MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM500

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014025	GAAA	2	8	68	75	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014025	AGAA	2	8	94	101	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014025	CAAT	2	8	908	915	50 %	25 %	0 %	25 %	294509092
4	NC_014025	ACAT	2	8	964	971	50 %	25 %	0 %	25 %	294509092
5	NC_014025	TACA	2	8	1184	1191	50 %	25 %	0 %	25 %	294509092
6	NC_014025	TAAT	2	8	1370	1377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014025	CAGG	2	8	1795	1802	25 %	0 %	50 %	25 %	294509093
8	NC_014025	GAAA	2	8	1867	1874	75 %	0 %	25 %	0 %	294509093
9	NC_014025	TATT	2	8	2277	2284	25 %	75 %	0 %	0 %	294509094
10	NC_014025	GGCA	2	8	2614	2621	25 %	0 %	50 %	25 %	294509094
11	NC_014025	ATAG	2	8	2769	2776	50 %	25 %	25 %	0 %	294509094
12	NC_014025	ATCA	2	8	3172	3179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014025	AATA	2	8	3355	3362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014025	TTAT	2	8	4709	4716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014025	TTAA	2	8	4751	4758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014025	GATG	2	8	5028	5035	25 %	25 %	50 %	0 %	294509098
17	NC_014025	CCTG	2	8	5181	5188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014025	CATT	2	8	5516	5523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014025	CATG	2	8	5871	5878	25 %	25 %	25 %	25 %	294509099
20	NC_014025	GCCT	2	8	7890	7897	0 %	25 %	25 %	50 %	294509101
21	NC_014025	TGGC	2	8	8001	8008	0 %	25 %	50 %	25 %	294509101
22	NC_014025	TAAG	2	8	8481	8488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014025	CAGG	2	8	8844	8851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014025	CAAG	2	8	8970	8977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014025	TTAA	2	8	9712	9719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014025	AATA	2	8	9727	9734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014025	TTTA	2	8	10186	10193	25 %	75 %	0 %	0 %	294509103
28	NC_014025	ATCC	2	8	10283	10290	25 %	25 %	0 %	50 %	294509103
29	NC_014025	CATA	2	8	10529	10536	50 %	25 %	0 %	25 %	294509103
30	NC_014025	TTTC	2	8	10656	10663	0 %	75 %	0 %	25 %	294509103
31	NC_014025	TCTT	2	8	11070	11077	0 %	75 %	0 %	25 %	294509104
32	NC_014025	TTTA	2	8	11233	11240	25 %	75 %	0 %	0 %	294509105
33	NC_014025	AATC	2	8	11385	11392	50 %	25 %	0 %	25 %	294509105
34	NC_014025	CTAT	2	8	11628	11635	25 %	50 %	0 %	25 %	294509106
35	NC_014025	CAAA	2	8	11921	11928	75 %	0 %	0 %	25 %	294509106
36	NC_014025	ATTA	2	8	12083	12090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014025	AAAG	2	8	12268	12275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014025	ATTT	2	8	12468	12475	25 %	75 %	0 %	0 %	294509107
39	NC_014025	GGAT	2	8	12618	12625	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014025	GTTC	2	8	12637	12644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014025	AATA	2	8	12748	12755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014025	CTAA	2	8	12769	12776	50 %	25 %	0 %	25 %	294509108
43	NC_014025	TACT	2	8	13117	13124	25 %	50 %	0 %	25 %	294509108
44	NC_014025	CAAG	2	8	13168	13175	50 %	0 %	25 %	25 %	294509108
45	NC_014025	GTTG	2	8	13412	13419	0 %	50 %	50 %	0 %	294509109
46	NC_014025	GAAA	2	8	13919	13926	75 %	0 %	25 %	0 %	294509109
47	NC_014025	AATT	2	8	13933	13940	50 %	50 %	0 %	0 %	294509109
48	NC_014025	ATGT	2	8	14072	14079	25 %	50 %	25 %	0 %	294509109
49	NC_014025	TAAA	2	8	15417	15424	75 %	25 %	0 %	0 %	294509112
