MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR61

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014030	TTCTAA	2	12	580	591	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294505655
2	NC_014030	GGACGA	2	12	4988	4999	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294505661
3	NC_014030	CAACTC	2	12	5975	5986	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294505662
4	NC_014030	TTTACT	2	12	6043	6054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294505662
5	NC_014030	AACCTG	2	12	6908	6919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294505663
6	NC_014030	CGCTTC	2	12	12411	12422	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	294505666
7	NC_014030	CGGGAA	2	12	16015	16026	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294505672
8	NC_014030	GAAGTG	2	12	16087	16098	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014030	CGAGAC	2	12	16736	16747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505673
10	NC_014030	ACTGGC	2	12	17751	17762	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294505674
11	NC_014030	CGACCT	2	12	17841	17852	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294505674
12	NC_014030	GCGGAA	2	12	19033	19044	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294505675
13	NC_014030	AGACTG	2	12	22276	22287	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014030	GCCAAT	2	12	31947	31958	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294505683
15	NC_014030	CAGATC	2	12	32973	32984	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294505683
16	NC_014030	AGGCGG	2	12	35008	35019	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	294505683
17	NC_014030	TCCGGC	2	12	36442	36453	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	294505683
18	NC_014030	GGAGAT	2	12	37237	37248	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014030	GGTGAC	2	12	39145	39156	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294505685
20	NC_014030	ACCCGA	2	12	40829	40840	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014030	GATGGA	2	12	42341	42352	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	294505688
22	NC_014030	GGTTGA	2	12	45865	45876	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294505688
23	NC_014030	GACGTG	2	12	48715	48726	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294505691
24	NC_014030	GTGACC	2	12	49864	49875	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294505691
25	NC_014030	GTCTCG	2	12	54944	54955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505695
26	NC_014030	CACTTC	2	12	55593	55604	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014030	TTCCCG	2	12	55665	55676	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014030	GGAGCA	2	12	55934	55945	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014030	TTGTCC	2	12	58175	58186	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294505699
30	NC_014030	AAAATA	2	12	60541	60552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294505702

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.