MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR56

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014028	TCGG	2	8	23	30	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014028	ACCG	2	8	364	371	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
3	NC_014028	ACCG	2	8	484	491	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
4	NC_014028	ACCG	2	8	1084	1091	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
5	NC_014028	ACCG	2	8	1204	1211	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
6	NC_014028	ACCG	2	8	1444	1451	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
7	NC_014028	ACCG	2	8	1564	1571	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
8	NC_014028	ACCG	2	8	1804	1811	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
9	NC_014028	ACCG	2	8	1924	1931	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
10	NC_014028	ACCG	2	8	2164	2171	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
11	NC_014028	ACCG	2	8	2284	2291	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
12	NC_014028	GGAT	2	8	2452	2459	25 %	25 %	50 %	0 %	294502070
13	NC_014028	GCTG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	50 %	25 %	294502071
14	NC_014028	CGCT	2	8	3169	3176	0 %	25 %	25 %	50 %	294502071
15	NC_014028	CTCC	2	8	3917	3924	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_014028	CAGG	2	8	5141	5148	25 %	0 %	50 %	25 %	294502073
17	NC_014028	CGGA	2	8	5207	5214	25 %	0 %	50 %	25 %	294502073
18	NC_014028	TCCC	2	8	6598	6605	0 %	25 %	0 %	75 %	294502075
19	NC_014028	GGTC	2	8	6680	6687	0 %	25 %	50 %	25 %	294502075
20	NC_014028	CCCT	2	8	6804	6811	0 %	25 %	0 %	75 %	294502075
21	NC_014028	CTCA	2	8	6979	6986	25 %	25 %	0 %	50 %	294502075
22	NC_014028	CATC	2	8	6999	7006	25 %	25 %	0 %	50 %	294502075
23	NC_014028	GCCC	2	8	7388	7395	0 %	0 %	25 %	75 %	294502076
24	NC_014028	CGCC	2	8	8226	8233	0 %	0 %	25 %	75 %	294502078
25	NC_014028	GGCG	2	8	8400	8407	0 %	0 %	75 %	25 %	294502078
26	NC_014028	GGTG	2	8	9807	9814	0 %	25 %	75 %	0 %	294502079
27	NC_014028	TGGC	2	8	9954	9961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014028	CTTC	2	8	10153	10160	0 %	50 %	0 %	50 %	294502080
29	NC_014028	CAGC	2	8	10426	10433	25 %	0 %	25 %	50 %	294502080
30	NC_014028	GCGG	2	8	10552	10559	0 %	0 %	75 %	25 %	294502080
31	NC_014028	CACG	2	8	10723	10730	25 %	0 %	25 %	50 %	294502080
32	NC_014028	CTTT	2	8	11134	11141	0 %	75 %	0 %	25 %	294502080
33	NC_014028	GGAT	2	8	11492	11499	25 %	25 %	50 %	0 %	294502080
34	NC_014028	CTGG	2	8	11875	11882	0 %	25 %	50 %	25 %	294502080
35	NC_014028	GCCC	2	8	12528	12535	0 %	0 %	25 %	75 %	294502081
36	NC_014028	CAGG	2	8	12710	12717	25 %	0 %	50 %	25 %	294502081
37	NC_014028	CTGG	2	8	13397	13404	0 %	25 %	50 %	25 %	294502081
38	NC_014028	CGGG	2	8	14963	14970	0 %	0 %	75 %	25 %	294502082
39	NC_014028	CGGG	2	8	15089	15096	0 %	0 %	75 %	25 %	294502082
40	NC_014028	GCGG	2	8	15311	15318	0 %	0 %	75 %	25 %	294502082
41	NC_014028	GCAG	2	8	15378	15385	25 %	0 %	50 %	25 %	294502082
42	NC_014028	CGGT	2	8	16748	16755	0 %	25 %	50 %	25 %	294502083
