MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM700

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014023	TAATT	2	10	4114	4123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014023	TCTTT	2	10	4289	4298	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014023	ATTTT	2	10	5725	5734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014023	GGAAG	2	10	9142	9151	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014023	TTTAT	2	10	14483	14492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014023	TTTGA	2	10	14698	14707	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014023	TTTGG	2	10	16030	16039	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014023	ATATA	2	10	20907	20916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014023	TACAT	2	10	21086	21095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014023	CAATT	2	10	22130	22139	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014023	AAATA	2	10	23936	23945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014023	GAAAT	2	10	25609	25618	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014023	ATAAA	2	10	30532	30541	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014023	TAAAT	2	10	39364	39373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014023	TAATT	2	10	39387	39396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014023	TATAT	2	10	42145	42154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014023	AATTA	2	10	48221	48230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014023	ATGTA	2	10	49791	49800	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014023	AATAT	2	10	50050	50059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014023	ATTTT	2	10	55674	55683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014023	ACTTA	2	10	60550	60559	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014023	ATCCA	3	15	69081	69095	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014023	TAAAT	2	10	71212	71221	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014023	GTAGA	2	10	72720	72729	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014023	GAATA	2	10	73780	73789	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014023	AATAT	2	10	78525	78534	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014023	TTTCA	2	10	80530	80539	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014023	TTAAA	2	10	81170	81179	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014023	TAAAC	2	10	83383	83392	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014023	ATAAA	2	10	83688	83697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014023	TTTTA	2	10	89178	89187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014023	TTTAA	2	10	89802	89811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014023	TATAT	2	10	93248	93257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014023	GGGAT	2	10	94029	94038	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014023	GAAAG	2	10	99907	99916	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014023	TCTCT	2	10	101817	101826	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014023	TTTTA	2	10	103373	103382	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014023	AATGA	2	10	106164	106173	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014023	CTTTG	2	10	109341	109350	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014023	AAAAT	2	10	109576	109585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014023	TTAAA	2	10	110866	110875	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014023	ATTGC	2	10	111314	111323	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014023	GCCAT	2	10	111824	111833	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014023	AAGGT	2	10	117557	117566	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014023	GTGTT	2	10	117667	117676	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014023	AAAGA	2	10	130337	130346	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014023	ATTTA	2	10	137941	137950	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014023	AGTAT	2	10	138031	138040	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014023	TTGCC	2	10	142103	142112	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_014023	TTTTA	2	10	152116	152125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014023	TATTT	2	10	159537	159546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014023	TACTT	2	10	160139	160148	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014023	CCAAG	2	10	161138	161147	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014023	CTTCG	2	10	161992	162001	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014023	TAGGC	2	10	162358	162367	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014023	AAATA	2	10	163204	163213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014023	TAAAA	2	10	164268	164277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014023	TTTAT	2	10	164286	164295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.