MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pMT1

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014022	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	294501993
2	NC_014022	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	294501993
3	NC_014022	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	294501993
4	NC_014022	CTCA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	0 %	50 %	294501994
5	NC_014022	TCAG	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	294501994
6	NC_014022	CAGA	2	8	1840	1847	50 %	0 %	25 %	25 %	294501994
7	NC_014022	TTTA	2	8	2021	2028	25 %	75 %	0 %	0 %	294501995
8	NC_014022	TGAG	2	8	3064	3071	25 %	25 %	50 %	0 %	294501996
9	NC_014022	GGTT	2	8	3400	3407	0 %	50 %	50 %	0 %	294501996
10	NC_014022	AGCC	2	8	4173	4180	25 %	0 %	25 %	50 %	294501996
11	NC_014022	TCCA	2	8	4258	4265	25 %	25 %	0 %	50 %	294501996
12	NC_014022	CTAT	2	8	4481	4488	25 %	50 %	0 %	25 %	294501996
13	NC_014022	CTTC	2	8	5613	5620	0 %	50 %	0 %	50 %	294501996
14	NC_014022	TCGT	2	8	5997	6004	0 %	50 %	25 %	25 %	294501997
15	NC_014022	ATTA	2	8	6246	6253	50 %	50 %	0 %	0 %	294501997
16	NC_014022	TTCA	2	8	6566	6573	25 %	50 %	0 %	25 %	294501998
17	NC_014022	GATT	2	8	6666	6673	25 %	50 %	25 %	0 %	294501998
18	NC_014022	CTGC	2	8	7029	7036	0 %	25 %	25 %	50 %	294501998
19	NC_014022	CTGC	2	8	7189	7196	0 %	25 %	25 %	50 %	294501998
20	NC_014022	TGTT	2	8	8550	8557	0 %	75 %	25 %	0 %	294501998
21	NC_014022	CAAC	2	8	8800	8807	50 %	0 %	0 %	50 %	294501998
22	NC_014022	TTGA	2	8	9174	9181	25 %	50 %	25 %	0 %	294501998
23	NC_014022	ACGC	2	8	9380	9387	25 %	0 %	25 %	50 %	294501998
24	NC_014022	AAGG	2	8	9680	9687	50 %	0 %	50 %	0 %	294501998
25	NC_014022	TGCG	2	8	9730	9737	0 %	25 %	50 %	25 %	294501998
26	NC_014022	GACG	2	8	9909	9916	25 %	0 %	50 %	25 %	294501998
27	NC_014022	CAGG	2	8	10266	10273	25 %	0 %	50 %	25 %	294501998
28	NC_014022	ACGA	2	8	10381	10388	50 %	0 %	25 %	25 %	294501998
29	NC_014022	CCAC	2	8	10489	10496	25 %	0 %	0 %	75 %	294501998
30	NC_014022	TGAC	2	8	10846	10853	25 %	25 %	25 %	25 %	294501998
31	NC_014022	CTGC	2	8	11326	11333	0 %	25 %	25 %	50 %	294501999
32	NC_014022	ACCA	2	8	11467	11474	50 %	0 %	0 %	50 %	294501999
33	NC_014022	AACT	2	8	11762	11769	50 %	25 %	0 %	25 %	294501999
34	NC_014022	TGAA	2	8	11939	11946	50 %	25 %	25 %	0 %	294502000
35	NC_014022	TTCG	2	8	12478	12485	0 %	50 %	25 %	25 %	294502000
36	NC_014022	AGAT	2	8	12506	12513	50 %	25 %	25 %	0 %	294502000
37	NC_014022	GCGT	2	8	12620	12627	0 %	25 %	50 %	25 %	294502001
38	NC_014022	AGTC	2	8	13663	13670	25 %	25 %	25 %	25 %	294502002
39	NC_014022	GTTA	2	8	13718	13725	25 %	50 %	25 %	0 %	294502003
40	NC_014022	GTTG	2	8	14421	14428	0 %	50 %	50 %	0 %	294502003
41	NC_014022	TGCC	2	8	14867	14874	0 %	25 %	25 %	50 %	294502003
42	NC_014022	GCCG	2	8	15309	15316	0 %	0 %	50 %	50 %	294502003
43	NC_014022	CTTC	2	8	15338	15345	0 %	50 %	0 %	50 %	294502003
44	NC_014022	AGCC	2	8	16779	16786	25 %	0 %	25 %	50 %	294502003
45	NC_014022	CGAA	2	8	16847	16854	50 %	0 %	25 %	25 %	294502003
46	NC_014022	AAGC	2	8	16880	16887	50 %	0 %	25 %	25 %	294502003
