MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pMT1

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014022	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	294501993
2	NC_014022	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	294501993
3	NC_014022	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	294501993
4	NC_014022	GA	3	6	2327	2332	50 %	0 %	50 %	0 %	294501995
5	NC_014022	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	294501995
6	NC_014022	TG	3	6	3012	3017	0 %	50 %	50 %	0 %	294501996
7	NC_014022	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	294501996
8	NC_014022	AC	3	6	3534	3539	50 %	0 %	0 %	50 %	294501996
9	NC_014022	AC	3	6	3570	3575	50 %	0 %	0 %	50 %	294501996
10	NC_014022	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	294501996
11	NC_014022	GC	3	6	5333	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	294501996
12	NC_014022	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	294501997
13	NC_014022	TC	3	6	6684	6689	0 %	50 %	0 %	50 %	294501998
14	NC_014022	AT	3	6	6695	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	294501998
15	NC_014022	CG	3	6	7422	7427	0 %	0 %	50 %	50 %	294501998
16	NC_014022	CT	3	6	8538	8543	0 %	50 %	0 %	50 %	294501998
17	NC_014022	CG	3	6	8726	8731	0 %	0 %	50 %	50 %	294501998
18	NC_014022	AG	3	6	8922	8927	50 %	0 %	50 %	0 %	294501998
19	NC_014022	TG	3	6	10328	10333	0 %	50 %	50 %	0 %	294501998
20	NC_014022	GT	3	6	11822	11827	0 %	50 %	50 %	0 %	294502000
21	NC_014022	AC	3	6	13102	13107	50 %	0 %	0 %	50 %	294502001
22	NC_014022	CG	3	6	13474	13479	0 %	0 %	50 %	50 %	294502002
23	NC_014022	GA	3	6	15222	15227	50 %	0 %	50 %	0 %	294502003
24	NC_014022	AG	3	6	15472	15477	50 %	0 %	50 %	0 %	294502003
25	NC_014022	GA	3	6	16905	16910	50 %	0 %	50 %	0 %	294502003
26	NC_014022	AC	3	6	17588	17593	50 %	0 %	0 %	50 %	294502003
27	NC_014022	CA	3	6	19176	19181	50 %	0 %	0 %	50 %	294502005
28	NC_014022	GA	3	6	19264	19269	50 %	0 %	50 %	0 %	294502005
29	NC_014022	CT	3	6	20314	20319	0 %	50 %	0 %	50 %	294502007
30	NC_014022	AG	3	6	23243	23248	50 %	0 %	50 %	0 %	294502012
31	NC_014022	AT	3	6	25014	25019	50 %	50 %	0 %	0 %	294502014
32	NC_014022	AG	3	6	25265	25270	50 %	0 %	50 %	0 %	294502014
33	NC_014022	CG	4	8	25977	25984	0 %	0 %	50 %	50 %	294502014
34	NC_014022	GC	4	8	26072	26079	0 %	0 %	50 %	50 %	294502014
35	NC_014022	AT	3	6	26847	26852	50 %	50 %	0 %	0 %	294502015
36	NC_014022	CA	3	6	26955	26960	50 %	0 %	0 %	50 %	294502015
37	NC_014022	CG	3	6	27670	27675	0 %	0 %	50 %	50 %	294502015
38	NC_014022	CA	3	6	27723	27728	50 %	0 %	0 %	50 %	294502015
39	NC_014022	GT	3	6	28367	28372	0 %	50 %	50 %	0 %	294502016
40	NC_014022	CG	3	6	32624	32629	0 %	0 %	50 %	50 %	294502021
41	NC_014022	AG	3	6	33689	33694	50 %	0 %	50 %	0 %	294502021
42	NC_014022	GA	3	6	34243	34248	50 %	0 %	50 %	0 %	294502022
43	NC_014022	CG	3	6	34514	34519	0 %	0 %	50 %	50 %	294502023
44	NC_014022	TC	3	6	34561	34566	0 %	50 %	0 %	50 %	294502023
45	NC_014022	CA	3	6	38367	38372	50 %	0 %	0 %	50 %	294502026
46	NC_014022	AG	3	6	40302	40307	50 %	0 %	50 %	0 %	294502029
47	NC_014022	TG	3	6	40522	40527	0 %	50 %	50 %	0 %	294502029
48	NC_014022	GT	3	6	41620	41625	0 %	50 %	50 %	0 %	294502029
49	NC_014022	AG	3	6	42964	42969	50 %	0 %	50 %	0 %	294502030
50	NC_014022	AC	3	6	43916	43921	50 %	0 %	0 %	50 %	294502031
51	NC_014022	TG	3	6	48610	48615	0 %	50 %	50 %	0 %	294502034
