MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM600

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014031	CAAA	2	8	268	275	75 %	0 %	0 %	25 %	294505705
2	NC_014031	AGGC	2	8	297	304	25 %	0 %	50 %	25 %	294505705
3	NC_014031	AAAT	2	8	617	624	75 %	25 %	0 %	0 %	294505705
4	NC_014031	GAAA	2	8	883	890	75 %	0 %	25 %	0 %	294505705
5	NC_014031	AGTT	2	8	1031	1038	25 %	50 %	25 %	0 %	294505705
6	NC_014031	GAAA	2	8	1752	1759	75 %	0 %	25 %	0 %	294505706
7	NC_014031	CCCT	2	8	2179	2186	0 %	25 %	0 %	75 %	294505706
8	NC_014031	TTTC	2	8	2221	2228	0 %	75 %	0 %	25 %	294505706
9	NC_014031	AAAC	2	8	2271	2278	75 %	0 %	0 %	25 %	294505706
10	NC_014031	TAAA	2	8	2387	2394	75 %	25 %	0 %	0 %	294505706
11	NC_014031	TTAG	2	8	3720	3727	25 %	50 %	25 %	0 %	294505707
12	NC_014031	TCAA	2	8	3908	3915	50 %	25 %	0 %	25 %	294505707
13	NC_014031	TTCA	2	8	4876	4883	25 %	50 %	0 %	25 %	294505708
14	NC_014031	TTAC	2	8	6803	6810	25 %	50 %	0 %	25 %	294505711
15	NC_014031	TAAT	2	8	6833	6840	50 %	50 %	0 %	0 %	294505711
16	NC_014031	GCAT	2	8	6914	6921	25 %	25 %	25 %	25 %	294505711
17	NC_014031	TAAA	2	8	6957	6964	75 %	25 %	0 %	0 %	294505711
18	NC_014031	TCCC	2	8	7309	7316	0 %	25 %	0 %	75 %	294505712
19	NC_014031	TTCA	2	8	7532	7539	25 %	50 %	0 %	25 %	294505712
20	NC_014031	TACT	2	8	7543	7550	25 %	50 %	0 %	25 %	294505712
21	NC_014031	TCCT	2	8	7612	7619	0 %	50 %	0 %	50 %	294505712
22	NC_014031	TATT	2	8	7686	7693	25 %	75 %	0 %	0 %	294505712
23	NC_014031	GCCA	2	8	8512	8519	25 %	0 %	25 %	50 %	294505713
24	NC_014031	ACTT	2	8	8806	8813	25 %	50 %	0 %	25 %	294505713
25	NC_014031	TCAA	2	8	9343	9350	50 %	25 %	0 %	25 %	294505713
26	NC_014031	CCAA	2	8	9554	9561	50 %	0 %	0 %	50 %	294505714
27	NC_014031	AAAG	2	8	9622	9629	75 %	0 %	25 %	0 %	294505714
28	NC_014031	TAGA	2	8	9785	9792	50 %	25 %	25 %	0 %	294505714
29	NC_014031	TTTG	2	8	9907	9914	0 %	75 %	25 %	0 %	294505714
30	NC_014031	TTTA	2	8	10414	10421	25 %	75 %	0 %	0 %	294505714
31	NC_014031	ATTT	2	8	10543	10550	25 %	75 %	0 %	0 %	294505715
32	NC_014031	AAAT	2	8	10670	10677	75 %	25 %	0 %	0 %	294505715
33	NC_014031	TTAT	2	8	12911	12918	25 %	75 %	0 %	0 %	294505718
34	NC_014031	ATGA	2	8	13133	13140	50 %	25 %	25 %	0 %	294505718
35	NC_014031	TAAA	2	8	13197	13204	75 %	25 %	0 %	0 %	294505718
36	NC_014031	TCTA	2	8	13259	13266	25 %	50 %	0 %	25 %	294505718
37	NC_014031	CAAC	2	8	14472	14479	50 %	0 %	0 %	50 %	294505719
38	NC_014031	ATTC	2	8	15042	15049	25 %	50 %	0 %	25 %	294505719
39	NC_014031	CAAG	2	8	15063	15070	50 %	0 %	25 %	25 %	294505719
40	NC_014031	GAGC	2	8	15435	15442	25 %	0 %	50 %	25 %	294505720
41	NC_014031	ATTT	2	8	15555	15562	25 %	75 %	0 %	0 %	294505720
42	NC_014031	AACA	2	8	15591	15598	75 %	0 %	0 %	25 %	294505720
43	NC_014031	ATCT	2	8	15778	15785	25 %	50 %	0 %	25 %	294505720
44	NC_014031	CAAA	2	8	16160	16167	75 %	0 %	0 %	25 %	294505720
45	NC_014031	CAAC	2	8	16238	16245	50 %	0 %	0 %	50 %	294505720
46	NC_014031	GAAA	2	8	16853	16860	75 %	0 %	25 %	0 %	294505721
47	NC_014031	TCAG	2	8	17384	17391	25 %	25 %	25 %	25 %	294505721
