MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR56

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014028	CTTCGG	2	12	9343	9354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502079
2	NC_014028	GCTCCA	2	12	10609	10620	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294502080
3	NC_014028	CCGACG	2	12	11976	11987	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294502080
4	NC_014028	CGGCGT	2	12	16105	16116	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294502083
5	NC_014028	ACCTCG	2	12	16191	16202	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294502083
6	NC_014028	CGTCCT	2	12	16576	16587	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	294502083
7	NC_014028	GGTAAC	2	12	17098	17109	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294502083
8	NC_014028	GGATCT	2	12	31697	31708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294502091
9	NC_014028	CGATGG	2	12	32485	32496	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294502092
10	NC_014028	ATAGAG	2	12	37676	37687	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294502094
11	NC_014028	TCCCTC	2	12	37889	37900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502094
12	NC_014028	CTTCTC	2	12	38110	38121	0 %	50 %	0 %	50 %	294502094
13	NC_014028	CATCCC	2	12	39119	39130	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	294502095
14	NC_014028	GACGTG	2	12	42432	42443	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294502099
15	NC_014028	GGACGA	2	12	46912	46923	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014028	CCTTGA	2	12	48129	48140	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014028	CCGAAG	2	12	48417	48428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502104
18	NC_014028	GCCGGT	2	12	49008	49019	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294502104
19	NC_014028	CACTTT	2	12	49144	49155	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294502104
20	NC_014028	CCACGA	2	12	50300	50311	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294502105
21	NC_014028	TTTGGA	2	12	53467	53478	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294502107
22	NC_014028	TCGAGG	2	12	55007	55018	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.