MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR61

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014030	CCGCT	2	10	305	314	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_014030	ATCAC	2	10	1155	1164	40 %	20 %	0 %	40 %	294505655
3	NC_014030	AAAAG	2	10	1246	1255	80 %	0 %	20 %	0 %	294505655
4	NC_014030	GATTG	2	10	1802	1811	20 %	40 %	40 %	0 %	294505655
5	NC_014030	CCCGT	2	10	3014	3023	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_014030	CCGAT	2	10	3857	3866	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014030	AGATG	2	10	4767	4776	40 %	20 %	40 %	0 %	294505660
8	NC_014030	CATGA	2	10	6324	6333	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014030	AGAAA	2	10	6670	6679	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014030	TGAGC	2	10	6858	6867	20 %	20 %	40 %	20 %	294505663
11	NC_014030	TTGCC	2	10	10095	10104	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014030	GCAAC	2	10	10478	10487	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014030	CCCGC	2	10	11346	11355	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14	NC_014030	CTCGA	2	10	11417	11426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014030	CTTTG	2	10	12004	12013	0 %	60 %	20 %	20 %	294505666
16	NC_014030	CCGTC	2	10	12588	12597	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_014030	CCCGT	2	10	12601	12610	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_014030	CACGC	2	10	13430	13439	20 %	0 %	20 %	60 %	294505669
19	NC_014030	GACGT	2	10	15815	15824	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014030	TGCGT	2	10	17004	17013	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014030	CTTCG	2	10	17198	17207	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014030	GCGGA	2	10	19973	19982	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014030	CGGGC	2	10	20478	20487	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014030	TCGAG	2	10	21207	21216	20 %	20 %	40 %	20 %	294505678
25	NC_014030	AGCGC	2	10	22312	22321	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014030	TCTCT	2	10	23460	23469	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014030	CCGGA	2	10	23872	23881	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014030	GGCAC	2	10	24435	24444	20 %	0 %	40 %	40 %	294505681
29	NC_014030	CTTCC	2	10	25398	25407	0 %	40 %	0 %	60 %	294505681
30	NC_014030	CGCAC	2	10	27905	27914	20 %	0 %	20 %	60 %	294505682
31	NC_014030	CGGGG	2	10	27945	27954	0 %	0 %	80 %	20 %	294505682
32	NC_014030	TTCAA	2	10	29090	29099	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014030	GAGAA	2	10	29260	29269	60 %	0 %	40 %	0 %	294505683
34	NC_014030	CCAGC	2	10	29374	29383	20 %	0 %	20 %	60 %	294505683
35	NC_014030	GCGAC	2	10	31084	31093	20 %	0 %	40 %	40 %	294505683
36	NC_014030	GCCGG	2	10	34188	34197	0 %	0 %	60 %	40 %	294505683
37	NC_014030	CGGCG	2	10	34256	34265	0 %	0 %	60 %	40 %	294505683
38	NC_014030	GATCG	2	10	34512	34521	20 %	20 %	40 %	20 %	294505683
39	NC_014030	TGGCC	2	10	34748	34757	0 %	20 %	40 %	40 %	294505683
40	NC_014030	CTGGC	2	10	34855	34864	0 %	20 %	40 %	40 %	294505683
41	NC_014030	CGGCC	2	10	36217	36226	0 %	0 %	40 %	60 %	294505683
42	NC_014030	ACGGC	2	10	37595	37604	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014030	TTCGA	2	10	39617	39626	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014030	CGCTC	2	10	40206	40215	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_014030	CGGAC	2	10	42102	42111	20 %	0 %	40 %	40 %	294505688
46	NC_014030	GTCCA	2	10	42313	42322	20 %	20 %	20 %	40 %	294505688
47	NC_014030	GGGCT	2	10	45423	45432	0 %	20 %	60 %	20 %	294505688
48	NC_014030	AGCGC	2	10	45530	45539	20 %	0 %	40 %	40 %	294505688
49	NC_014030	TCTCT	2	10	46497	46506	0 %	60 %	0 %	40 %	294505689
50	NC_014030	CCGTT	2	10	47179	47188	0 %	40 %	20 %	40 %	294505689
51	NC_014030	TCCAA	2	10	47854	47863	40 %	20 %	0 %	40 %	294505690
52	NC_014030	GTTTG	2	10	48622	48631	0 %	60 %	40 %	0 %	294505691
53	NC_014030	CCAGA	2	10	48880	48889	40 %	0 %	20 %	40 %	294505691
54	NC_014030	GGACG	2	10	49110	49119	20 %	0 %	60 %	20 %	294505691
55	NC_014030	CGATC	2	10	49848	49857	20 %	20 %	20 %	40 %	294505691
56	NC_014030	CTGGG	2	10	52781	52790	0 %	20 %	60 %	20 %	294505693
57	NC_014030	CTGGG	2	10	53078	53087	0 %	20 %	60 %	20 %	294505693
58	NC_014030	GCATT	2	10	53634	53643	20 %	40 %	20 %	20 %	294505693
59	NC_014030	CGACA	2	10	53671	53680	40 %	0 %	20 %	40 %	294505693
60	NC_014030	CCGAA	2	10	54321	54330	40 %	0 %	20 %	40 %	294505694
61	NC_014030	GGGCA	2	10	54332	54341	20 %	0 %	60 %	20 %	294505694
62	NC_014030	GCACA	2	10	56327	56336	40 %	0 %	20 %	40 %	294505696
63	NC_014030	CTGTC	2	10	57321	57330	0 %	40 %	20 %	40 %	294505697
64	NC_014030	GCTTT	2	10	57361	57370	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014030	TTCCA	2	10	59303	59312	20 %	40 %	0 %	40 %	294505700
66	NC_014030	CAACG	2	10	60579	60588	40 %	0 %	20 %	40 %	294505702

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.