48	NC_014031	GAAA	2	8	18666	18673	75 %	0 %	25 %	0 %	294505723
49	NC_014031	TTTA	2	8	18699	18706	25 %	75 %	0 %	0 %	294505723
50	NC_014031	TAAA	2	8	19223	19230	75 %	25 %	0 %	0 %	294505723
51	NC_014031	TTAA	2	8	19674	19681	50 %	50 %	0 %	0 %	294505724
52	NC_014031	CTTT	2	8	19698	19705	0 %	75 %	0 %	25 %	294505724
53	NC_014031	ACAA	2	8	20328	20335	75 %	0 %	0 %	25 %	294505724
54	NC_014031	ATAA	2	8	21122	21129	75 %	25 %	0 %	0 %	294505725
55	NC_014031	TGAT	2	8	22011	22018	25 %	50 %	25 %	0 %	294505728
56	NC_014031	ACTA	2	8	22409	22416	50 %	25 %	0 %	25 %	294505729
57	NC_014031	TATC	2	8	22417	22424	25 %	50 %	0 %	25 %	294505729
58	NC_014031	TTAA	2	8	22460	22467	50 %	50 %	0 %	0 %	294505729
59	NC_014031	ATGC	2	8	22519	22526	25 %	25 %	25 %	25 %	294505730
60	NC_014031	CATA	2	8	22606	22613	50 %	25 %	0 %	25 %	294505730
61	NC_014031	ATTC	2	8	22927	22934	25 %	50 %	0 %	25 %	294505730
62	NC_014031	TTGC	2	8	23584	23591	0 %	50 %	25 %	25 %	294505730
63	NC_014031	TTGC	2	8	24288	24295	0 %	50 %	25 %	25 %	294505731
64	NC_014031	AATT	2	8	25720	25727	50 %	50 %	0 %	0 %	294505733
65	NC_014031	AAAT	2	8	25822	25829	75 %	25 %	0 %	0 %	294505733
66	NC_014031	TATC	2	8	26346	26353	25 %	50 %	0 %	25 %	294505734
67	NC_014031	ATGA	2	8	27347	27354	50 %	25 %	25 %	0 %	294505735
68	NC_014031	CCGG	2	8	28185	28192	0 %	0 %	50 %	50 %	294505736
69	NC_014031	TCCA	2	8	28327	28334	25 %	25 %	0 %	50 %	294505736
70	NC_014031	AACA	2	8	28523	28530	75 %	0 %	0 %	25 %	294505736
71	NC_014031	CTTT	2	8	28710	28717	0 %	75 %	0 %	25 %	294505736
72	NC_014031	GAAA	2	8	29593	29600	75 %	0 %	25 %	0 %	294505737
73	NC_014031	GATG	2	8	30039	30046	25 %	25 %	50 %	0 %	294505738
74	NC_014031	ATTA	2	8	30706	30713	50 %	50 %	0 %	0 %	294505738
75	NC_014031	AATC	2	8	31494	31501	50 %	25 %	0 %	25 %	294505739
76	NC_014031	AAAT	2	8	32147	32154	75 %	25 %	0 %	0 %	294505739
77	NC_014031	AAGG	2	8	32460	32467	50 %	0 %	50 %	0 %	294505739
78	NC_014031	CCAC	2	8	32723	32730	25 %	0 %	0 %	75 %	294505740
79	NC_014031	ATTG	2	8	33207	33214	25 %	50 %	25 %	0 %	294505740
80	NC_014031	AGCA	2	8	35390	35397	50 %	0 %	25 %	25 %	294505743
81	NC_014031	CTTT	2	8	36081	36088	0 %	75 %	0 %	25 %	294505744
82	NC_014031	GTTA	2	8	37071	37078	25 %	50 %	25 %	0 %	294505745
83	NC_014031	ATTC	2	8	37196	37203	25 %	50 %	0 %	25 %	294505745
84	NC_014031	AGTT	2	8	37919	37926	25 %	50 %	25 %	0 %	294505746
85	NC_014031	TTGA	2	8	38258	38265	25 %	50 %	25 %	0 %	294505746
86	NC_014031	ACCA	2	8	38920	38927	50 %	0 %	0 %	50 %	294505747
87	NC_014031	CGAA	2	8	39068	39075	50 %	0 %	25 %	25 %	294505747
88	NC_014031	TTTC	2	8	39199	39206	0 %	75 %	0 %	25 %	294505747
89	NC_014031	CCGA	2	8	40599	40606	25 %	0 %	25 %	50 %	294505750
90	NC_014031	AAAG	3	12	40639	40650	75 %	0 %	25 %	0 %	294505750
91	NC_014031	GTAA	2	8	41193	41200	50 %	25 %	25 %	0 %	294505751
92	NC_014031	TAAT	2	8	42029	42036	50 %	50 %	0 %	0 %	294505752
93	NC_014031	TAAT	2	8	42049	42056	50 %	50 %	0 %	0 %	294505752