50	NC_014025	AACG	2	8	15832	15839	50 %	0 %	25 %	25 %	294509112
51	NC_014025	ATTT	2	8	16766	16773	25 %	75 %	0 %	0 %	294509114
52	NC_014025	AATA	2	8	16977	16984	75 %	25 %	0 %	0 %	294509114
53	NC_014025	ATGA	2	8	17083	17090	50 %	25 %	25 %	0 %	294509114
54	NC_014025	GAAC	2	8	17095	17102	50 %	0 %	25 %	25 %	294509114
55	NC_014025	CAAA	2	8	17199	17206	75 %	0 %	0 %	25 %	294509114
56	NC_014025	ATTC	2	8	17748	17755	25 %	50 %	0 %	25 %	294509115
57	NC_014025	CATT	2	8	17832	17839	25 %	50 %	0 %	25 %	294509115
58	NC_014025	GTTA	2	8	18293	18300	25 %	50 %	25 %	0 %	294509116
59	NC_014025	GGTT	2	8	18731	18738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014025	AATT	2	8	18763	18770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014025	AATG	2	8	18789	18796	50 %	25 %	25 %	0 %	294509118
62	NC_014025	TGAT	2	8	19095	19102	25 %	50 %	25 %	0 %	294509118
63	NC_014025	AAAG	2	8	19228	19235	75 %	0 %	25 %	0 %	294509118
64	NC_014025	AATT	2	8	19319	19326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014025	ATGT	2	8	19622	19629	25 %	50 %	25 %	0 %	294509120
66	NC_014025	TAAC	2	8	19911	19918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014025	AATT	2	8	19926	19933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014025	CTAA	2	8	20035	20042	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014025	ACAA	2	8	20087	20094	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014025	CTTA	2	8	20442	20449	25 %	50 %	0 %	25 %	294509123
71	NC_014025	GAAT	2	8	20511	20518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014025	TAGG	2	8	20880	20887	25 %	25 %	50 %	0 %	294509124
73	NC_014025	TTAT	2	8	20920	20927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014025	AAAC	2	8	21124	21131	75 %	0 %	0 %	25 %	294509125
75	NC_014025	ACAA	2	8	21584	21591	75 %	0 %	0 %	25 %	294509127
76	NC_014025	ATTT	2	8	21647	21654	25 %	75 %	0 %	0 %	294509127
77	NC_014025	TAAA	2	8	21717	21724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014025	CTAT	2	8	22448	22455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014025	TATC	2	8	22716	22723	25 %	50 %	0 %	25 %	294509129
80	NC_014025	TAAA	2	8	22783	22790	75 %	25 %	0 %	0 %	294509129
81	NC_014025	GAAA	2	8	22910	22917	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014025	AAAT	2	8	23921	23928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014025	TAAT	2	8	24026	24033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014025	TCGT	2	8	24254	24261	0 %	50 %	25 %	25 %	294509132
85	NC_014025	ACTT	2	8	24558	24565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014025	TTAT	2	8	24649	24656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014025	TTTC	2	8	25002	25009	0 %	75 %	0 %	25 %	294509135
88	NC_014025	AAAT	2	8	25015	25022	75 %	25 %	0 %	0 %	294509135
89	NC_014025	CCCA	2	8	25709	25716	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_014025	TTTC	2	8	26867	26874	0 %	75 %	0 %	25 %	294509136
91	NC_014025	AATA	2	8	26902	26909	75 %	25 %	0 %	0 %	294509136
92	NC_014025	TTAA	2	8	26960	26967	50 %	50 %	0 %	0 %	294509136
93	NC_014025	TCCA	2	8	27123	27130	25 %	25 %	0 %	50 %	294509136
94	NC_014025	ATTG	2	8	28791	28798	25 %	50 %	25 %	0 %	294509139
95	NC_014025	CATT	2	8	28879	28886	25 %	50 %	0 %	25 %	294509139
96	NC_014025	CTTT	2	8	28915	28922	0 %	75 %	0 %	25 %	294509139
97	NC_014025	AGCT	2	8	29059	29066	25 %	25 %	25 %	25 %	294509139
98	NC_014025	GAAT	2	8	29375	29382	50 %	25 %	25 %	0 %	294509139
99	NC_014025	GTTT	2	8	29478	29485	0 %	75 %	25 %	0 %	294509139
100	NC_014025	CTTT	2	8	29814	29821	0 %	75 %	0 %	25 %	294509139
