MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pMT1

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014022	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	294501993
2	NC_014022	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	294501994
3	NC_014022	A	6	6	2917	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014022	C	6	6	5921	5926	0 %	0 %	0 %	100 %	294501997
5	NC_014022	T	6	6	5979	5984	0 %	100 %	0 %	0 %	294501997
6	NC_014022	T	6	6	10614	10619	0 %	100 %	0 %	0 %	294501998
7	NC_014022	C	6	6	11379	11384	0 %	0 %	0 %	100 %	294501999
8	NC_014022	T	6	6	19755	19760	0 %	100 %	0 %	0 %	294502005
9	NC_014022	T	6	6	22613	22618	0 %	100 %	0 %	0 %	294502011
10	NC_014022	T	6	6	25067	25072	0 %	100 %	0 %	0 %	294502014
11	NC_014022	T	6	6	26455	26460	0 %	100 %	0 %	0 %	294502014
12	NC_014022	T	6	6	31304	31309	0 %	100 %	0 %	0 %	294502019
13	NC_014022	A	6	6	31927	31932	100 %	0 %	0 %	0 %	294502020
14	NC_014022	A	6	6	32774	32779	100 %	0 %	0 %	0 %	294502021
15	NC_014022	G	7	7	34887	34893	0 %	0 %	100 %	0 %	294502023
16	NC_014022	T	8	8	35182	35189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014022	A	6	6	35200	35205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014022	A	6	6	35336	35341	100 %	0 %	0 %	0 %	294502024
19	NC_014022	A	6	6	35780	35785	100 %	0 %	0 %	0 %	294502024
20	NC_014022	T	6	6	36031	36036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014022	T	6	6	36303	36308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014022	T	6	6	36351	36356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014022	A	6	6	36456	36461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014022	A	6	6	37953	37958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014022	A	6	6	38687	38692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014022	T	6	6	39321	39326	0 %	100 %	0 %	0 %	294502027
27	NC_014022	T	7	7	41754	41760	0 %	100 %	0 %	0 %	294502029
28	NC_014022	T	7	7	43672	43678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014022	G	7	7	43836	43842	0 %	0 %	100 %	0 %	294502031
30	NC_014022	A	6	6	43887	43892	100 %	0 %	0 %	0 %	294502031
31	NC_014022	A	6	6	44610	44615	100 %	0 %	0 %	0 %	294502031
32	NC_014022	T	6	6	48297	48302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014022	T	6	6	49630	49635	0 %	100 %	0 %	0 %	294502035
34	NC_014022	T	6	6	49640	49645	0 %	100 %	0 %	0 %	294502036
35	NC_014022	A	6	6	50105	50110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014022	T	6	6	55177	55182	0 %	100 %	0 %	0 %	294502041
37	NC_014022	A	6	6	55665	55670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014022	A	6	6	56309	56314	100 %	0 %	0 %	0 %	294502042
39	NC_014022	T	7	7	62046	62052	0 %	100 %	0 %	0 %	294502046
40	NC_014022	A	6	6	65065	65070	100 %	0 %	0 %	0 %	294502047
41	NC_014022	A	7	7	66435	66441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014022	A	6	6	66584	66589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014022	A	7	7	66710	66716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014022	T	7	7	67514	67520	0 %	100 %	0 %	0 %	294502049
45	NC_014022	T	6	6	67657	67662	0 %	100 %	0 %	0 %	294502050
46	NC_014022	T	6	6	67730	67735	0 %	100 %	0 %	0 %	294502050
47	NC_014022	T	6	6	68116	68121	0 %	100 %	0 %	0 %	294502050
48	NC_014022	T	6	6	68464	68469	0 %	100 %	0 %	0 %	294502050
49	NC_014022	A	7	7	68531	68537	100 %	0 %	0 %	0 %	294502050
50	NC_014022	T	6	6	68589	68594	0 %	100 %	0 %	0 %	294502050
51	NC_014022	T	8	8	68840	68847	0 %	100 %	0 %	0 %	294502050
52	NC_014022	C	6	6	69057	69062	0 %	0 %	0 %	100 %	294502050
53	NC_014022	C	6	6	69179	69184	0 %	0 %	0 %	100 %	294502050
54	NC_014022	C	6	6	70343	70348	0 %	0 %	0 %	100 %	294502051
55	NC_014022	T	6	6	71475	71480	0 %	100 %	0 %	0 %	294502052
56	NC_014022	T	6	6	71878	71883	0 %	100 %	0 %	0 %	294502052
57	NC_014022	A	6	6	72244	72249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014022	A	7	7	73606	73612	100 %	0 %	0 %	0 %	294502053
59	NC_014022	T	6	6	73734	73739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014022	T	7	7	73810	73816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014022	A	7	7	73835	73841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014022	A	6	6	73911	73916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014022	A	6	6	74066	74071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014022	T	9	9	77923	77931	0 %	100 %	0 %	0 %	294502057
65	NC_014022	T	6	6	77981	77986	0 %	100 %	0 %	0 %	294502057
66	NC_014022	T	6	6	78082	78087	0 %	100 %	0 %	0 %	294502057
67	NC_014022	T	7	7	78280	78286	0 %	100 %	0 %	0 %	294502057
68	NC_014022	T	6	6	78582	78587	0 %	100 %	0 %	0 %	294502057
69	NC_014022	T	7	7	78744	78750	0 %	100 %	0 %	0 %	294502057
70	NC_014022	G	6	6	78936	78941	0 %	0 %	100 %	0 %	294502057
71	NC_014022	A	8	8	79636	79643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014022	A	6	6	79859	79864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014022	T	6	6	79880	79885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014022	A	6	6	80072	80077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014022	T	7	7	80094	80100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014022	T	6	6	82195	82200	0 %	100 %	0 %	0 %	294502060
77	NC_014022	T	6	6	82256	82261	0 %	100 %	0 %	0 %	294502060
78	NC_014022	T	8	8	82975	82982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014022	T	6	6	83236	83241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014022	T	6	6	85510	85515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014022	A	6	6	88309	88314	100 %	0 %	0 %	0 %	294502064
82	NC_014022	A	6	6	89443	89448	100 %	0 %	0 %	0 %	294502065
83	NC_014022	T	6	6	90677	90682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014022	A	6	6	92238	92243	100 %	0 %	0 %	0 %	294502068
85	NC_014022	A	7	7	92253	92259	100 %	0 %	0 %	0 %	294502068

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.