43	NC_014028	TGCC	2	8	17035	17042	0 %	25 %	25 %	50 %	294502083
44	NC_014028	TGGA	2	8	17384	17391	25 %	25 %	50 %	0 %	294502083
45	NC_014028	CGGT	2	8	17480	17487	0 %	25 %	50 %	25 %	294502083
46	NC_014028	GACC	2	8	18739	18746	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014028	ATCC	2	8	19131	19138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014028	CTCA	2	8	19150	19157	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014028	CGAG	2	8	19660	19667	25 %	0 %	50 %	25 %	294502085
50	NC_014028	CTGC	2	8	19912	19919	0 %	25 %	25 %	50 %	294502085
51	NC_014028	ATAA	2	8	20267	20274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014028	GCTC	2	8	21984	21991	0 %	25 %	25 %	50 %	294502087
53	NC_014028	GCTT	2	8	22015	22022	0 %	50 %	25 %	25 %	294502087
54	NC_014028	GCCC	2	8	22803	22810	0 %	0 %	25 %	75 %	294502087
55	NC_014028	GTAG	2	8	23485	23492	25 %	25 %	50 %	0 %	294502087
56	NC_014028	ACGT	2	8	23706	23713	25 %	25 %	25 %	25 %	294502087
57	NC_014028	GGTA	2	8	23821	23828	25 %	25 %	50 %	0 %	294502087
58	NC_014028	GCGA	2	8	23877	23884	25 %	0 %	50 %	25 %	294502087
59	NC_014028	CCGT	2	8	24701	24708	0 %	25 %	25 %	50 %	294502087
60	NC_014028	CCGC	2	8	25105	25112	0 %	0 %	25 %	75 %	294502087
61	NC_014028	GTCA	2	8	25404	25411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014028	ATTC	2	8	25542	25549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014028	CGTT	2	8	25680	25687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014028	TCGA	2	8	26454	26461	25 %	25 %	25 %	25 %	294502088
65	NC_014028	AGTC	2	8	26470	26477	25 %	25 %	25 %	25 %	294502088
66	NC_014028	ACTT	2	8	27406	27413	25 %	50 %	0 %	25 %	294502088
67	NC_014028	CCTC	2	8	27739	27746	0 %	25 %	0 %	75 %	294502088
68	NC_014028	TCGC	2	8	27789	27796	0 %	25 %	25 %	50 %	294502088
69	NC_014028	GAAA	2	8	27856	27863	75 %	0 %	25 %	0 %	294502088
70	NC_014028	ACCG	2	8	28301	28308	25 %	0 %	25 %	50 %	294502088
71	NC_014028	GCCA	2	8	29022	29029	25 %	0 %	25 %	50 %	294502089
72	NC_014028	CGGT	2	8	29300	29307	0 %	25 %	50 %	25 %	294502089
73	NC_014028	GGCG	2	8	29611	29618	0 %	0 %	75 %	25 %	294502089
74	NC_014028	TCGG	2	8	29805	29812	0 %	25 %	50 %	25 %	294502089
75	NC_014028	TCCT	2	8	30364	30371	0 %	50 %	0 %	50 %	294502090
76	NC_014028	GCCA	2	8	30658	30665	25 %	0 %	25 %	50 %	294502090
77	NC_014028	CCAT	2	8	31099	31106	25 %	25 %	0 %	50 %	294502090
78	NC_014028	CCAG	2	8	31490	31497	25 %	0 %	25 %	50 %	294502091
79	NC_014028	GCGT	2	8	31962	31969	0 %	25 %	50 %	25 %	294502091
80	NC_014028	GCCT	2	8	31995	32002	0 %	25 %	25 %	50 %	294502091
81	NC_014028	AGCG	2	8	32270	32277	25 %	0 %	50 %	25 %	294502092
82	NC_014028	TCTT	2	8	32538	32545	0 %	75 %	0 %	25 %	294502092
83	NC_014028	TCGC	2	8	33567	33574	0 %	25 %	25 %	50 %	294502092
84	NC_014028	GCAT	2	8	34014	34021	25 %	25 %	25 %	25 %	294502092
85	NC_014028	GACC	2	8	34091	34098	25 %	0 %	25 %	50 %	294502092
86	NC_014028	TCGG	2	8	35166	35173	0 %	25 %	50 %	25 %	294502092
87	NC_014028	GTTC	2	8	35185	35192	0 %	50 %	25 %	25 %	294502092
88	NC_014028	TGGG	2	8	35339	35346	0 %	25 %	75 %	0 %	294502093