94	NC_014031	ATCA	2	8	42749	42756	50 %	25 %	0 %	25 %	294505752
95	NC_014031	CTAA	2	8	42837	42844	50 %	25 %	0 %	25 %	294505752
96	NC_014031	AGCG	2	8	43225	43232	25 %	0 %	50 %	25 %	294505753
97	NC_014031	TCAT	2	8	43434	43441	25 %	50 %	0 %	25 %	294505753
98	NC_014031	TGCG	2	8	43594	43601	0 %	25 %	50 %	25 %	294505753
99	NC_014031	TTTA	2	8	43602	43609	25 %	75 %	0 %	0 %	294505753
100	NC_014031	CTAT	2	8	43839	43846	25 %	50 %	0 %	25 %	294505753
101	NC_014031	TATT	2	8	44101	44108	25 %	75 %	0 %	0 %	294505753
102	NC_014031	AAAC	2	8	44295	44302	75 %	0 %	0 %	25 %	294505753
103	NC_014031	TGTC	2	8	46648	46655	0 %	50 %	25 %	25 %	294505755
104	NC_014031	CGAT	2	8	46988	46995	25 %	25 %	25 %	25 %	294505755
105	NC_014031	AAAT	2	8	47680	47687	75 %	25 %	0 %	0 %	294505755
106	NC_014031	TACT	2	8	48592	48599	25 %	50 %	0 %	25 %	294505756
107	NC_014031	TTGG	2	8	48870	48877	0 %	50 %	50 %	0 %	294505756
108	NC_014031	TATT	2	8	49186	49193	25 %	75 %	0 %	0 %	294505757
109	NC_014031	AAAT	2	8	49332	49339	75 %	25 %	0 %	0 %	294505757
110	NC_014031	AAAG	2	8	49601	49608	75 %	0 %	25 %	0 %	294505757
111	NC_014031	AATT	2	8	49937	49944	50 %	50 %	0 %	0 %	294505759
112	NC_014031	GAAG	2	8	49988	49995	50 %	0 %	50 %	0 %	294505759
113	NC_014031	TTAA	2	8	52926	52933	50 %	50 %	0 %	0 %	294505762
114	NC_014031	TTGA	2	8	54022	54029	25 %	50 %	25 %	0 %	294505763
115	NC_014031	GTTT	2	8	55469	55476	0 %	75 %	25 %	0 %	294505764
116	NC_014031	GTTT	2	8	55725	55732	0 %	75 %	25 %	0 %	294505764
117	NC_014031	TATT	2	8	55767	55774	25 %	75 %	0 %	0 %	294505764
118	NC_014031	TAGG	2	8	55776	55783	25 %	25 %	50 %	0 %	294505764
119	NC_014031	ATTT	2	8	57057	57064	25 %	75 %	0 %	0 %	294505765
120	NC_014031	TTAA	2	8	57127	57134	50 %	50 %	0 %	0 %	294505765
121	NC_014031	GCAT	2	8	57598	57605	25 %	25 %	25 %	25 %	294505766
122	NC_014031	ATAA	2	8	58029	58036	75 %	25 %	0 %	0 %	294505766
123	NC_014031	ATTG	2	8	58179	58186	25 %	50 %	25 %	0 %	294505766
124	NC_014031	TGAT	2	8	59107	59114	25 %	50 %	25 %	0 %	294505767
125	NC_014031	GTTT	2	8	60537	60544	0 %	75 %	25 %	0 %	294505769
126	NC_014031	AATA	2	8	60731	60738	75 %	25 %	0 %	0 %	294505769
127	NC_014031	TCGG	2	8	60918	60925	0 %	25 %	50 %	25 %	294505769
128	NC_014031	TAAA	2	8	61230	61237	75 %	25 %	0 %	0 %	294505769
129	NC_014031	CGCA	2	8	61238	61245	25 %	0 %	25 %	50 %	294505769
130	NC_014031	TCGC	2	8	61606	61613	0 %	25 %	25 %	50 %	294505769
131	NC_014031	AGAA	2	8	64342	64349	75 %	0 %	25 %	0 %	294505775
132	NC_014031	TCAA	2	8	64427	64434	50 %	25 %	0 %	25 %	294505775
133	NC_014031	AAAC	2	8	64516	64523	75 %	0 %	0 %	25 %	294505775
134	NC_014031	ATTT	2	8	64658	64665	25 %	75 %	0 %	0 %	294505775
135	NC_014031	AGTG	2	8	64689	64696	25 %	25 %	50 %	0 %	294505775
136	NC_014031	GTTT	2	8	64713	64720	0 %	75 %	25 %	0 %	294505775
137	NC_014031	CTCC	2	8	64738	64745	0 %	25 %	0 %	75 %	294505775
138	NC_014031	AAAG	2	8	64819	64826	75 %	0 %	25 %	0 %	294505775
139	NC_014031	ACCC	2	8	65955	65962	25 %	0 %	0 %	75 %	294505776
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.