MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pMT1

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014022	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	294501993
2	NC_014022	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	294501993
3	NC_014022	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	294501993
4	NC_014022	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014022	GA	3	6	2327	2332	50 %	0 %	50 %	0 %	294501995
6	NC_014022	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	294501995
7	NC_014022	AT	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014022	TG	3	6	3012	3017	0 %	50 %	50 %	0 %	294501996
9	NC_014022	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	294501996
10	NC_014022	AC	3	6	3534	3539	50 %	0 %	0 %	50 %	294501996
11	NC_014022	AC	3	6	3570	3575	50 %	0 %	0 %	50 %	294501996
12	NC_014022	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	294501996
13	NC_014022	GC	3	6	5333	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	294501996
14	NC_014022	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	294501997
15	NC_014022	TC	3	6	6684	6689	0 %	50 %	0 %	50 %	294501998
16	NC_014022	AT	3	6	6695	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	294501998
17	NC_014022	CG	3	6	7422	7427	0 %	0 %	50 %	50 %	294501998
18	NC_014022	CT	3	6	8538	8543	0 %	50 %	0 %	50 %	294501998
19	NC_014022	CG	3	6	8726	8731	0 %	0 %	50 %	50 %	294501998
20	NC_014022	AG	3	6	8922	8927	50 %	0 %	50 %	0 %	294501998
21	NC_014022	TG	3	6	10328	10333	0 %	50 %	50 %	0 %	294501998
22	NC_014022	GT	3	6	11822	11827	0 %	50 %	50 %	0 %	294502000
23	NC_014022	AC	3	6	13102	13107	50 %	0 %	0 %	50 %	294502001
24	NC_014022	CG	3	6	13474	13479	0 %	0 %	50 %	50 %	294502002
25	NC_014022	GA	3	6	15222	15227	50 %	0 %	50 %	0 %	294502003
26	NC_014022	AG	3	6	15472	15477	50 %	0 %	50 %	0 %	294502003
27	NC_014022	GA	3	6	16905	16910	50 %	0 %	50 %	0 %	294502003
28	NC_014022	AC	3	6	17588	17593	50 %	0 %	0 %	50 %	294502003
29	NC_014022	AG	3	6	18991	18996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014022	CA	3	6	19176	19181	50 %	0 %	0 %	50 %	294502005
31	NC_014022	GA	3	6	19264	19269	50 %	0 %	50 %	0 %	294502005
32	NC_014022	TA	3	6	19833	19838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014022	CT	3	6	20314	20319	0 %	50 %	0 %	50 %	294502007
34	NC_014022	AG	3	6	23243	23248	50 %	0 %	50 %	0 %	294502012
35	NC_014022	AT	3	6	25014	25019	50 %	50 %	0 %	0 %	294502014
36	NC_014022	AG	3	6	25265	25270	50 %	0 %	50 %	0 %	294502014
37	NC_014022	CG	4	8	25977	25984	0 %	0 %	50 %	50 %	294502014
38	NC_014022	GC	4	8	26072	26079	0 %	0 %	50 %	50 %	294502014
39	NC_014022	AT	3	6	26847	26852	50 %	50 %	0 %	0 %	294502015
40	NC_014022	CA	3	6	26955	26960	50 %	0 %	0 %	50 %	294502015
41	NC_014022	CG	3	6	27670	27675	0 %	0 %	50 %	50 %	294502015
42	NC_014022	CA	3	6	27723	27728	50 %	0 %	0 %	50 %	294502015
43	NC_014022	GT	3	6	28367	28372	0 %	50 %	50 %	0 %	294502016
44	NC_014022	TA	3	6	28583	28588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014022	TA	4	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014022	TA	3	6	32074	32079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014022	CG	3	6	32624	32629	0 %	0 %	50 %	50 %	294502021
48	NC_014022	AG	3	6	33689	33694	50 %	0 %	50 %	0 %	294502021
49	NC_014022	GA	3	6	34243	34248	50 %	0 %	50 %	0 %	294502022
50	NC_014022	CG	3	6	34514	34519	0 %	0 %	50 %	50 %	294502023
