MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM700

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014023	TAATT	2	10	4114	4123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014023	TCTTT	2	10	4289	4298	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014023	ATTTT	2	10	5725	5734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014023	AAAAG	2	10	6146	6155	80 %	0 %	20 %	0 %	294508922
5	NC_014023	GGAAG	2	10	6593	6602	40 %	0 %	60 %	0 %	294508923
6	NC_014023	GAAAA	2	10	6651	6660	80 %	0 %	20 %	0 %	294508923
7	NC_014023	TTCTG	2	10	6693	6702	0 %	60 %	20 %	20 %	294508923
8	NC_014023	TATAC	2	10	6821	6830	40 %	40 %	0 %	20 %	294508923
9	NC_014023	CTCAT	2	10	7517	7526	20 %	40 %	0 %	40 %	294508924
10	NC_014023	GGAAG	2	10	9142	9151	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014023	TCTTT	2	10	9266	9275	0 %	80 %	0 %	20 %	294508926
12	NC_014023	GGTTA	2	10	9605	9614	20 %	40 %	40 %	0 %	294508926
13	NC_014023	TTGTA	2	10	10012	10021	20 %	60 %	20 %	0 %	294508927
14	NC_014023	GGGTA	2	10	10327	10336	20 %	20 %	60 %	0 %	294508928
15	NC_014023	ATTTT	2	10	10794	10803	20 %	80 %	0 %	0 %	294508930
16	NC_014023	AGAGA	2	10	12019	12028	60 %	0 %	40 %	0 %	294508932
17	NC_014023	GCAGC	2	10	13120	13129	20 %	0 %	40 %	40 %	294508934
18	NC_014023	TACTT	2	10	13429	13438	20 %	60 %	0 %	20 %	294508934
19	NC_014023	CTCTT	2	10	14284	14293	0 %	60 %	0 %	40 %	294508935
20	NC_014023	TTTAT	2	10	14483	14492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014023	TTTGA	2	10	14698	14707	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014023	TTTGG	2	10	16030	16039	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014023	AGAAA	2	10	18091	18100	80 %	0 %	20 %	0 %	294508938
24	NC_014023	ATTTT	2	10	18323	18332	20 %	80 %	0 %	0 %	294508938
25	NC_014023	CTAAA	2	10	19280	19289	60 %	20 %	0 %	20 %	294508940
26	NC_014023	ATATA	2	10	20907	20916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014023	TACAT	2	10	21086	21095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014023	CAATT	2	10	22130	22139	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014023	AAATA	2	10	23936	23945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014023	GAAGT	2	10	24577	24586	40 %	20 %	40 %	0 %	294508945
31	NC_014023	GAAAT	2	10	25609	25618	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014023	TATGA	2	10	25960	25969	40 %	40 %	20 %	0 %	294508947
33	NC_014023	ATTCA	2	10	26063	26072	40 %	40 %	0 %	20 %	294508947
34	NC_014023	GATTC	2	10	26163	26172	20 %	40 %	20 %	20 %	294508947
35	NC_014023	AAGAA	2	10	26421	26430	80 %	0 %	20 %	0 %	294508948
36	NC_014023	ATTTA	2	10	26675	26684	40 %	60 %	0 %	0 %	294508948
37	NC_014023	ATAAA	2	10	30532	30541	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014023	TATTT	2	10	30687	30696	20 %	80 %	0 %	0 %	294508953
39	NC_014023	CATAT	2	10	32334	32343	40 %	40 %	0 %	20 %	294508954
40	NC_014023	TCCAA	2	10	33808	33817	40 %	20 %	0 %	40 %	294508955
41	NC_014023	AGAAA	2	10	34099	34108	80 %	0 %	20 %	0 %	294508955
42	NC_014023	TCGCT	2	10	36155	36164	0 %	40 %	20 %	40 %	294508957
43	NC_014023	TAAAT	2	10	39364	39373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014023	TAATT	2	10	39387	39396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014023	AAATA	2	10	41220	41229	80 %	20 %	0 %	0 %	294508962
46	NC_014023	TATAT	2	10	42145	42154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014023	CTTAC	2	10	43493	43502	20 %	40 %	0 %	40 %	294508966
48	NC_014023	TTTCT	2	10	44277	44286	0 %	80 %	0 %	20 %	294508967
