MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM700

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014023	AAAGAA	2	12	3577	3588	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294508919
2	NC_014023	ACTAAT	2	12	7727	7738	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294508924
3	NC_014023	CAAAAT	2	12	14109	14120	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294508935
4	NC_014023	GTCAGG	2	12	17947	17958	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294508938
5	NC_014023	TATAAT	2	12	18660	18671	50 %	50 %	0 %	0 %	294508939
6	NC_014023	AAACTA	2	12	19109	19120	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294508940
7	NC_014023	CAATAG	2	12	19895	19906	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294508940
8	NC_014023	ATTCCA	2	12	19963	19974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294508940
9	NC_014023	AACTTA	2	12	23220	23231	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294508944
10	NC_014023	GAAGCA	2	12	25639	25650	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294508947
11	NC_014023	CATTCC	2	12	28955	28966	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	294508950
12	NC_014023	ATACCA	2	12	33206	33217	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294508955
13	NC_014023	TGATTC	2	12	38444	38455	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294508959
14	NC_014023	AAATCA	2	12	40027	40038	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294508961
15	NC_014023	GGAAAT	2	12	40169	40180	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294508961
16	NC_014023	CCTAAG	2	12	40248	40259	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294508961
17	NC_014023	CCTTTT	2	12	42184	42195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294508965
18	NC_014023	TAAAAG	2	12	48925	48936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294508970
19	NC_014023	ATAGAA	2	12	49293	49304	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294508970
20	NC_014023	TTAAGT	2	12	50245	50256	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294508971
21	NC_014023	TGAGAT	2	12	55186	55197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294508976
22	NC_014023	CGAATT	2	12	57583	57594	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294508978
23	NC_014023	AATAAA	2	12	60372	60383	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294508982
24	NC_014023	TTTTTA	2	12	65318	65329	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294508988
25	NC_014023	ACTAAA	2	12	77003	77014	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294509000
26	NC_014023	TTTCCA	2	12	77917	77928	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294509001
27	NC_014023	ATCGAT	2	12	88496	88507	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294509014
28	NC_014023	TGGAAA	2	12	91771	91782	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294509018
29	NC_014023	ATATAA	2	12	102010	102021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294509032
30	NC_014023	GGTTTC	2	12	112107	112118	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294509040
31	NC_014023	TCTACA	2	12	121962	121973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294509053
32	NC_014023	ATTGAC	2	12	122148	122159	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294509053
33	NC_014023	TAAAAA	2	12	124046	124057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294509054
34	NC_014023	ATTTTA	2	12	125972	125983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294509056
35	NC_014023	AGGTTT	2	12	126609	126620	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294509056
36	NC_014023	AACTTA	2	12	131046	131057	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294509062
37	NC_014023	TTTCTT	2	12	136138	136149	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294509064
38	NC_014023	AAACTC	2	12	143442	143453	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294509072
39	NC_014023	ACTTAA	2	12	146098	146109	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294509074
40	NC_014023	GGTTTA	2	12	146729	146740	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294509074
41	NC_014023	ACCACA	2	12	148802	148813	50 %	0 %	0 %	50 %	294509076
42	NC_014023	TTCAAA	2	12	151394	151405	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294509079

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.