51	NC_014022	TC	3	6	34561	34566	0 %	50 %	0 %	50 %	294502023
52	NC_014022	AT	3	6	35085	35090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014022	GC	3	6	36193	36198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014022	TG	3	6	36425	36430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014022	CT	3	6	36840	36845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014022	CA	3	6	38367	38372	50 %	0 %	0 %	50 %	294502026
57	NC_014022	AG	3	6	40302	40307	50 %	0 %	50 %	0 %	294502029
58	NC_014022	TG	3	6	40522	40527	0 %	50 %	50 %	0 %	294502029
59	NC_014022	GT	3	6	41620	41625	0 %	50 %	50 %	0 %	294502029
60	NC_014022	AG	3	6	42964	42969	50 %	0 %	50 %	0 %	294502030
61	NC_014022	AC	3	6	43916	43921	50 %	0 %	0 %	50 %	294502031
62	NC_014022	TC	4	8	44881	44888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014022	AG	3	6	45864	45869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014022	AG	3	6	45973	45978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014022	CT	3	6	46009	46014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014022	AT	3	6	46112	46117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014022	CA	3	6	46152	46157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014022	AG	3	6	46335	46340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014022	AG	3	6	46377	46382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014022	AG	3	6	47565	47570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014022	CT	3	6	47767	47772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014022	CT	3	6	47972	47977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014022	CG	4	8	48079	48086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014022	TG	3	6	48610	48615	0 %	50 %	50 %	0 %	294502034
75	NC_014022	TA	3	6	48863	48868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014022	GT	3	6	49371	49376	0 %	50 %	50 %	0 %	294502035
77	NC_014022	TA	3	6	51227	51232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014022	CG	4	8	51785	51792	0 %	0 %	50 %	50 %	294502038
79	NC_014022	AG	3	6	51897	51902	50 %	0 %	50 %	0 %	294502038
80	NC_014022	CG	3	6	53031	53036	0 %	0 %	50 %	50 %	294502039
81	NC_014022	GA	3	6	53204	53209	50 %	0 %	50 %	0 %	294502039
82	NC_014022	GT	4	8	53822	53829	0 %	50 %	50 %	0 %	294502040
83	NC_014022	CA	3	6	54392	54397	50 %	0 %	0 %	50 %	294502040
84	NC_014022	GA	3	6	54859	54864	50 %	0 %	50 %	0 %	294502041
85	NC_014022	TA	3	6	55225	55230	50 %	50 %	0 %	0 %	294502041
86	NC_014022	CT	3	6	55771	55776	0 %	50 %	0 %	50 %	294502042
87	NC_014022	CA	3	6	56179	56184	50 %	0 %	0 %	50 %	294502042
88	NC_014022	CG	3	6	58027	58032	0 %	0 %	50 %	50 %	294502044
89	NC_014022	CT	3	6	58541	58546	0 %	50 %	0 %	50 %	294502044
90	NC_014022	GT	3	6	59316	59321	0 %	50 %	50 %	0 %	294502044
91	NC_014022	TC	3	6	60052	60057	0 %	50 %	0 %	50 %	294502044
92	NC_014022	TC	3	6	60221	60226	0 %	50 %	0 %	50 %	294502044
93	NC_014022	AG	3	6	60456	60461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014022	AC	3	6	60960	60965	50 %	0 %	0 %	50 %	294502045
95	NC_014022	GT	3	6	61308	61313	0 %	50 %	50 %	0 %	294502045
96	NC_014022	GA	3	6	61518	61523	50 %	0 %	50 %	0 %	294502045
97	NC_014022	TA	3	6	61759	61764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014022	AT	3	6	61766	61771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014022	TG	3	6	63788	63793	0 %	50 %	50 %	0 %	294502046