101	NC_014025	GCTT	2	8	30273	30280	0 %	50 %	25 %	25 %	294509139
102	NC_014025	TAAG	2	8	30655	30662	50 %	25 %	25 %	0 %	294509140
103	NC_014025	AAAC	2	8	30776	30783	75 %	0 %	0 %	25 %	294509140
104	NC_014025	AATT	2	8	31333	31340	50 %	50 %	0 %	0 %	294509140
105	NC_014025	CAAT	2	8	31911	31918	50 %	25 %	0 %	25 %	294509141
106	NC_014025	GAAA	2	8	31980	31987	75 %	0 %	25 %	0 %	294509141
107	NC_014025	TTTA	2	8	32190	32197	25 %	75 %	0 %	0 %	294509142
108	NC_014025	TTGC	2	8	32394	32401	0 %	50 %	25 %	25 %	294509142
109	NC_014025	GCTT	2	8	32519	32526	0 %	50 %	25 %	25 %	294509143
110	NC_014025	TTGT	2	8	32631	32638	0 %	75 %	25 %	0 %	294509143
111	NC_014025	GTAT	2	8	32646	32653	25 %	50 %	25 %	0 %	294509143
112	NC_014025	AAAG	2	8	32855	32862	75 %	0 %	25 %	0 %	294509143
113	NC_014025	TTAC	2	8	32946	32953	25 %	50 %	0 %	25 %	294509143
114	NC_014025	TAAT	2	8	33419	33426	50 %	50 %	0 %	0 %	294509144
115	NC_014025	CATT	2	8	33467	33474	25 %	50 %	0 %	25 %	294509144
116	NC_014025	TTCT	2	8	33741	33748	0 %	75 %	0 %	25 %	294509144
117	NC_014025	TAAC	2	8	34289	34296	50 %	25 %	0 %	25 %	294509145
118	NC_014025	AAAG	2	8	34882	34889	75 %	0 %	25 %	0 %	294509146
119	NC_014025	TTCT	2	8	34986	34993	0 %	75 %	0 %	25 %	294509147
120	NC_014025	TAGA	2	8	34994	35001	50 %	25 %	25 %	0 %	294509147
121	NC_014025	GAAG	2	8	35038	35045	50 %	0 %	50 %	0 %	294509147
122	NC_014025	GAAC	2	8	35177	35184	50 %	0 %	25 %	25 %	294509147
123	NC_014025	ATTT	2	8	36032	36039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014025	TTAA	2	8	36321	36328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014025	ACTA	2	8	37633	37640	50 %	25 %	0 %	25 %	294509150
126	NC_014025	GAAA	2	8	37753	37760	75 %	0 %	25 %	0 %	294509150
127	NC_014025	TAAT	2	8	37988	37995	50 %	50 %	0 %	0 %	294509150
128	NC_014025	AGAT	2	8	38016	38023	50 %	25 %	25 %	0 %	294509150
129	NC_014025	ATAA	2	8	38300	38307	75 %	25 %	0 %	0 %	294509150
130	NC_014025	TAGT	2	8	38370	38377	25 %	50 %	25 %	0 %	294509150
131	NC_014025	ATAA	2	8	38581	38588	75 %	25 %	0 %	0 %	294509150
132	NC_014025	TAAT	2	8	38810	38817	50 %	50 %	0 %	0 %	294509151
133	NC_014025	ATAA	2	8	39111	39118	75 %	25 %	0 %	0 %	294509151
134	NC_014025	TTGC	2	8	39215	39222	0 %	50 %	25 %	25 %	294509151
135	NC_014025	ATTT	2	8	40156	40163	25 %	75 %	0 %	0 %	294509152
136	NC_014025	AATC	2	8	40494	40501	50 %	25 %	0 %	25 %	294509153
137	NC_014025	TAGC	2	8	40552	40559	25 %	25 %	25 %	25 %	294509153
138	NC_014025	ATTG	2	8	40969	40976	25 %	50 %	25 %	0 %	294509154
139	NC_014025	AAAT	2	8	41294	41301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014025	TTGA	2	8	42053	42060	25 %	50 %	25 %	0 %	294509155
141	NC_014025	TGGC	2	8	42205	42212	0 %	25 %	50 %	25 %	294509155
142	NC_014025	CTAA	2	8	42300	42307	50 %	25 %	0 %	25 %	294509155
143	NC_014025	TAAA	2	8	42582	42589	75 %	25 %	0 %	0 %	294509156
144	NC_014025	AAAC	2	8	42631	42638	75 %	0 %	0 %	25 %	294509157
145	NC_014025	ATTT	2	8	42878	42885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_014025	GATA	2	8	57925	57932	50 %	25 %	25 %	0 %	294509173
187	NC_014025	AAAG	2	8	58286	58293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014025	AACA	2	8	58739	58746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
189	NC_014025	GAAT	2	8	58807	58814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_014025	ATTA	2	8	62922	62929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_014025	AGGA	2	8	63272	63279	50 %	0 %	50 %	0 %	294509180
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.