MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM500

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014025	CAAT	2	8	908	915	50 %	25 %	0 %	25 %	294509092
2	NC_014025	ACAT	2	8	964	971	50 %	25 %	0 %	25 %	294509092
3	NC_014025	TACA	2	8	1184	1191	50 %	25 %	0 %	25 %	294509092
4	NC_014025	CAGG	2	8	1795	1802	25 %	0 %	50 %	25 %	294509093
5	NC_014025	GAAA	2	8	1867	1874	75 %	0 %	25 %	0 %	294509093
6	NC_014025	TATT	2	8	2277	2284	25 %	75 %	0 %	0 %	294509094
7	NC_014025	GGCA	2	8	2614	2621	25 %	0 %	50 %	25 %	294509094
8	NC_014025	ATAG	2	8	2769	2776	50 %	25 %	25 %	0 %	294509094
9	NC_014025	GATG	2	8	5028	5035	25 %	25 %	50 %	0 %	294509098
10	NC_014025	CATG	2	8	5871	5878	25 %	25 %	25 %	25 %	294509099
11	NC_014025	GCCT	2	8	7890	7897	0 %	25 %	25 %	50 %	294509101
12	NC_014025	TGGC	2	8	8001	8008	0 %	25 %	50 %	25 %	294509101
13	NC_014025	TTTA	2	8	10186	10193	25 %	75 %	0 %	0 %	294509103
14	NC_014025	ATCC	2	8	10283	10290	25 %	25 %	0 %	50 %	294509103
15	NC_014025	CATA	2	8	10529	10536	50 %	25 %	0 %	25 %	294509103
16	NC_014025	TTTC	2	8	10656	10663	0 %	75 %	0 %	25 %	294509103
17	NC_014025	TCTT	2	8	11070	11077	0 %	75 %	0 %	25 %	294509104
18	NC_014025	TTTA	2	8	11233	11240	25 %	75 %	0 %	0 %	294509105
19	NC_014025	AATC	2	8	11385	11392	50 %	25 %	0 %	25 %	294509105
20	NC_014025	CTAT	2	8	11628	11635	25 %	50 %	0 %	25 %	294509106
21	NC_014025	CAAA	2	8	11921	11928	75 %	0 %	0 %	25 %	294509106
22	NC_014025	ATTT	2	8	12468	12475	25 %	75 %	0 %	0 %	294509107
23	NC_014025	CTAA	2	8	12769	12776	50 %	25 %	0 %	25 %	294509108
24	NC_014025	TACT	2	8	13117	13124	25 %	50 %	0 %	25 %	294509108
25	NC_014025	CAAG	2	8	13168	13175	50 %	0 %	25 %	25 %	294509108
26	NC_014025	GTTG	2	8	13412	13419	0 %	50 %	50 %	0 %	294509109
27	NC_014025	GAAA	2	8	13919	13926	75 %	0 %	25 %	0 %	294509109
28	NC_014025	AATT	2	8	13933	13940	50 %	50 %	0 %	0 %	294509109
29	NC_014025	ATGT	2	8	14072	14079	25 %	50 %	25 %	0 %	294509109
30	NC_014025	TAAA	2	8	15417	15424	75 %	25 %	0 %	0 %	294509112
31	NC_014025	AACG	2	8	15832	15839	50 %	0 %	25 %	25 %	294509112
32	NC_014025	ATTT	2	8	16766	16773	25 %	75 %	0 %	0 %	294509114
33	NC_014025	AATA	2	8	16977	16984	75 %	25 %	0 %	0 %	294509114
34	NC_014025	ATGA	2	8	17083	17090	50 %	25 %	25 %	0 %	294509114
35	NC_014025	GAAC	2	8	17095	17102	50 %	0 %	25 %	25 %	294509114
36	NC_014025	CAAA	2	8	17199	17206	75 %	0 %	0 %	25 %	294509114