47	NC_014022	CGCA	2	8	17025	17032	25 %	0 %	25 %	50 %	294502003
48	NC_014022	CAAG	2	8	17555	17562	50 %	0 %	25 %	25 %	294502003
49	NC_014022	CGCC	2	8	17608	17615	0 %	0 %	25 %	75 %	294502003
50	NC_014022	CATC	2	8	17729	17736	25 %	25 %	0 %	50 %	294502003
51	NC_014022	CCCG	2	8	18226	18233	0 %	0 %	25 %	75 %	294502003
52	NC_014022	CAGT	2	8	18740	18747	25 %	25 %	25 %	25 %	294502004
53	NC_014022	CAGT	2	8	19219	19226	25 %	25 %	25 %	25 %	294502005
54	NC_014022	TCAA	2	8	19895	19902	50 %	25 %	0 %	25 %	294502006
55	NC_014022	AACC	2	8	19948	19955	50 %	0 %	0 %	50 %	294502006
56	NC_014022	TGGC	2	8	20148	20155	0 %	25 %	50 %	25 %	294502006
57	NC_014022	GATA	2	8	20388	20395	50 %	25 %	25 %	0 %	294502007
58	NC_014022	CAGA	2	8	21268	21275	50 %	0 %	25 %	25 %	294502009
59	NC_014022	TGAA	2	8	22861	22868	50 %	25 %	25 %	0 %	294502011
60	NC_014022	ACGG	2	8	22926	22933	25 %	0 %	50 %	25 %	294502011
61	NC_014022	AAGC	2	8	22980	22987	50 %	0 %	25 %	25 %	294502011
62	NC_014022	GCTC	2	8	23008	23015	0 %	25 %	25 %	50 %	294502011
63	NC_014022	GCAG	2	8	23370	23377	25 %	0 %	50 %	25 %	294502012
64	NC_014022	TGCT	2	8	23382	23389	0 %	50 %	25 %	25 %	294502012
65	NC_014022	CGAT	2	8	23987	23994	25 %	25 %	25 %	25 %	294502012
66	NC_014022	GGCT	2	8	24324	24331	0 %	25 %	50 %	25 %	294502013
67	NC_014022	GAAG	2	8	24444	24451	50 %	0 %	50 %	0 %	294502013
68	NC_014022	CATC	2	8	24881	24888	25 %	25 %	0 %	50 %	294502013
69	NC_014022	TAAG	2	8	25028	25035	50 %	25 %	25 %	0 %	294502014
70	NC_014022	GTCA	2	8	25222	25229	25 %	25 %	25 %	25 %	294502014
71	NC_014022	CCAT	2	8	25293	25300	25 %	25 %	0 %	50 %	294502014
72	NC_014022	GATG	2	8	26158	26165	25 %	25 %	50 %	0 %	294502014
73	NC_014022	ATGA	2	8	26269	26276	50 %	25 %	25 %	0 %	294502014
74	NC_014022	CGCC	2	8	26414	26421	0 %	0 %	25 %	75 %	294502014
75	NC_014022	ACTT	2	8	26551	26558	25 %	50 %	0 %	25 %	294502015
76	NC_014022	GTGC	2	8	26871	26878	0 %	25 %	50 %	25 %	294502015
77	NC_014022	CCGA	2	8	28158	28165	25 %	0 %	25 %	50 %	294502016
78	NC_014022	CGCA	2	8	28227	28234	25 %	0 %	25 %	50 %	294502016
79	NC_014022	ACTC	2	8	29222	29229	25 %	25 %	0 %	50 %	294502017
80	NC_014022	CGGA	2	8	29331	29338	25 %	0 %	50 %	25 %	294502017
81	NC_014022	TGTC	2	8	29810	29817	0 %	50 %	25 %	25 %	294502017
82	NC_014022	GCGG	2	8	30189	30196	0 %	0 %	75 %	25 %	294502018
83	NC_014022	CAGC	2	8	30712	30719	25 %	0 %	25 %	50 %	294502019
84	NC_014022	GCAA	2	8	30795	30802	50 %	0 %	25 %	25 %	294502019
85	NC_014022	CCAG	2	8	31173	31180	25 %	0 %	25 %	50 %	294502019
86	NC_014022	CTCG	2	8	31548	31555	0 %	25 %	25 %	50 %	294502020
87	NC_014022	AATC	2	8	32610	32617	50 %	25 %	0 %	25 %	294502021
88	NC_014022	AATA	2	8	33575	33582	75 %	25 %	0 %	0 %	294502021
89	NC_014022	CATC	2	8	34225	34232	25 %	25 %	0 %	50 %	294502022
90	NC_014022	AGCA	2	8	35560	35567	50 %	0 %	25 %	25 %	294502024
91	NC_014022	CCAA	2	8	35823	35830	50 %	0 %	0 %	50 %	294502024
92	NC_014022	AATC	2	8	35833	35840	50 %	25 %	0 %	25 %	294502024
93	NC_014022	TAAT	2	8	35963	35970	50 %	50 %	0 %	0 %	294502024
94	NC_014022	GCCA	2	8	36922	36929	25 %	0 %	25 %	50 %	294502025