49	NC_014023	CAATA	2	10	46311	46320	60 %	20 %	0 %	20 %	294508968
50	NC_014023	AATTA	2	10	48221	48230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014023	TGCCA	2	10	48695	48704	20 %	20 %	20 %	40 %	294508970
52	NC_014023	AAAAT	2	10	48856	48865	80 %	20 %	0 %	0 %	294508970
53	NC_014023	ATGTA	2	10	49791	49800	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014023	AATAT	2	10	50050	50059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014023	TTTTA	2	10	53882	53891	20 %	80 %	0 %	0 %	294508975
56	NC_014023	ATTTT	2	10	55674	55683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014023	AATAA	2	10	56103	56112	80 %	20 %	0 %	0 %	294508977
58	NC_014023	ATGGA	2	10	57299	57308	40 %	20 %	40 %	0 %	294508978
59	NC_014023	TAAAA	2	10	57531	57540	80 %	20 %	0 %	0 %	294508978
60	NC_014023	GGGAT	2	10	59092	59101	20 %	20 %	60 %	0 %	294508980
61	NC_014023	ACTTA	2	10	60550	60559	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014023	GAAAA	2	10	60843	60852	80 %	0 %	20 %	0 %	294508984
63	NC_014023	GTAAC	2	10	62365	62374	40 %	20 %	20 %	20 %	294508986
64	NC_014023	GGAAT	2	10	64746	64755	40 %	20 %	40 %	0 %	294508987
65	NC_014023	CTTTA	2	10	65149	65158	20 %	60 %	0 %	20 %	294508988
66	NC_014023	GCTTG	2	10	66306	66315	0 %	40 %	40 %	20 %	294508989
67	NC_014023	TTTAT	2	10	66463	66472	20 %	80 %	0 %	0 %	294508989
68	NC_014023	ATTAA	2	10	68829	68838	60 %	40 %	0 %	0 %	294508992
69	NC_014023	ATCCA	3	15	69081	69095	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014023	TCAAT	2	10	69971	69980	40 %	40 %	0 %	20 %	294508993
71	NC_014023	TAAAT	2	10	71212	71221	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014023	ACATA	2	10	72268	72277	60 %	20 %	0 %	20 %	294508995
73	NC_014023	GTAGA	2	10	72720	72729	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014023	GAATA	2	10	73780	73789	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014023	GTAAC	2	10	74957	74966	40 %	20 %	20 %	20 %	294508998
76	NC_014023	ACTTT	2	10	76276	76285	20 %	60 %	0 %	20 %	294509000
77	NC_014023	AATAG	2	10	77762	77771	60 %	20 %	20 %	0 %	294509000
78	NC_014023	AATAT	2	10	78525	78534	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014023	AGATT	2	10	79894	79903	40 %	40 %	20 %	0 %	294509003
80	NC_014023	TTTCA	2	10	80530	80539	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014023	GATTT	2	10	80907	80916	20 %	60 %	20 %	0 %	294509004
82	NC_014023	TTAAA	2	10	81170	81179	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014023	ACTTC	2	10	81789	81798	20 %	40 %	0 %	40 %	294509006
84	NC_014023	CCATT	2	10	83143	83152	20 %	40 %	0 %	40 %	294509006
85	NC_014023	TAAAC	2	10	83383	83392	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014023	ATAAA	2	10	83401	83410	80 %	20 %	0 %	0 %	294509007
87	NC_014023	TTCAT	2	10	83414	83423	20 %	60 %	0 %	20 %	294509007
88	NC_014023	ATAAA	2	10	83688	83697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014023	TATTG	2	10	84022	84031	20 %	60 %	20 %	0 %	294509008
90	NC_014023	GCTTT	2	10	86910	86919	0 %	60 %	20 %	20 %	294509011
91	NC_014023	GGTTA	2	10	86959	86968	20 %	40 %	40 %	0 %	294509011
92	NC_014023	AAAGA	2	10	87001	87010	80 %	0 %	20 %	0 %	294509011
93	NC_014023	TTTTA	2	10	89178	89187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014023	TTTAA	2	10	89802	89811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014023	TATAC	2	10	90168	90177	40 %	40 %	0 %	20 %	294509016
96	NC_014023	ATATC	2	10	93042	93051	40 %	40 %	0 %	20 %	294509020
