MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR61

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014030	CCTC	2	8	2815	2822	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_014030	TGAG	2	8	3772	3779	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014030	GGAA	2	8	6620	6627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014030	GCAG	2	8	9498	9505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014030	GTAC	2	8	9561	9568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014030	CCGC	2	8	10419	10426	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_014030	GCTA	2	8	10442	10449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014030	GCTC	2	8	10908	10915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014030	CATC	2	8	10980	10987	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014030	GGCC	2	8	11196	11203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014030	CTCC	2	8	11262	11269	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_014030	GGGC	2	8	15834	15841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014030	AGTC	2	8	17290	17297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014030	GTTC	2	8	20615	20622	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014030	CAGC	2	8	21858	21865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014030	CCGA	2	8	22160	22167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014030	CAAA	2	8	22232	22239	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014030	GAAA	2	8	22736	22743	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014030	AGAA	2	8	22808	22815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014030	GGAA	2	8	23807	23814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014030	GTAA	2	8	25804	25811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014030	CCCG	2	8	26140	26147	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_014030	AGCA	2	8	28510	28517	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014030	ATGG	2	8	28835	28842	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014030	GCTC	2	8	28883	28890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014030	CTCC	2	8	37163	37170	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_014030	CGGC	2	8	37190	37197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014030	GACG	2	8	37452	37459	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014030	CTGG	2	8	39357	39364	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014030	GGAA	2	8	39531	39538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014030	GAGG	2	8	40230	40237	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014030	CGGC	2	8	40546	40553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014030	CGGT	2	8	40651	40658	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014030	TCGT	2	8	40771	40778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014030	GGGA	2	8	48352	48359	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014030	GACT	2	8	48410	48417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014030	GCCG	2	8	54591	54598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014030	GGGA	2	8	55779	55786	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014030	GCCT	2	8	55833	55840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014030	AAAC	2	8	61278	61285	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014030	GCTT	2	8	61361	61368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.