	2	12	16869	16880	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294505721
13	NC_014031	AGAAAT	2	12	18145	18156	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294505723
14	NC_014031	AATATC	2	12	18465	18476	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294505723
15	NC_014031	GGAGAA	2	12	18782	18793	50 %	0 %	50 %	0 %	294505723
16	NC_014031	AAATTT	2	12	20482	20493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014031	ATGATT	2	12	21180	21191	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294505725
18	NC_014031	GCTACT	2	12	21959	21970	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294505728
19	NC_014031	ACTACA	2	12	21983	21994	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294505728
20	NC_014031	CTAAGA	2	12	22022	22033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294505728
21	NC_014031	CATCTG	2	12	25013	25024	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294505732
22	NC_014031	TGATCA	2	12	25871	25882	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294505733
23	NC_014031	GGTATA	2	12	28443	28454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505736
24	NC_014031	TGGTGA	2	12	30867	30878	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294505738
25	NC_014031	ACCTGT	2	12	35825	35836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294505743
26	NC_014031	TATCCA	2	12	36383	36394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505744
27	NC_014031	GGTAAA	2	12	36719	36730	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014031	ATTTTA	2	12	45299	45310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014031	TTTATT	2	12	45319	45330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014031	TAAGTT	2	12	46047	46058	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014031	ATTAAA	2	12	48161	48172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014031	TTCTTT	2	12	50859	50870	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294505761
33	NC_014031	TGTTCT	2	12	51016	51027	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294505761
34	NC_014031	AAAGTA	2	12	51882	51893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014031	TTAAAT	2	12	52644	52655	50 %	50 %	0 %	0 %	294505762
36	NC_014031	ATGCAT	2	12	54872	54883	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294505764
37	NC_014031	AAAGGG	2	12	55744	55755	50 %	0 %	50 %	0 %	294505764
38	NC_014031	TCTTGT	2	12	57988	57999	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294505766
39	NC_014031	TACTTT	2	12	61887	61898	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014031	TAATTC	2	12	62555	62566	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294505771
41	NC_014031	TCTACA	2	12	65444	65455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014031	GAACAA	2	12	68568	68579	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294505779
43	NC_014031	GTTTTT	2	12	72329	72340	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	294505784
44	NC_014031	ATTTCA	2	12	73066	73077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294505785
45	NC_014031	AGCTAA	2	12	74689	74700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014031	TTTTAC	2	12	76566	76577	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014031	ATTTCA	2	12	76959	76970	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014031	ATTAAT	2	12	87858	87869	50 %	50 %	0 %	0 %	294505801
49	NC_014031	AATAAA	2	12	92584	92595	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294505806

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.