97	NC_014023	TATAT	2	10	93248	93257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014023	AATTG	2	10	93815	93824	40 %	40 %	20 %	0 %	294509021
99	NC_014023	GGGAT	2	10	94029	94038	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014023	AATAC	2	10	95339	95348	60 %	20 %	0 %	20 %	294509023
101	NC_014023	CTAAT	2	10	97507	97516	40 %	40 %	0 %	20 %	294509026
102	NC_014023	GCTAT	2	10	99026	99035	20 %	40 %	20 %	20 %	294509028
103	NC_014023	AAAGA	2	10	99271	99280	80 %	0 %	20 %	0 %	294509028
104	NC_014023	GAAAG	2	10	99907	99916	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014023	AATAA	2	10	99924	99933	80 %	20 %	0 %	0 %	294509029
106	NC_014023	AAAGA	2	10	100220	100229	80 %	0 %	20 %	0 %	294509029
107	NC_014023	TCATT	2	10	101422	101431	20 %	60 %	0 %	20 %	294509030
108	NC_014023	TAGGA	2	10	101434	101443	40 %	20 %	40 %	0 %	294509030
109	NC_014023	CAAAA	2	10	101618	101627	80 %	0 %	0 %	20 %	294509031
110	NC_014023	TCTCT	2	10	101817	101826	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_014023	TTTTA	2	10	103373	103382	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014023	TTAAA	2	10	103638	103647	60 %	40 %	0 %	0 %	294509034
113	NC_014023	TGTCA	2	10	105175	105184	20 %	40 %	20 %	20 %	294509035
114	NC_014023	AATGA	2	10	106164	106173	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014023	GAAGC	2	10	106845	106854	40 %	0 %	40 %	20 %	294509037
116	NC_014023	GATGT	2	10	107968	107977	20 %	40 %	40 %	0 %	294509038
117	NC_014023	CTTTG	2	10	109341	109350	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014023	AAAAT	2	10	109576	109585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014023	ATCAT	2	10	110527	110536	40 %	40 %	0 %	20 %	294509039
120	NC_014023	TTAAA	2	10	110866	110875	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014023	ATTGC	2	10	111314	111323	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014023	GCCAT	2	10	111824	111833	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014023	GAAAA	2	10	111967	111976	80 %	0 %	20 %	0 %	294509040
124	NC_014023	TAAGC	2	10	113425	113434	40 %	20 %	20 %	20 %	294509044
125	NC_014023	CATGT	2	10	114846	114855	20 %	40 %	20 %	20 %	294509046
126	NC_014023	AAGGT	2	10	117557	117566	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014023	GTGTT	2	10	117667	117676	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014023	CTTTA	2	10	124978	124987	20 %	60 %	0 %	20 %	294509055
129	NC_014023	TATAA	2	10	126350	126359	60 %	40 %	0 %	0 %	294509056
130	NC_014023	AAATA	2	10	126705	126714	80 %	20 %	0 %	0 %	294509056
131	NC_014023	CTGTT	2	10	127020	127029	0 %	60 %	20 %	20 %	294509056
132	NC_014023	AAGAT	2	10	127194	127203	60 %	20 %	20 %	0 %	294509057
133	NC_014023	TTCAT	2	10	127244	127253	20 %	60 %	0 %	20 %	294509057
134	NC_014023	AAATA	2	10	128726	128735	80 %	20 %	0 %	0 %	294509059
135	NC_014023	CTGTG	2	10	128897	128906	0 %	40 %	40 %	20 %	294509059
136	NC_014023	TTTTC	2	10	129721	129730	0 %	80 %	0 %	20 %	294509060
137	NC_014023	AAAGA	2	10	130337	130346	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014023	CTTGC	2	10	133815	133824	0 %	40 %	20 %	40 %	294509063
139	NC_014023	AAATC	2	10	136519	136528	60 %	20 %	0 %	20 %	294509064
140	NC_014023	TATAA	2	10	137473	137482	60 %	40 %	0 %	0 %	294509064
141	NC_014023	ATTTA	2	10	137941	137950	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_014023	AAATA	2	10	163204	163213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_014023	TTTAT	2	10	164286	164295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.