MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR61

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014030	GA	3	6	145	150	50 %	0 %	50 %	0 %	294505654
2	NC_014030	AG	4	8	636	643	50 %	0 %	50 %	0 %	294505655
3	NC_014030	AG	3	6	1423	1428	50 %	0 %	50 %	0 %	294505655
4	NC_014030	CG	3	6	1622	1627	0 %	0 %	50 %	50 %	294505655
5	NC_014030	GA	3	6	1646	1651	50 %	0 %	50 %	0 %	294505655
6	NC_014030	GC	3	6	1791	1796	0 %	0 %	50 %	50 %	294505655
7	NC_014030	CA	3	6	1858	1863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014030	CT	3	6	1914	1919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014030	GT	3	6	1952	1957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014030	GC	3	6	2386	2391	0 %	0 %	50 %	50 %	294505656
11	NC_014030	GC	3	6	2767	2772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014030	CT	3	6	5610	5615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014030	TC	4	8	5798	5805	0 %	50 %	0 %	50 %	294505662
14	NC_014030	GC	3	6	7211	7216	0 %	0 %	50 %	50 %	294505663
15	NC_014030	AG	3	6	7619	7624	50 %	0 %	50 %	0 %	294505663
16	NC_014030	TA	3	6	8066	8071	50 %	50 %	0 %	0 %	294505663
17	NC_014030	TC	3	6	9312	9317	0 %	50 %	0 %	50 %	294505665
18	NC_014030	TG	3	6	10015	10020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014030	TG	3	6	10030	10035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014030	TG	3	6	10045	10050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014030	TG	3	6	10060	10065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014030	AC	3	6	10540	10545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014030	AG	3	6	12821	12826	50 %	0 %	50 %	0 %	294505667
24	NC_014030	TC	3	6	14180	14185	0 %	50 %	0 %	50 %	294505670
25	NC_014030	GC	3	6	14307	14312	0 %	0 %	50 %	50 %	294505670
26	NC_014030	CT	3	6	14356	14361	0 %	50 %	0 %	50 %	294505670
27	NC_014030	AT	3	6	14398	14403	50 %	50 %	0 %	0 %	294505670
28	NC_014030	GA	3	6	14530	14535	50 %	0 %	50 %	0 %	294505670
29	NC_014030	GC	3	6	14555	14560	0 %	0 %	50 %	50 %	294505670
30	NC_014030	AG	3	6	14892	14897	50 %	0 %	50 %	0 %	294505671
31	NC_014030	GC	3	6	15356	15361	0 %	0 %	50 %	50 %	294505671
32	NC_014030	GC	3	6	15508	15513	0 %	0 %	50 %	50 %	294505671
33	NC_014030	AG	3	6	15735	15740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014030	TC	3	6	15930	15935	0 %	50 %	0 %	50 %	294505672
35	NC_014030	AC	3	6	16163	16168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014030	TG	3	6	16191	16196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014030	GA	3	6	16702	16707	50 %	0 %	50 %	0 %	294505673
38	NC_014030	TG	3	6	16976	16981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014030	CT	3	6	18064	18069	0 %	50 %	0 %	50 %	294505674
40	NC_014030	CT	3	6	18213	18218	0 %	50 %	0 %	50 %	294505674
41	NC_014030	AG	3	6	19375	19380	50 %	0 %	50 %	0 %	294505675
42	NC_014030	CA	3	6	20343	20348	50 %	0 %	0 %	50 %	294505677
43	NC_014030	AG	3	6	20355	20360	50 %	0 %	50 %	0 %	294505677
44	NC_014030	AC	3	6	20376	20381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014030	AG	3	6	22053	22058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014030	CT	3	6	22662	22667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014030	GA	3	6	25185	25190	50 %	0 %	50 %	0 %	294505681
48	NC_014030	GT	3	6	25552	25557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014030	CT	3	6	25900	25905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014030	TG	3	6	26014	26019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014030	TC	3	6	26555	26560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014030	CT	3	6	26891	26896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014030	AC	3	6	27425	27430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014030	AC	3	6	27449	27454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014030	GA	3	6	28067	28072	50 %	0 %	50 %	0 %	294505682
