MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pMT1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014022	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014022	CTAC	3	12	2009	2020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014022	CCAA	2	8	2710	2717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014022	ACTT	2	8	5867	5874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014022	AAAG	2	8	5889	5896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014022	GCGA	2	8	18463	18470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014022	CGCA	2	8	18496	18503	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014022	TTAC	2	8	23171	23178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014022	TAGG	2	8	26542	26549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014022	TTTG	2	8	28898	28905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014022	TACT	3	12	32082	32093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014022	ATTT	2	8	35114	35121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014022	ATAA	3	12	35266	35277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014022	AAAG	2	8	36885	36892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014022	GGTG	2	8	37534	37541	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014022	ACCT	2	8	38731	38738	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014022	TAAG	2	8	43418	43425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014022	TCGT	2	8	44961	44968	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014022	GTTT	2	8	46140	46147	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014022	ACCA	2	8	46365	46372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014022	AATG	2	8	47689	47696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014022	TGAA	2	8	47954	47961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014022	TGGT	2	8	48109	48116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014022	TTAT	2	8	49185	49192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014022	TGAG	2	8	51001	51008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014022	AGTA	2	8	51217	51224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014022	CGAG	2	8	54722	54729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014022	TACT	2	8	54746	54753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014022	GAAA	2	8	55244	55251	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014022	GAAG	2	8	55270	55277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014022	TCGT	2	8	61740	61747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014022	AGTA	2	8	61782	61789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014022	TAGG	2	8	64276	64283	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014022	TGTT	2	8	64344	64351	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014022	CCAT	2	8	64437	64444	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014022	GAAA	2	8	64676	64683	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014022	GAAA	2	8	66529	66536	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014022	AGGG	2	8	66546	66553	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014022	TTTA	2	8	71045	71052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014022	CTTG	2	8	71089	71096	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014022	AGCC	2	8	72282	72289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014022	GCTG	2	8	72364	72371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014022	AACC	2	8	72400	72407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014022	GTCT	2	8	75939	75946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014022	GATA	2	8	76218	76225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014022	GCAA	2	8	76319	76326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014022	CAGG	2	8	76370	76377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014022	GCTG	2	8	76431	76438	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014022	CATA	2	8	79928	79935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014022	AGCG	2	8	80605	80612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014022	CCTG	2	8	82497	82504	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014022	TTTG	2	8	85548	85555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014022	AGGC	2	8	85662	85669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014022	AATG	2	8	87271	87278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014022	CCAG	2	8	87998	88005	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014022	TCGC	2	8	90536	90543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014022	CTGC	2	8	91248	91255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014022	AAGA	2	8	92131	92138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.