MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM600

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014031	TACCT	2	10	1738	1747	20 %	40 %	0 %	40 %	294505706
2	NC_014031	AAGAA	2	10	3822	3831	80 %	0 %	20 %	0 %	294505707
3	NC_014031	TTGAA	2	10	5491	5500	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014031	CTAAA	2	10	5509	5518	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014031	TTTAT	2	10	5905	5914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014031	TAGAA	2	10	8888	8897	60 %	20 %	20 %	0 %	294505713
7	NC_014031	GTACA	2	10	9196	9205	40 %	20 %	20 %	20 %	294505713
8	NC_014031	TTAAA	2	10	11357	11366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014031	AGATA	2	10	12267	12276	60 %	20 %	20 %	0 %	294505717
10	NC_014031	GAGAC	2	10	12584	12593	40 %	0 %	40 %	20 %	294505717
11	NC_014031	TGAAG	2	10	12640	12649	40 %	20 %	40 %	0 %	294505717
12	NC_014031	TAAAA	2	10	12727	12736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014031	TGCTC	2	10	14347	14356	0 %	40 %	20 %	40 %	294505719
14	NC_014031	ATATC	2	10	14561	14570	40 %	40 %	0 %	20 %	294505719
15	NC_014031	TTTTA	2	10	15269	15278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014031	AAAAC	2	10	15539	15548	80 %	0 %	0 %	20 %	294505720
17	NC_014031	ACAAT	2	10	15818	15827	60 %	20 %	0 %	20 %	294505720
18	NC_014031	AATTG	2	10	16222	16231	40 %	40 %	20 %	0 %	294505720
19	NC_014031	TTAAA	2	10	16580	16589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014031	AAAGA	2	10	18179	18188	80 %	0 %	20 %	0 %	294505723
21	NC_014031	TAATT	2	10	18511	18520	40 %	60 %	0 %	0 %	294505723
22	NC_014031	TATTT	2	10	22755	22764	20 %	80 %	0 %	0 %	294505730
23	NC_014031	ATTTT	2	10	23191	23200	20 %	80 %	0 %	0 %	294505730
24	NC_014031	TAATT	2	10	23850	23859	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014031	ATCTT	2	10	23874	23883	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014031	CAACT	2	10	23907	23916	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014031	TCCTT	2	10	25954	25963	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014031	GTTTT	2	10	26088	26097	0 %	80 %	20 %	0 %	294505734
29	NC_014031	ATCTC	2	10	27159	27168	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014031	AAATT	2	10	28929	28938	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014031	AATTT	2	10	28970	28979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014031	GAATG	2	10	29768	29777	40 %	20 %	40 %	0 %	294505737
33	NC_014031	TGTAT	2	10	31527	31536	20 %	60 %	20 %	0 %	294505739
34	NC_014031	AGAAA	2	10	32326	32335	80 %	0 %	20 %	0 %	294505739
35	NC_014031	AATAT	2	10	33681	33690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014031	CTTTT	2	10	34783	34792	0 %	80 %	0 %	20 %	294505742
37	NC_014031	ACTTT	2	10	37761	37770	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014031	AATCG	2	10	38221	38230	40 %	20 %	20 %	20 %	294505746
39	NC_014031	CTTTT	2	10	39026	39035	0 %	80 %	0 %	20 %	294505747
40	NC_014031	ATAAA	2	10	40006	40015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014031	AAAAT	2	10	40089	40098	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014031	CTCTT	2	10	41282	41291	0 %	60 %	0 %	40 %	294505751
43	NC_014031	TATAT	2	10	41330	41339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014031	GATTA	2	10	47344	47353	40 %	40 %	20 %	0 %	294505755
45	NC_014031	TTATC	2	10	47405	47414	20 %	60 %	0 %	20 %	294505755
46	NC_014031	AAATT	2	10	48329	48338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014031	ATTAT	2	10	48637	48646	40 %	60 %	0 %	0 %	294505756
48	NC_014031	AAGAA	2	10	49583	49592	80 %	0 %	20 %	0 %	294505757
49	NC_014031	AAAGG	2	10	50376	50385	60 %	0 %	40 %	0 %	294505760
50	NC_014031	TTAAT	2	10	51968	51977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014031	TTTCA	2	10	52994	53003	20 %	60 %	0 %	20 %	294505762
52	NC_014031	ATAAA	2	10	53331	53340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014031	ACAAA	2	10	53785	53794	80 %	0 %	0 %	20 %	294505763
54	NC_014031	ACCTT	2	10	54412	54421	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014031	AGATA	2	10	54908	54917	60 %	20 %	20 %	0 %	294505764
56	NC_014031	AACGA	2	10	54944	54953	60 %	0 %	20 %	20 %	294505764
57	NC_014031	TTCAA	2	10	56283	56292	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014031	GAAGG	2	10	59513	59522	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014031	ATATA	2	10	62131	62140	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014031	ATTTA	2	10	63397	63406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014031	CCATT	2	10	65197	65206	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_014031	ATATT	2	10	65515	65524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014031	AGAAA	2	10	66039	66048	80 %	0 %	20 %	0 %	294505776
64	NC_014031	TATCA	2	10	69671	69680	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014031	AAAAG	2	10	72058	72067	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014031	GTTTA	2	10	72121	72130	20 %	60 %	20 %	0 %	294505784
67	NC_014031	AGAAT	2	10	72815	72824	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014031	TTCGA	2	10	74000	74009	20 %	40 %	20 %	20 %	294505786
69	NC_014031	TTCAT	2	10	74013	74022	20 %	60 %	0 %	20 %	294505786
70	NC_014031	AAGAA	2	10	74264	74273	80 %	0 %	20 %	0 %	294505786
71	NC_014031	AATGA	2	10	75941	75950	60 %	20 %	20 %	0 %	294505789
72	NC_014031	GAGAA	2	10	78274	78283	60 %	0 %	40 %	0 %	294505791
73	NC_014031	ATTTG	2	10	79032	79041	20 %	60 %	20 %	0 %	294505792
74	NC_014031	ATGAA	2	10	80569	80578	60 %	20 %	20 %	0 %	294505795
75	NC_014031	AATAA	2	10	80832	80841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014031	ATTAT	2	10	82790	82799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014031	ATCAA	2	10	83467	83476	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014031	TTCCT	2	10	84404	84413	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014031	ACACT	2	10	85011	85020	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014031	GCATT	2	10	85695	85704	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014031	ATTTA	2	10	86043	86052	40 %	60 %	0 %	0 %	294505798
82	NC_014031	ATGGA	2	10	86700	86709	40 %	20 %	40 %	0 %	294505799
83	NC_014031	ATATT	2	10	88116	88125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014031	TTTCT	2	10	88315	88324	0 %	80 %	0 %	20 %	294505802
85	NC_014031	ATATT	2	10	88614	88623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014031	TAAAT	2	10	91034	91043	60 %	40 %	0 %	0 %	294505805
87	NC_014031	ATCTT	2	10	91088	91097	20 %	60 %	0 %	20 %	294505805
88	NC_014031	AATTA	2	10	92636	92645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014031	ACCAG	2	10	93387	93396	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014031	GGTTG	2	10	97445	97454	0 %	40 %	60 %	0 %	294505812
91	NC_014031	TTTTC	2	10	97592	97601	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.