56	NC_014030	TC	4	8	28313	28320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014030	GT	3	6	28911	28916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014030	TC	3	6	29774	29779	0 %	50 %	0 %	50 %	294505683
59	NC_014030	GA	3	6	30020	30025	50 %	0 %	50 %	0 %	294505683
60	NC_014030	CG	3	6	32392	32397	0 %	0 %	50 %	50 %	294505683
61	NC_014030	GC	3	6	34049	34054	0 %	0 %	50 %	50 %	294505683
62	NC_014030	TC	3	6	35537	35542	0 %	50 %	0 %	50 %	294505683
63	NC_014030	GC	3	6	35650	35655	0 %	0 %	50 %	50 %	294505683
64	NC_014030	GA	3	6	36232	36237	50 %	0 %	50 %	0 %	294505683
65	NC_014030	GA	3	6	36286	36291	50 %	0 %	50 %	0 %	294505683
66	NC_014030	GA	3	6	36433	36438	50 %	0 %	50 %	0 %	294505683
67	NC_014030	CT	3	6	36933	36938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014030	TC	3	6	37043	37048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014030	GC	3	6	38780	38785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014030	GC	3	6	39632	39637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014030	CG	3	6	39706	39711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014030	GC	3	6	40397	40402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014030	GC	3	6	40540	40545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014030	CT	3	6	41298	41303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014030	GC	3	6	42597	42602	0 %	0 %	50 %	50 %	294505688
76	NC_014030	GC	3	6	43219	43224	0 %	0 %	50 %	50 %	294505688
77	NC_014030	GC	3	6	43821	43826	0 %	0 %	50 %	50 %	294505688
78	NC_014030	GC	3	6	44160	44165	0 %	0 %	50 %	50 %	294505688
79	NC_014030	GC	3	6	44442	44447	0 %	0 %	50 %	50 %	294505688
80	NC_014030	CT	3	6	45811	45816	0 %	50 %	0 %	50 %	294505688
81	NC_014030	CT	3	6	46516	46521	0 %	50 %	0 %	50 %	294505689
82	NC_014030	GC	3	6	46768	46773	0 %	0 %	50 %	50 %	294505689
83	NC_014030	GA	3	6	46870	46875	50 %	0 %	50 %	0 %	294505689
84	NC_014030	AG	4	8	47148	47155	50 %	0 %	50 %	0 %	294505689
85	NC_014030	CG	3	6	48542	48547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014030	TC	5	10	48644	48653	0 %	50 %	0 %	50 %	294505691
87	NC_014030	GT	3	6	51512	51517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014030	TC	3	6	52555	52560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014030	CT	3	6	52627	52632	0 %	50 %	0 %	50 %	294505693
90	NC_014030	GA	3	6	53647	53652	50 %	0 %	50 %	0 %	294505693
91	NC_014030	CA	3	6	54690	54695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014030	CT	3	6	54744	54749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014030	TC	3	6	54984	54989	0 %	50 %	0 %	50 %	294505695
94	NC_014030	CA	3	6	55495	55500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014030	TG	3	6	55522	55527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014030	GC	3	6	56956	56961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014030	AG	3	6	57217	57222	50 %	0 %	50 %	0 %	294505697
98	NC_014030	GA	3	6	58322	58327	50 %	0 %	50 %	0 %	294505699
99	NC_014030	GA	3	6	58445	58450	50 %	0 %	50 %	0 %	294505699
100	NC_014030	AT	3	6	58461	58466	50 %	50 %	0 %	0 %	294505699
101	NC_014030	TC	3	6	58598	58603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014030	AG	3	6	59532	59537	50 %	0 %	50 %	0 %	294505700
103	NC_014030	GA	3	6	59716	59721	50 %	0 %	50 %	0 %	294505700
104	NC_014030	CT	4	8	59831	59838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014030	TG	3	6	60053	60058	0 %	50 %	50 %	0 %	294505701
106	NC_014030	CT	3	6	60272	60277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014030	GA	3	6	60880	60885	50 %	0 %	50 %	0 %	294505703

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.