MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pPCP1

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014027	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014027	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	294509194
3	NC_014027	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	294509194
4	NC_014027	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	294509194
5	NC_014027	CTCA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	0 %	50 %	294509195
6	NC_014027	TCAG	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	294509195
7	NC_014027	CAGA	2	8	1840	1847	50 %	0 %	25 %	25 %	294509195
8	NC_014027	TCAG	2	8	2544	2551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014027	ACAG	2	8	2559	2566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014027	AACA	2	8	2928	2935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014027	CTCA	2	8	3425	3432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014027	TGTA	2	8	4218	4225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014027	ATTT	2	8	4322	4329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014027	CTGT	2	8	4632	4639	0 %	50 %	25 %	25 %	294509197
15	NC_014027	GAAA	2	8	4732	4739	75 %	0 %	25 %	0 %	294509197
16	NC_014027	TCTT	2	8	5506	5513	0 %	75 %	0 %	25 %	294509198
17	NC_014027	ATGA	2	8	6985	6992	50 %	25 %	25 %	0 %	294509200
18	NC_014027	AATC	2	8	6994	7001	50 %	25 %	0 %	25 %	294509200
19	NC_014027	TACA	2	8	7458	7465	50 %	25 %	0 %	25 %	294509200
20	NC_014027	TCCT	2	8	7809	7816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014027	ACAG	2	8	8568	8575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014027	ACGA	2	8	8665	8672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014027	TGCC	2	8	8675	8682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014027	CTGT	2	8	8948	8955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014027	ACAA	2	8	9205	9212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014027	TAAT	2	8	9262	9269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.