MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pMT1

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014022	TGG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014022	CGT	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014022	TGA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014022	CTT	2	6	11182	11187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014022	TTC	2	6	13256	13261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014022	ATA	2	6	13303	13308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014022	CAG	2	6	18553	18558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014022	AAT	2	6	21127	21132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014022	GGC	2	6	22429	22434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014022	GCC	2	6	22438	22443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014022	AAC	2	6	28499	28504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014022	TAA	2	6	28591	28596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014022	GGT	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014022	GGC	2	6	28736	28741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014022	CCA	2	6	28754	28759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014022	GCA	2	6	28820	28825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014022	AGC	2	6	28831	28836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014022	TGA	2	6	28886	28891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014022	TGA	2	6	29848	29853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014022	CGT	2	6	29932	29937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014022	ATC	2	6	29943	29948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014022	CTT	2	6	29995	30000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014022	CAG	2	6	30002	30007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014022	GTT	3	9	30023	30031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014022	ATA	2	6	32094	32099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014022	TCA	2	6	33818	33823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014022	GGC	2	6	33864	33869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014022	AGA	2	6	33942	33947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014022	TAA	2	6	35004	35009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014022	TTA	2	6	35024	35029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014022	GAA	2	6	35174	35179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014022	AGT	2	6	36139	36144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014022	CGA	2	6	36145	36150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014022	TTG	2	6	36340	36345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014022	CCG	2	6	36789	36794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014022	TGG	2	6	36875	36880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014022	TTG	2	6	37428	37433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014022	TGG	2	6	37485	37490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014022	GTT	2	6	37509	37514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014022	CCA	2	6	37578	37583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014022	ATC	2	6	37653	37658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014022	GAA	2	6	37757	37762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014022	TCC	2	6	37893	37898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014022	TTG	2	6	37920	37925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014022	TAA	2	6	37976	37981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014022	TCC	2	6	37985	37990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014022	TTG	2	6	38564	38569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014022	TCT	2	6	42166	42171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014022	AAC	2	6	43357	43362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014022	ACA	2	6	43367	43372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014022	AGA	2	6	43379	43384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014022	CAG	2	6	43521	43526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014022	TAT	2	6	43657	43662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014022	TAT	2	6	44796	44801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014022	TCT	2	6	44855	44860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014022	ACT	2	6	44865	44870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014022	GCC	3	9	44995	45003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014022	ATT	2	6	45829	45834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014022	AAT	2	6	45849	45854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014022	AGA	2	6	45877	45882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014022	ATA	2	6	45980	45985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014022	AGG	2	6	46045	46050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014022	CCA	2	6	46148	46153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014022	TGA	2	6	46418	46423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014022	CCA	2	6	46453	46458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014022	AAC	3	9	47640	47648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014022	GTT	2	6	47943	47948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014022	CAC	2	6	48002	48007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014022	CAG	2	6	48136	48141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014022	TCG	2	6	48162	48167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014022	TGG	2	6	48212	48217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014022	ATC	2	6	48732	48737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014022	ATA	2	6	48810	48815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014022	TAA	2	6	48818	48823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014022	AGC	2	6	48924	48929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014022	CGT	2	6	48948	48953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014022	GTC	2	6	48954	48959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014022	CAA	2	6	48967	48972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014022	CAA	2	6	48985	48990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014022	TCA	2	6	48997	49002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014022	TTC	2	6	49071	49076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014022	AAC	2	6	49105	49110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014022	TGA	2	6	49134	49139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014022	TTG	2	6	49171	49176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014022	CTT	2	6	50004	50009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014022	TTG	2	6	50083	50088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014022	ATA	2	6	50092	50097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014022	AAG	2	6	51075	51080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014022	ACC	2	6	51144	51149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014022	ATA	2	6	51211	51216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014022	CGT	2	6	52410	52415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014022	GAT	2	6	52441	52446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014022	CAG	2	6	52500	52505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014022	CCA	2	6	52527	52532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014022	AGA	2	6	52551	52556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014022	ATG	2	6	52601	52606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014022	ATA	2	6	54734	54739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014022	ATC	2	6	54755	54760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014022	TGA	2	6	55303	55308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014022	GGA	2	6	55414	55419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014022	CAG	2	6	55495	55500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014022	CAC	2	6	55563	55568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014022	TAG	2	6	55671	55676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014022	GCC	2	6	55692	55697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014022	CCG	2	6	56316	56321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014022	TGG	2	6	60393	60398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014022	TTA	2	6	64196	64201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014022	TGA	2	6	64330	64335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014022	TTC	2	6	64400	64405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014022	ATC	2	6	64510	64515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014022	TAC	3	9	64544	64552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014022	TTA	2	6	64760	64765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014022	GCT	2	6	66461	66466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014022	TTG	2	6	66467	66472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014022	GAT	2	6	66483	66488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014022	CTC	2	6	66505	66510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014022	ATT	2	6	66570	66575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014022	TAA	2	6	66580	66585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014022	AAC	2	6	66600	66605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014022	AAT	2	6	66620	66625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014022	AAT	2	6	66641	66646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014022	ATA	2	6	66727	66732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014022	TAT	2	6	66785	66790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014022	TAT	2	6	66825	66830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014022	AGG	2	6	66969	66974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014022	ATA	2	6	66977	66982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014022	CCT	2	6	66985	66990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014022	TAT	2	6	66996	67001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014022	AAT	2	6	67539	67544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014022	CAA	2	6	70047	70052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014022	ATT	2	6	70104	70109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014022	CCT	2	6	70915	70920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014022	ACA	2	6	70933	70938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014022	CAT	2	6	70956	70961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014022	CGA	2	6	70969	70974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014022	TAT	2	6	71209	71214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014022	CGC	2	6	72299	72304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014022	GAT	2	6	72379	72384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014022	CAA	2	6	72466	72471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014022	TAA	2	6	73783	73788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.