95	NC_014022	TTAC	2	8	38085	38092	25 %	50 %	0 %	25 %	294502026
96	NC_014022	TTGC	2	8	38875	38882	0 %	50 %	25 %	25 %	294502027
97	NC_014022	CTTC	2	8	38934	38941	0 %	50 %	0 %	50 %	294502027
98	NC_014022	CACG	2	8	39010	39017	25 %	0 %	25 %	50 %	294502027
99	NC_014022	ATCA	2	8	39469	39476	50 %	25 %	0 %	25 %	294502028
100	NC_014022	GCGT	2	8	39691	39698	0 %	25 %	50 %	25 %	294502028
101	NC_014022	TGCG	2	8	40055	40062	0 %	25 %	50 %	25 %	294502028
102	NC_014022	CGAG	2	8	41048	41055	25 %	0 %	50 %	25 %	294502029
103	NC_014022	AGCG	2	8	41223	41230	25 %	0 %	50 %	25 %	294502029
104	NC_014022	GCCA	2	8	41267	41274	25 %	0 %	25 %	50 %	294502029
105	NC_014022	TGCG	2	8	41413	41420	0 %	25 %	50 %	25 %	294502029
106	NC_014022	AGCC	2	8	42608	42615	25 %	0 %	25 %	50 %	294502030
107	NC_014022	CCTG	2	8	43848	43855	0 %	25 %	25 %	50 %	294502031
108	NC_014022	GAAA	2	8	44316	44323	75 %	0 %	25 %	0 %	294502031
109	NC_014022	CAAG	2	8	44718	44725	50 %	0 %	25 %	25 %	294502031
110	NC_014022	TGTT	2	8	45661	45668	0 %	75 %	25 %	0 %	294502032
111	NC_014022	GCGT	2	8	45725	45732	0 %	25 %	50 %	25 %	294502032
112	NC_014022	CAAC	2	8	48334	48341	50 %	0 %	0 %	50 %	294502034
113	NC_014022	CTGG	2	8	49764	49771	0 %	25 %	50 %	25 %	294502036
114	NC_014022	TCAT	2	8	49990	49997	25 %	50 %	0 %	25 %	294502036
115	NC_014022	CCCA	2	8	50460	50467	25 %	0 %	0 %	75 %	294502037
116	NC_014022	TACC	2	8	50488	50495	25 %	25 %	0 %	50 %	294502037
117	NC_014022	TTAC	2	8	50977	50984	25 %	50 %	0 %	25 %	294502037
118	NC_014022	TCGC	2	8	51307	51314	0 %	25 %	25 %	50 %	294502038
119	NC_014022	AACA	2	8	52641	52648	75 %	0 %	0 %	25 %	294502039
120	NC_014022	TGGG	2	8	52745	52752	0 %	25 %	75 %	0 %	294502039
121	NC_014022	ATCC	2	8	53396	53403	25 %	25 %	0 %	50 %	294502039
122	NC_014022	GGGC	2	8	53416	53423	0 %	0 %	75 %	25 %	294502039
123	NC_014022	CAGC	2	8	53639	53646	25 %	0 %	25 %	50 %	294502040
124	NC_014022	TCAA	2	8	54241	54248	50 %	25 %	0 %	25 %	294502040
125	NC_014022	CAGA	2	8	54284	54291	50 %	0 %	25 %	25 %	294502040
126	NC_014022	GGTT	2	8	54943	54950	0 %	50 %	50 %	0 %	294502041
127	NC_014022	TAAG	2	8	56197	56204	50 %	25 %	25 %	0 %	294502042
128	NC_014022	TTCA	2	8	58993	59000	25 %	50 %	0 %	25 %	294502044
129	NC_014022	CAGC	2	8	59364	59371	25 %	0 %	25 %	50 %	294502044
130	NC_014022	GGCG	2	8	60072	60079	0 %	0 %	75 %	25 %	294502044
131	NC_014022	TGGA	2	8	60531	60538	25 %	25 %	50 %	0 %	294502045
132	NC_014022	TGGC	2	8	60631	60638	0 %	25 %	50 %	25 %	294502045
133	NC_014022	CAGC	2	8	60723	60730	25 %	0 %	25 %	50 %	294502045
134	NC_014022	CTGG	2	8	60951	60958	0 %	25 %	50 %	25 %	294502045
135	NC_014022	CGAG	2	8	61070	61077	25 %	0 %	50 %	25 %	294502045
136	NC_014022	GTCA	2	8	61915	61922	25 %	25 %	25 %	25 %	294502046
137	NC_014022	ACGC	2	8	62399	62406	25 %	0 %	25 %	50 %	294502046
138	NC_014022	GCTC	2	8	62540	62547	0 %	25 %	25 %	50 %	294502046
139	NC_014022	CAGA	2	8	62580	62587	50 %	0 %	25 %	25 %	294502046
140	NC_014022	GATG	2	8	65235	65242	25 %	25 %	50 %	0 %	294502048
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.