MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM500

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014025	AT	3	6	1376	1381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014025	AT	3	6	2207	2212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014025	TA	3	6	2373	2378	50 %	50 %	0 %	0 %	294509094
4	NC_014025	AT	3	6	3111	3116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014025	AG	3	6	3224	3229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014025	AC	3	6	3587	3592	50 %	0 %	0 %	50 %	294509095
7	NC_014025	AG	3	6	3713	3718	50 %	0 %	50 %	0 %	294509095
8	NC_014025	AG	3	6	4122	4127	50 %	0 %	50 %	0 %	294509096
9	NC_014025	TA	3	6	4809	4814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014025	TA	3	6	5291	5296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014025	GC	3	6	5704	5709	0 %	0 %	50 %	50 %	294509099
12	NC_014025	CT	4	8	6937	6944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014025	CA	3	6	7370	7375	50 %	0 %	0 %	50 %	294509100
14	NC_014025	TG	3	6	7477	7482	0 %	50 %	50 %	0 %	294509100
15	NC_014025	GA	3	6	7741	7746	50 %	0 %	50 %	0 %	294509101
16	NC_014025	GA	3	6	9031	9036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014025	TA	3	6	9228	9233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014025	CT	3	6	11251	11256	0 %	50 %	0 %	50 %	294509105
19	NC_014025	CT	3	6	11294	11299	0 %	50 %	0 %	50 %	294509105
20	NC_014025	AT	3	6	11442	11447	50 %	50 %	0 %	0 %	294509106
21	NC_014025	TA	3	6	12510	12515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014025	TA	3	6	12754	12759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014025	GA	3	6	13046	13051	50 %	0 %	50 %	0 %	294509108
24	NC_014025	CT	3	6	13136	13141	0 %	50 %	0 %	50 %	294509108
25	NC_014025	AG	3	6	14283	14288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014025	TA	3	6	14667	14672	50 %	50 %	0 %	0 %	294509110
27	NC_014025	AT	3	6	14855	14860	50 %	50 %	0 %	0 %	294509110
28	NC_014025	TA	3	6	15013	15018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014025	CA	3	6	15314	15319	50 %	0 %	0 %	50 %	294509112
30	NC_014025	GA	3	6	16035	16040	50 %	0 %	50 %	0 %	294509112
31	NC_014025	AT	3	6	17218	17223	50 %	50 %	0 %	0 %	294509114
32	NC_014025	AT	3	6	17280	17285	50 %	50 %	0 %	0 %	294509115
33	NC_014025	TA	3	6	17503	17508	50 %	50 %	0 %	0 %	294509115
34	NC_014025	AG	3	6	17528	17533	50 %	0 %	50 %	0 %	294509115
35	NC_014025	GA	3	6	18783	18788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014025	AC	3	6	19044	19049	50 %	0 %	0 %	50 %	294509118
37	NC_014025	AT	3	6	19211	19216	50 %	50 %	0 %	0 %	294509118
38	NC_014025	TA	3	6	19582	19587	50 %	50 %	0 %	0 %	294509120
39	NC_014025	TA	4	8	19996	20003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014025	CA	3	6	20528	20533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014025	GA	3	6	20778	20783	50 %	0 %	50 %	0 %	294509124
42	NC_014025	AT	4	8	21826	21833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014025	AT	3	6	22203	22208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014025	TA	3	6	22362	22367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014025	TA	3	6	22950	22955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014025	AG	3	6	23278	23283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014025	TA	3	6	23649	23654	50 %	50 %	0 %	0 %	294509131
48	NC_014025	TA	3	6	23830	23835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014025	AT	3	6	24783	24788	50 %	50 %	0 %	0 %	294509134
50	NC_014025	CT	3	6	24811	24816	0 %	50 %	0 %	50 %	294509134
51	NC_014025	AT	3	6	25320	25325	50 %	50 %	0 %	0 %	294509135
52	NC_014025	AC	3	6	26427	26432	50 %	0 %	0 %	50 %	294509136
53	NC_014025	TC	3	6	26451	26456	0 %	50 %	0 %	50 %	294509136
54	NC_014025	GA	3	6	26490	26495	50 %	0 %	50 %	0 %	294509136
55	NC_014025	AG	4	8	27813	27820	50 %	0 %	50 %	0 %	294509138
56	NC_014025	AT	3	6	29115	29120	50 %	50 %	0 %	0 %	294509139
57	NC_014025	AT	3	6	29163	29168	50 %	50 %	0 %	0 %	294509139
58	NC_014025	GA	3	6	30364	30369	50 %	0 %	50 %	0 %	294509139
59	NC_014025	AT	3	6	30738	30743	50 %	50 %	0 %	0 %	294509140
60	NC_014025	AG	3	6	30985	30990	50 %	0 %	50 %	0 %	294509140
61	NC_014025	TA	3	6	34268	34273	50 %	50 %	0 %	0 %	294509145
62	NC_014025	GA	3	6	35208	35213	50 %	0 %	50 %	0 %	294509147
63	NC_014025	CT	3	6	35388	35393	0 %	50 %	0 %	50 %	294509147
64	NC_014025	AT	3	6	36278	36283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014025	TA	3	6	37327	37332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014025	AT	3	6	38857	38862	50 %	50 %	0 %	0 %	294509151
67	NC_014025	TA	3	6	39453	39458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014025	TA	3	6	39509	39514	50 %	50 %	0 %	0 %	294509152
69	NC_014025	AT	4	8	39645	39652	50 %	50 %	0 %	0 %	294509152