37	NC_014025	ATTC	2	8	17748	17755	25 %	50 %	0 %	25 %	294509115
38	NC_014025	CATT	2	8	17832	17839	25 %	50 %	0 %	25 %	294509115
39	NC_014025	GTTA	2	8	18293	18300	25 %	50 %	25 %	0 %	294509116
40	NC_014025	AATG	2	8	18789	18796	50 %	25 %	25 %	0 %	294509118
41	NC_014025	TGAT	2	8	19095	19102	25 %	50 %	25 %	0 %	294509118
42	NC_014025	AAAG	2	8	19228	19235	75 %	0 %	25 %	0 %	294509118
43	NC_014025	ATGT	2	8	19622	19629	25 %	50 %	25 %	0 %	294509120
44	NC_014025	CTTA	2	8	20442	20449	25 %	50 %	0 %	25 %	294509123
45	NC_014025	TAGG	2	8	20880	20887	25 %	25 %	50 %	0 %	294509124
46	NC_014025	AAAC	2	8	21124	21131	75 %	0 %	0 %	25 %	294509125
47	NC_014025	ACAA	2	8	21584	21591	75 %	0 %	0 %	25 %	294509127
48	NC_014025	ATTT	2	8	21647	21654	25 %	75 %	0 %	0 %	294509127
49	NC_014025	TATC	2	8	22716	22723	25 %	50 %	0 %	25 %	294509129
50	NC_014025	TAAA	2	8	22783	22790	75 %	25 %	0 %	0 %	294509129
51	NC_014025	TCGT	2	8	24254	24261	0 %	50 %	25 %	25 %	294509132
52	NC_014025	TTTC	2	8	25002	25009	0 %	75 %	0 %	25 %	294509135
53	NC_014025	AAAT	2	8	25015	25022	75 %	25 %	0 %	0 %	294509135
54	NC_014025	TTTC	2	8	26867	26874	0 %	75 %	0 %	25 %	294509136
55	NC_014025	AATA	2	8	26902	26909	75 %	25 %	0 %	0 %	294509136
56	NC_014025	TTAA	2	8	26960	26967	50 %	50 %	0 %	0 %	294509136
57	NC_014025	TCCA	2	8	27123	27130	25 %	25 %	0 %	50 %	294509136
58	NC_014025	ATTG	2	8	28791	28798	25 %	50 %	25 %	0 %	294509139
59	NC_014025	CATT	2	8	28879	28886	25 %	50 %	0 %	25 %	294509139
60	NC_014025	CTTT	2	8	28915	28922	0 %	75 %	0 %	25 %	294509139
61	NC_014025	AGCT	2	8	29059	29066	25 %	25 %	25 %	25 %	294509139
62	NC_014025	GAAT	2	8	29375	29382	50 %	25 %	25 %	0 %	294509139
63	NC_014025	GTTT	2	8	29478	29485	0 %	75 %	25 %	0 %	294509139
64	NC_014025	CTTT	2	8	29814	29821	0 %	75 %	0 %	25 %	294509139
65	NC_014025	GCTT	2	8	30273	30280	0 %	50 %	25 %	25 %	294509139
66	NC_014025	TAAG	2	8	30655	30662	50 %	25 %	25 %	0 %	294509140
67	NC_014025	AAAC	2	8	30776	30783	75 %	0 %	0 %	25 %	294509140
68	NC_014025	AATT	2	8	31333	31340	50 %	50 %	0 %	0 %	294509140
69	NC_014025	CAAT	2	8	31911	31918	50 %	25 %	0 %	25 %	294509141
70	NC_014025	GAAA	2	8	31980	31987	75 %	0 %	25 %	0 %	294509141
71	NC_014025	TTTA	2	8	32190	32197	25 %	75 %	0 %	0 %	294509142
72	NC_014025	TTGC	2	8	32394	32401	0 %	50 %	25 %	25 %	294509142
73	NC_014025	GCTT	2	8	32519	32526	0 %	50 %	25 %	25 %	294509143