89	NC_014028	CTCC	2	8	36091	36098	0 %	25 %	0 %	75 %	294502093
90	NC_014028	ACGA	2	8	36899	36906	50 %	0 %	25 %	25 %	294502094
91	NC_014028	GGAG	2	8	36927	36934	25 %	0 %	75 %	0 %	294502094
92	NC_014028	CCTG	2	8	37111	37118	0 %	25 %	25 %	50 %	294502094
93	NC_014028	CCCT	2	8	37254	37261	0 %	25 %	0 %	75 %	294502094
94	NC_014028	AGCC	2	8	37643	37650	25 %	0 %	25 %	50 %	294502094
95	NC_014028	CCGA	2	8	37988	37995	25 %	0 %	25 %	50 %	294502094
96	NC_014028	GACG	2	8	39158	39165	25 %	0 %	50 %	25 %	294502095
97	NC_014028	CCTC	2	8	39190	39197	0 %	25 %	0 %	75 %	294502095
98	NC_014028	CTGA	2	8	40156	40163	25 %	25 %	25 %	25 %	294502096
99	NC_014028	GACG	2	8	41051	41058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014028	ACCT	2	8	42258	42265	25 %	25 %	0 %	50 %	294502099
101	NC_014028	CTTC	2	8	42652	42659	0 %	50 %	0 %	50 %	294502099
102	NC_014028	GCCC	2	8	42816	42823	0 %	0 %	25 %	75 %	294502099
103	NC_014028	GGAG	2	8	42846	42853	25 %	0 %	75 %	0 %	294502099
104	NC_014028	ACAA	2	8	43058	43065	75 %	0 %	0 %	25 %	294502099
105	NC_014028	AAAT	2	8	43152	43159	75 %	25 %	0 %	0 %	294502099
106	NC_014028	GAAA	2	8	44533	44540	75 %	0 %	25 %	0 %	294502100
107	NC_014028	TAAA	2	8	44563	44570	75 %	25 %	0 %	0 %	294502100
108	NC_014028	TGCC	2	8	44665	44672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014028	AGGC	2	8	46163	46170	25 %	0 %	50 %	25 %	294502101
110	NC_014028	CGAG	2	8	46562	46569	25 %	0 %	50 %	25 %	294502102
111	NC_014028	CGTT	2	8	46738	46745	0 %	50 %	25 %	25 %	294502102
112	NC_014028	TGTT	2	8	46818	46825	0 %	75 %	25 %	0 %	294502102
113	NC_014028	ATCG	2	8	47674	47681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014028	CGAC	2	8	47783	47790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014028	CATC	2	8	47891	47898	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014028	CCTC	2	8	48074	48081	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_014028	GACC	2	8	48158	48165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014028	CCGA	2	8	48625	48632	25 %	0 %	25 %	50 %	294502104
119	NC_014028	CCGG	2	8	49907	49914	0 %	0 %	50 %	50 %	294502105
120	NC_014028	TCGG	2	8	50139	50146	0 %	25 %	50 %	25 %	294502105
121	NC_014028	CGGG	2	8	51506	51513	0 %	0 %	75 %	25 %	294502106
122	NC_014028	CAAA	2	8	51756	51763	75 %	0 %	0 %	25 %	294502107
123	NC_014028	CATA	2	8	52813	52820	50 %	25 %	0 %	25 %	294502107
124	NC_014028	CGGT	2	8	52950	52957	0 %	25 %	50 %	25 %	294502107
125	NC_014028	CGAG	2	8	53212	53219	25 %	0 %	50 %	25 %	294502107
126	NC_014028	TGCC	2	8	53864	53871	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014028	CCTG	2	8	54077	54084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014028	CGAC	2	8	54287	54294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014028	CATT	2	8	54455	54462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014028	GGTC	2	8	55392	55399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014028	TCGA	2	8	55825	55832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014028	TGCA	2	8	55870	55877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.