70	NC_014025	AT	3	6	40251	40256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014025	AG	3	6	40283	40288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014025	TA	3	6	40292	40297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014025	TA	3	6	40413	40418	50 %	50 %	0 %	0 %	294509153
74	NC_014025	TC	3	6	40653	40658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014025	AT	3	6	40677	40682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014025	TA	3	6	41206	41211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014025	TA	4	8	41258	41265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014025	TC	3	6	41375	41380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014025	TA	3	6	41452	41457	50 %	50 %	0 %	0 %	294509155
80	NC_014025	AG	3	6	41779	41784	50 %	0 %	50 %	0 %	294509155
81	NC_014025	AT	3	6	42481	42486	50 %	50 %	0 %	0 %	294509156
82	NC_014025	AT	3	6	42575	42580	50 %	50 %	0 %	0 %	294509156
83	NC_014025	AT	3	6	42625	42630	50 %	50 %	0 %	0 %	294509157
84	NC_014025	TA	3	6	42790	42795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014025	TC	3	6	43121	43126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014025	AT	3	6	43506	43511	50 %	50 %	0 %	0 %	294509158
87	NC_014025	AG	3	6	43566	43571	50 %	0 %	50 %	0 %	294509158
88	NC_014025	CT	3	6	44532	44537	0 %	50 %	0 %	50 %	294509160
89	NC_014025	TA	3	6	45426	45431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014025	AT	3	6	45436	45441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014025	AT	3	6	45460	45465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014025	AT	4	8	45600	45607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014025	AT	4	8	45619	45626	50 %	50 %	0 %	0 %	294509161
94	NC_014025	AT	3	6	45960	45965	50 %	50 %	0 %	0 %	294509162
95	NC_014025	AT	3	6	46410	46415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014025	TA	3	6	46484	46489	50 %	50 %	0 %	0 %	294509163
97	NC_014025	TA	3	6	47439	47444	50 %	50 %	0 %	0 %	294509165
98	NC_014025	TA	4	8	47457	47464	50 %	50 %	0 %	0 %	294509165
99	NC_014025	AT	3	6	48023	48028	50 %	50 %	0 %	0 %	294509166
100	NC_014025	AT	3	6	50141	50146	50 %	50 %	0 %	0 %	294509167
101	NC_014025	CT	3	6	50414	50419	0 %	50 %	0 %	50 %	294509167
102	NC_014025	TG	3	6	50512	50517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014025	GA	3	6	51069	51074	50 %	0 %	50 %	0 %	294509168
104	NC_014025	CA	3	6	51275	51280	50 %	0 %	0 %	50 %	294509168
105	NC_014025	TA	3	6	53539	53544	50 %	50 %	0 %	0 %	294509168
106	NC_014025	TA	3	6	54145	54150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014025	AG	3	6	54166	54171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014025	AT	4	8	54237	54244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014025	AT	3	6	54499	54504	50 %	50 %	0 %	0 %	294509170
110	NC_014025	AT	3	6	54552	54557	50 %	50 %	0 %	0 %	294509170
111	NC_014025	TA	3	6	54600	54605	50 %	50 %	0 %	0 %	294509170
112	NC_014025	TA	3	6	55661	55666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014025	AT	3	6	56152	56157	50 %	50 %	0 %	0 %	294509172
114	NC_014025	TC	3	6	56943	56948	0 %	50 %	0 %	50 %	294509172
115	NC_014025	AT	3	6	57114	57119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014025	GA	3	6	57586	57591	50 %	0 %	50 %	0 %	294509173
117	NC_014025	TA	3	6	57707	57712	50 %	50 %	0 %	0 %	294509173
118	NC_014025	TC	3	6	57799	57804	0 %	50 %	0 %	50 %	294509173
119	NC_014025	CA	4	8	57939	57946	50 %	0 %	0 %	50 %	294509173
120	NC_014025	CT	3	6	58639	58644	0 %	50 %	0 %	50 %	294509175
121	NC_014025	AT	3	6	59363	59368	50 %	50 %	0 %	0 %	294509176
122	NC_014025	CT	3	6	60474	60479	0 %	50 %	0 %	50 %	294509177
123	NC_014025	CT	3	6	61131	61136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014025	TA	3	6	61540	61545	50 %	50 %	0 %	0 %	294509179
125	NC_014025	GA	3	6	62214	62219	50 %	0 %	50 %	0 %	294509179
126	NC_014025	AT	3	6	63217	63222	50 %	50 %	0 %	0 %	294509180
127	NC_014025	AT	3	6	63457	63462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014025	GA	3	6	63646	63651	50 %	0 %	50 %	0 %	294509181
129	NC_014025	AG	3	6	63857	63862	50 %	0 %	50 %	0 %	294509181
130	NC_014025	TA	3	6	63994	63999	50 %	50 %	0 %	0 %	294509181
131	NC_014025	TC	3	6	64728	64733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014025	AG	3	6	64901	64906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014025	CA	3	6	65699	65704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014025	TC	3	6	65735	65740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014025	CT	3	6	66323	66328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014025	AC	3	6	66535	66540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014025	AT	3	6	66596	66601	50 %	50 %	0 %	0 %	294509185
138	NC_014025	AT	3	6	66660	66665	50 %	50 %	0 %	0 %	294509185
139	NC_014025	CA	4	8	66763	66770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.