74	NC_014025	TTGT	2	8	32631	32638	0 %	75 %	25 %	0 %	294509143
75	NC_014025	GTAT	2	8	32646	32653	25 %	50 %	25 %	0 %	294509143
76	NC_014025	AAAG	2	8	32855	32862	75 %	0 %	25 %	0 %	294509143
77	NC_014025	TTAC	2	8	32946	32953	25 %	50 %	0 %	25 %	294509143
78	NC_014025	TAAT	2	8	33419	33426	50 %	50 %	0 %	0 %	294509144
79	NC_014025	CATT	2	8	33467	33474	25 %	50 %	0 %	25 %	294509144
80	NC_014025	TTCT	2	8	33741	33748	0 %	75 %	0 %	25 %	294509144
81	NC_014025	TAAC	2	8	34289	34296	50 %	25 %	0 %	25 %	294509145
82	NC_014025	AAAG	2	8	34882	34889	75 %	0 %	25 %	0 %	294509146
83	NC_014025	TTCT	2	8	34986	34993	0 %	75 %	0 %	25 %	294509147
84	NC_014025	TAGA	2	8	34994	35001	50 %	25 %	25 %	0 %	294509147
85	NC_014025	GAAG	2	8	35038	35045	50 %	0 %	50 %	0 %	294509147
86	NC_014025	GAAC	2	8	35177	35184	50 %	0 %	25 %	25 %	294509147
87	NC_014025	ACTA	2	8	37633	37640	50 %	25 %	0 %	25 %	294509150
88	NC_014025	GAAA	2	8	37753	37760	75 %	0 %	25 %	0 %	294509150
89	NC_014025	TAAT	2	8	37988	37995	50 %	50 %	0 %	0 %	294509150
90	NC_014025	AGAT	2	8	38016	38023	50 %	25 %	25 %	0 %	294509150
91	NC_014025	ATAA	2	8	38300	38307	75 %	25 %	0 %	0 %	294509150
92	NC_014025	TAGT	2	8	38370	38377	25 %	50 %	25 %	0 %	294509150
93	NC_014025	ATAA	2	8	38581	38588	75 %	25 %	0 %	0 %	294509150
94	NC_014025	TAAT	2	8	38810	38817	50 %	50 %	0 %	0 %	294509151
95	NC_014025	ATAA	2	8	39111	39118	75 %	25 %	0 %	0 %	294509151
96	NC_014025	TTGC	2	8	39215	39222	0 %	50 %	25 %	25 %	294509151
97	NC_014025	ATTT	2	8	40156	40163	25 %	75 %	0 %	0 %	294509152
98	NC_014025	AATC	2	8	40494	40501	50 %	25 %	0 %	25 %	294509153
99	NC_014025	TAGC	2	8	40552	40559	25 %	25 %	25 %	25 %	294509153
100	NC_014025	ATTG	2	8	40969	40976	25 %	50 %	25 %	0 %	294509154
101	NC_014025	TTGA	2	8	42053	42060	25 %	50 %	25 %	0 %	294509155
102	NC_014025	TGGC	2	8	42205	42212	0 %	25 %	50 %	25 %	294509155
103	NC_014025	CTAA	2	8	42300	42307	50 %	25 %	0 %	25 %	294509155
104	NC_014025	TAAA	2	8	42582	42589	75 %	25 %	0 %	0 %	294509156
105	NC_014025	AAAC	2	8	42631	42638	75 %	0 %	0 %	25 %	294509157
106	NC_014025	CAAT	2	8	43449	43456	50 %	25 %	0 %	25 %	294509158
107	NC_014025	AAAG	2	8	43586	43593	75 %	0 %	25 %	0 %	294509158
108	NC_014025	TTTA	2	8	44428	44435	25 %	75 %	0 %	0 %	294509160
109	NC_014025	CTTC	2	8	44448	44455	0 %	50 %	0 %	50 %	294509160
110	NC_014025	GACT	2	8	44557	44564	25 %	25 %	25 %	25 %	294509160