52	NC_014022	GT	3	6	49371	49376	0 %	50 %	50 %	0 %	294502035
53	NC_014022	CG	4	8	51785	51792	0 %	0 %	50 %	50 %	294502038
54	NC_014022	AG	3	6	51897	51902	50 %	0 %	50 %	0 %	294502038
55	NC_014022	CG	3	6	53031	53036	0 %	0 %	50 %	50 %	294502039
56	NC_014022	GA	3	6	53204	53209	50 %	0 %	50 %	0 %	294502039
57	NC_014022	GT	4	8	53822	53829	0 %	50 %	50 %	0 %	294502040
58	NC_014022	CA	3	6	54392	54397	50 %	0 %	0 %	50 %	294502040
59	NC_014022	GA	3	6	54859	54864	50 %	0 %	50 %	0 %	294502041
60	NC_014022	TA	3	6	55225	55230	50 %	50 %	0 %	0 %	294502041
61	NC_014022	CT	3	6	55771	55776	0 %	50 %	0 %	50 %	294502042
62	NC_014022	CA	3	6	56179	56184	50 %	0 %	0 %	50 %	294502042
63	NC_014022	CG	3	6	58027	58032	0 %	0 %	50 %	50 %	294502044
64	NC_014022	CT	3	6	58541	58546	0 %	50 %	0 %	50 %	294502044
65	NC_014022	GT	3	6	59316	59321	0 %	50 %	50 %	0 %	294502044
66	NC_014022	TC	3	6	60052	60057	0 %	50 %	0 %	50 %	294502044
67	NC_014022	TC	3	6	60221	60226	0 %	50 %	0 %	50 %	294502044
68	NC_014022	AC	3	6	60960	60965	50 %	0 %	0 %	50 %	294502045
69	NC_014022	GT	3	6	61308	61313	0 %	50 %	50 %	0 %	294502045
70	NC_014022	GA	3	6	61518	61523	50 %	0 %	50 %	0 %	294502045
71	NC_014022	TG	3	6	63788	63793	0 %	50 %	50 %	0 %	294502046
72	NC_014022	CT	3	6	63894	63899	0 %	50 %	0 %	50 %	294502046
73	NC_014022	TC	3	6	64896	64901	0 %	50 %	0 %	50 %	294502047
74	NC_014022	CG	3	6	65810	65815	0 %	0 %	50 %	50 %	294502048
75	NC_014022	GA	3	6	67163	67168	50 %	0 %	50 %	0 %	294502049
76	NC_014022	AT	3	6	67522	67527	50 %	50 %	0 %	0 %	294502049
77	NC_014022	TC	3	6	67701	67706	0 %	50 %	0 %	50 %	294502050
78	NC_014022	TC	3	6	67990	67995	0 %	50 %	0 %	50 %	294502050
79	NC_014022	AC	3	6	68335	68340	50 %	0 %	0 %	50 %	294502050
80	NC_014022	GT	3	6	69106	69111	0 %	50 %	50 %	0 %	294502050
81	NC_014022	CT	3	6	69993	69998	0 %	50 %	0 %	50 %	294502050
82	NC_014022	AT	3	6	70510	70515	50 %	50 %	0 %	0 %	294502051
83	NC_014022	CT	3	6	70560	70565	0 %	50 %	0 %	50 %	294502051
84	NC_014022	AT	3	6	71269	71274	50 %	50 %	0 %	0 %	294502052
85	NC_014022	AT	3	6	71392	71397	50 %	50 %	0 %	0 %	294502052
86	NC_014022	AG	3	6	71635	71640	50 %	0 %	50 %	0 %	294502052
87	NC_014022	CA	3	6	72787	72792	50 %	0 %	0 %	50 %	294502053
88	NC_014022	TC	3	6	76775	76780	0 %	50 %	0 %	50 %	294502056
89	NC_014022	TG	3	6	78460	78465	0 %	50 %	50 %	0 %	294502057
90	NC_014022	TA	3	6	78955	78960	50 %	50 %	0 %	0 %	294502057
91	NC_014022	GA	3	6	79508	79513	50 %	0 %	50 %	0 %	294502058
92	NC_014022	AG	3	6	80953	80958	50 %	0 %	50 %	0 %	294502059
93	NC_014022	AT	3	6	83277	83282	50 %	50 %	0 %	0 %	294502061
94	NC_014022	AT	4	8	83585	83592	50 %	50 %	0 %	0 %	294502061
95	NC_014022	AT	3	6	84492	84497	50 %	50 %	0 %	0 %	294502061
96	NC_014022	CG	3	6	84721	84726	0 %	0 %	50 %	50 %	294502062
97	NC_014022	TC	4	8	85025	85032	0 %	50 %	0 %	50 %	294502062
98	NC_014022	GA	3	6	85325	85330	50 %	0 %	50 %	0 %	294502062
99	NC_014022	CA	3	6	86067	86072	50 %	0 %	0 %	50 %	294502063
100	NC_014022	CA	3	6	88602	88607	50 %	0 %	0 %	50 %	294502064
101	NC_014022	GC	3	6	88749	88754	0 %	0 %	50 %	50 %	294502064
102	NC_014022	GC	3	6	89547	89552	0 %	0 %	50 %	50 %	294502066
103	NC_014022	GC	3	6	89919	89924	0 %	0 %	50 %	50 %	294502066
104	NC_014022	CG	3	6	89947	89952	0 %	0 %	50 %	50 %	294502066
105	NC_014022	GC	3	6	92606	92611	0 %	0 %	50 %	50 %	294502068

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.