100	NC_014022	CT	3	6	63894	63899	0 %	50 %	0 %	50 %	294502046
101	NC_014022	TG	3	6	64220	64225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014022	TC	3	6	64896	64901	0 %	50 %	0 %	50 %	294502047
103	NC_014022	CG	3	6	65810	65815	0 %	0 %	50 %	50 %	294502048
104	NC_014022	CT	3	6	66802	66807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014022	GA	3	6	67163	67168	50 %	0 %	50 %	0 %	294502049
106	NC_014022	AT	3	6	67522	67527	50 %	50 %	0 %	0 %	294502049
107	NC_014022	AG	3	6	67566	67571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014022	TC	3	6	67701	67706	0 %	50 %	0 %	50 %	294502050
109	NC_014022	TC	3	6	67990	67995	0 %	50 %	0 %	50 %	294502050
110	NC_014022	AC	3	6	68335	68340	50 %	0 %	0 %	50 %	294502050
111	NC_014022	GT	3	6	69106	69111	0 %	50 %	50 %	0 %	294502050
112	NC_014022	CT	3	6	69993	69998	0 %	50 %	0 %	50 %	294502050
113	NC_014022	CA	3	6	70078	70083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014022	AT	3	6	70510	70515	50 %	50 %	0 %	0 %	294502051
115	NC_014022	CT	3	6	70560	70565	0 %	50 %	0 %	50 %	294502051
116	NC_014022	CA	3	6	71059	71064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014022	AT	3	6	71269	71274	50 %	50 %	0 %	0 %	294502052
118	NC_014022	AT	3	6	71392	71397	50 %	50 %	0 %	0 %	294502052
119	NC_014022	AG	3	6	71635	71640	50 %	0 %	50 %	0 %	294502052
120	NC_014022	CA	3	6	72787	72792	50 %	0 %	0 %	50 %	294502053
121	NC_014022	GT	3	6	74028	74033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014022	CG	3	6	75307	75312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014022	TC	3	6	75370	75375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014022	TC	3	6	76775	76780	0 %	50 %	0 %	50 %	294502056
125	NC_014022	TG	3	6	78460	78465	0 %	50 %	50 %	0 %	294502057
126	NC_014022	TA	3	6	78955	78960	50 %	50 %	0 %	0 %	294502057
127	NC_014022	GA	3	6	79508	79513	50 %	0 %	50 %	0 %	294502058
128	NC_014022	TA	3	6	79992	79997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014022	AG	3	6	80953	80958	50 %	0 %	50 %	0 %	294502059
130	NC_014022	GT	3	6	83242	83247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014022	AT	3	6	83277	83282	50 %	50 %	0 %	0 %	294502061
132	NC_014022	AT	4	8	83585	83592	50 %	50 %	0 %	0 %	294502061
133	NC_014022	AT	3	6	84492	84497	50 %	50 %	0 %	0 %	294502061
134	NC_014022	CG	3	6	84721	84726	0 %	0 %	50 %	50 %	294502062
135	NC_014022	TC	4	8	85025	85032	0 %	50 %	0 %	50 %	294502062
136	NC_014022	GA	3	6	85325	85330	50 %	0 %	50 %	0 %	294502062
137	NC_014022	CA	3	6	86067	86072	50 %	0 %	0 %	50 %	294502063
138	NC_014022	TA	3	6	87293	87298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014022	GC	3	6	87719	87724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014022	CA	3	6	88602	88607	50 %	0 %	0 %	50 %	294502064
141	NC_014022	GC	3	6	88749	88754	0 %	0 %	50 %	50 %	294502064
142	NC_014022	TG	3	6	88858	88863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014022	GC	3	6	89547	89552	0 %	0 %	50 %	50 %	294502066
144	NC_014022	GC	3	6	89919	89924	0 %	0 %	50 %	50 %	294502066
145	NC_014022	CG	3	6	89947	89952	0 %	0 %	50 %	50 %	294502066
146	NC_014022	CG	3	6	91225	91230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014022	CG	3	6	91661	91666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014022	GC	3	6	92606	92611	0 %	0 %	50 %	50 %	294502068
149	NC_014022	TG	3	6	94232	94237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.