111	NC_014025	ATCA	2	8	44917	44924	50 %	25 %	0 %	25 %	294509160
112	NC_014025	GCTG	2	8	45057	45064	0 %	25 %	50 %	25 %	294509160
113	NC_014025	GGAA	2	8	45643	45650	50 %	0 %	50 %	0 %	294509161
114	NC_014025	ACTA	2	8	46025	46032	50 %	25 %	0 %	25 %	294509162
115	NC_014025	AGTA	2	8	47372	47379	50 %	25 %	25 %	0 %	294509165
116	NC_014025	ATCT	2	8	47474	47481	25 %	50 %	0 %	25 %	294509165
117	NC_014025	TGAG	2	8	48205	48212	25 %	25 %	50 %	0 %	294509166
118	NC_014025	TTGA	2	8	48560	48567	25 %	50 %	25 %	0 %	294509166
119	NC_014025	ATAA	2	8	49058	49065	75 %	25 %	0 %	0 %	294509166
120	NC_014025	AACA	2	8	49530	49537	75 %	0 %	0 %	25 %	294509167
121	NC_014025	TTCT	2	8	49743	49750	0 %	75 %	0 %	25 %	294509167
122	NC_014025	ATCC	2	8	49811	49818	25 %	25 %	0 %	50 %	294509167
123	NC_014025	GAAA	2	8	49829	49836	75 %	0 %	25 %	0 %	294509167
124	NC_014025	AGTA	2	8	49930	49937	50 %	25 %	25 %	0 %	294509167
125	NC_014025	ATTT	2	8	50386	50393	25 %	75 %	0 %	0 %	294509167
126	NC_014025	CATA	2	8	50458	50465	50 %	25 %	0 %	25 %	294509167
127	NC_014025	CATT	2	8	51283	51290	25 %	50 %	0 %	25 %	294509168
128	NC_014025	CAGG	2	8	53592	53599	25 %	0 %	50 %	25 %	294509168
129	NC_014025	TAAT	2	8	54423	54430	50 %	50 %	0 %	0 %	294509170
130	NC_014025	TTTA	2	8	55133	55140	25 %	75 %	0 %	0 %	294509171
131	NC_014025	TCTA	2	8	55188	55195	25 %	50 %	0 %	25 %	294509171
132	NC_014025	CATT	2	8	55275	55282	25 %	50 %	0 %	25 %	294509171
133	NC_014025	TTAC	2	8	55865	55872	25 %	50 %	0 %	25 %	294509172
134	NC_014025	TATT	2	8	57356	57363	25 %	75 %	0 %	0 %	294509173
135	NC_014025	GATA	2	8	57925	57932	50 %	25 %	25 %	0 %	294509173
136	NC_014025	TGCT	2	8	60057	60064	0 %	50 %	25 %	25 %	294509177
137	NC_014025	ATCC	2	8	60832	60839	25 %	25 %	0 %	50 %	294509177
138	NC_014025	ACCA	2	8	61844	61851	50 %	0 %	0 %	50 %	294509179
139	NC_014025	GTAA	2	8	61941	61948	50 %	25 %	25 %	0 %	294509179
140	NC_014025	AGTG	2	8	62165	62172	25 %	25 %	50 %	0 %	294509179
141	NC_014025	GTTG	2	8	62708	62715	0 %	50 %	50 %	0 %	294509179
142	NC_014025	AGGA	2	8	63272	63279	50 %	0 %	50 %	0 %	294509180
143	NC_014025	ATTG	2	8	63345	63352	25 %	50 %	25 %	0 %	294509180
144	NC_014025	AGAA	2	8	64292	64299	75 %	0 %	25 %	0 %	294509182
145	NC_014025	GTTT	2	8	64481	64488	0 %	75 %	25 %	0 %	294509182
146	NC_014025	TGCT	2	8	64529	64536	0 %	50 %	25 %	25 %	294509183

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.