MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM500

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014025	TCTCC	2	10	3037	3046	0 %	40 %	0 %	60 %	294509094
2	NC_014025	AAGGA	2	10	3365	3374	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014025	CGATT	2	10	5635	5644	20 %	40 %	20 %	20 %	294509099
4	NC_014025	GAAAA	2	10	6342	6351	80 %	0 %	20 %	0 %	294509099
5	NC_014025	GGAAG	2	10	7131	7140	40 %	0 %	60 %	0 %	294509100
6	NC_014025	GAAAA	2	10	7189	7198	80 %	0 %	20 %	0 %	294509100
7	NC_014025	CTCAT	2	10	8055	8064	20 %	40 %	0 %	40 %	294509101
8	NC_014025	GTATG	2	10	9600	9609	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014025	TGATT	2	10	10478	10487	20 %	60 %	20 %	0 %	294509103
10	NC_014025	AAAAG	2	10	12517	12526	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014025	GTTTG	2	10	14273	14282	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014025	AATAT	2	10	15229	15238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014025	GTAAA	2	10	15622	15631	60 %	20 %	20 %	0 %	294509112
14	NC_014025	AAGAA	2	10	17310	17319	80 %	0 %	20 %	0 %	294509115
15	NC_014025	TAAAT	2	10	17376	17385	60 %	40 %	0 %	0 %	294509115
16	NC_014025	TAAAT	2	10	18498	18507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014025	ATATT	2	10	20834	20843	40 %	60 %	0 %	0 %	294509124
18	NC_014025	TACCT	2	10	21637	21646	20 %	40 %	0 %	40 %	294509127
19	NC_014025	GAGAA	2	10	22025	22034	60 %	0 %	40 %	0 %	294509128
20	NC_014025	TTGAA	2	10	22414	22423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014025	AAGAG	2	10	22740	22749	60 %	0 %	40 %	0 %	294509129
22	NC_014025	TAGAA	2	10	23037	23046	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014025	ATGTA	2	10	23968	23977	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014025	ATAAA	2	10	23999	24008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014025	AAAAG	2	10	24312	24321	80 %	0 %	20 %	0 %	294509132
26	NC_014025	TTTCC	2	10	25448	25457	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014025	TTCTT	2	10	26008	26017	0 %	80 %	0 %	20 %	294509136
28	NC_014025	TACTG	2	10	26548	26557	20 %	40 %	20 %	20 %	294509136
29	NC_014025	ATATG	2	10	28773	28782	40 %	40 %	20 %	0 %	294509139
30	NC_014025	AAATG	2	10	31106	31115	60 %	20 %	20 %	0 %	294509140
31	NC_014025	TTTCT	2	10	32128	32137	0 %	80 %	0 %	20 %	294509141
32	NC_014025	AGTTA	2	10	34035	34044	40 %	40 %	20 %	0 %	294509144
33	NC_014025	TCTAA	2	10	34179	34188	40 %	40 %	0 %	20 %	294509145
34	NC_014025	ACAAT	2	10	34204	34213	60 %	20 %	0 %	20 %	294509145
35	NC_014025	AAAAT	2	10	34391	34400	80 %	20 %	0 %	0 %	294509145
36	NC_014025	ACGTA	2	10	36792	36801	40 %	20 %	20 %	20 %	294509148
37	NC_014025	CTTTC	2	10	38590	38599	0 %	60 %	0 %	40 %	294509150
38	NC_014025	CTATT	2	10	39573	39582	20 %	60 %	0 %	20 %	294509152
39	NC_014025	TAGGA	2	10	40686	40695	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014025	TTTTA	2	10	41224	41233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014025	TTGGC	2	10	41811	41820	0 %	40 %	40 %	20 %	294509155
42	NC_014025	TTTAC	2	10	42662	42671	20 %	60 %	0 %	20 %	294509157
43	NC_014025	AAACT	2	10	42947	42956	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014025	TATTT	2	10	43835	43844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014025	TTTAC	2	10	44747	44756	20 %	60 %	0 %	20 %	294509160
46	NC_014025	AAGAA	2	10	45169	45178	80 %	0 %	20 %	0 %	294509160
47	NC_014025	AATTA	2	10	45632	45641	60 %	40 %	0 %	0 %	294509161
48	NC_014025	GTTTT	2	10	48527	48536	0 %	80 %	20 %	0 %	294509166
49	NC_014025	AATAA	2	10	49663	49672	80 %	20 %	0 %	0 %	294509167
50	NC_014025	ATTCG	2	10	50324	50333	20 %	40 %	20 %	20 %	294509167
51	NC_014025	TAAAA	2	10	53921	53930	80 %	20 %	0 %	0 %	294509169
52	NC_014025	ATTAA	2	10	53981	53990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014025	CAAGA	2	10	55315	55324	60 %	0 %	20 %	20 %	294509171
54	NC_014025	TTGTT	2	10	58511	58520	0 %	80 %	20 %	0 %	294509175
55	NC_014025	TAAAA	2	10	58916	58925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014025	TTTCA	2	10	62099	62108	20 %	60 %	0 %	20 %	294509179
57	NC_014025	CACAC	2	10	62476	62485	40 %	0 %	0 %	60 %	294509179
58	NC_014025	CAAAA	2	10	62741	62750	80 %	0 %	0 %	20 %	294509179
59	NC_014025	AGTAC	2	10	62781	62790	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014025	TGACA	2	10	62802	62811	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014025	ATTTG	2	10	62839	62848	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014025	AATCA	2	10	63812	63821	60 %	20 %	0 %	20 %	294509181
63	NC_014025	GACCA	2	10	64068	64077	40 %	0 %	20 %	40 %	294509181
64	NC_014025	TTCTT	2	10	64787	64796	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014025	TAGGC	2	10	64943	64952	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014025	TTGTA	2	10	65414	65423	20 %	60 %	20 %	0 %	294509184
67	NC_014025	AAATA	2	10	65776	65785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014025	CCCCT	2	10	66572	66581	0 %	20 %	0 %	80 %	294509185
69	NC_014025	TATAA	2	10	66704	66713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014025	TTTAA	2	10	66844	66853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014025	TTTTA	2	10	66863	66872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.