MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR56

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014028	CGAGA	2	10	111	120	40 %	0 %	40 %	20 %	294502070
2	NC_014028	TCCTC	2	10	2465	2474	0 %	40 %	0 %	60 %	294502070
3	NC_014028	AAAGG	2	10	3084	3093	60 %	0 %	40 %	0 %	294502071
4	NC_014028	GAGAA	2	10	3520	3529	60 %	0 %	40 %	0 %	294502071
5	NC_014028	TATCG	2	10	4477	4486	20 %	40 %	20 %	20 %	294502072
6	NC_014028	GGGAT	2	10	4490	4499	20 %	20 %	60 %	0 %	294502072
7	NC_014028	TCTAC	2	10	5126	5135	20 %	40 %	0 %	40 %	294502073
8	NC_014028	GAGAA	2	10	5529	5538	60 %	0 %	40 %	0 %	294502074
9	NC_014028	CGGCT	2	10	9007	9016	0 %	20 %	40 %	40 %	294502078
10	NC_014028	GCCTC	2	10	16378	16387	0 %	20 %	20 %	60 %	294502083
11	NC_014028	CCTCC	2	10	17164	17173	0 %	20 %	0 %	80 %	294502083
12	NC_014028	GCCGG	2	10	19932	19941	0 %	0 %	60 %	40 %	294502085
13	NC_014028	CGAGC	2	10	21482	21491	20 %	0 %	40 %	40 %	294502087
14	NC_014028	GGTCA	2	10	22919	22928	20 %	20 %	40 %	20 %	294502087
15	NC_014028	TCGCC	2	10	23206	23215	0 %	20 %	20 %	60 %	294502087
16	NC_014028	AGTTC	2	10	23302	23311	20 %	40 %	20 %	20 %	294502087
17	NC_014028	TCGAG	2	10	23356	23365	20 %	20 %	40 %	20 %	294502087
18	NC_014028	CGATT	2	10	27110	27119	20 %	40 %	20 %	20 %	294502088
19	NC_014028	CGCGG	2	10	28658	28667	0 %	0 %	60 %	40 %	294502088
20	NC_014028	ACACC	2	10	29046	29055	40 %	0 %	0 %	60 %	294502089
21	NC_014028	CCGCT	2	10	29058	29067	0 %	20 %	20 %	60 %	294502089
22	NC_014028	GCTTC	2	10	34820	34829	0 %	40 %	20 %	40 %	294502092
23	NC_014028	TCCCG	2	10	35719	35728	0 %	20 %	20 %	60 %	294502093
24	NC_014028	GGTCG	2	10	39102	39111	0 %	20 %	60 %	20 %	294502095
25	NC_014028	GGTCC	2	10	41277	41286	0 %	20 %	40 %	40 %	294502098
26	NC_014028	TTCAC	2	10	43678	43687	20 %	40 %	0 %	40 %	294502099
27	NC_014028	GAAGA	2	10	49980	49989	60 %	0 %	40 %	0 %	294502105
28	NC_014028	TTCTA	2	10	50803	50812	20 %	60 %	0 %	20 %	294502106
29	NC_014028	CGACA	2	10	51807	51816	40 %	0 %	20 %	40 %	294502107
30	NC_014028	TTCGG	2	10	52074	52083	0 %	40 %	40 %	20 %	294502107

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.