MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pMT1

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014022	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	294501993
2	NC_014022	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	294501994
3	NC_014022	C	6	6	5921	5926	0 %	0 %	0 %	100 %	294501997
4	NC_014022	T	6	6	5979	5984	0 %	100 %	0 %	0 %	294501997
5	NC_014022	T	6	6	10614	10619	0 %	100 %	0 %	0 %	294501998
6	NC_014022	C	6	6	11379	11384	0 %	0 %	0 %	100 %	294501999
7	NC_014022	T	6	6	19755	19760	0 %	100 %	0 %	0 %	294502005
8	NC_014022	T	6	6	22613	22618	0 %	100 %	0 %	0 %	294502011
9	NC_014022	T	6	6	25067	25072	0 %	100 %	0 %	0 %	294502014
10	NC_014022	T	6	6	26455	26460	0 %	100 %	0 %	0 %	294502014
11	NC_014022	T	6	6	31304	31309	0 %	100 %	0 %	0 %	294502019
12	NC_014022	A	6	6	31927	31932	100 %	0 %	0 %	0 %	294502020
13	NC_014022	A	6	6	32774	32779	100 %	0 %	0 %	0 %	294502021
14	NC_014022	G	7	7	34887	34893	0 %	0 %	100 %	0 %	294502023
15	NC_014022	A	6	6	35336	35341	100 %	0 %	0 %	0 %	294502024
16	NC_014022	A	6	6	35780	35785	100 %	0 %	0 %	0 %	294502024
17	NC_014022	T	6	6	39321	39326	0 %	100 %	0 %	0 %	294502027
18	NC_014022	T	7	7	41754	41760	0 %	100 %	0 %	0 %	294502029
19	NC_014022	G	7	7	43836	43842	0 %	0 %	100 %	0 %	294502031
20	NC_014022	A	6	6	43887	43892	100 %	0 %	0 %	0 %	294502031
21	NC_014022	A	6	6	44610	44615	100 %	0 %	0 %	0 %	294502031
22	NC_014022	T	6	6	49630	49635	0 %	100 %	0 %	0 %	294502035
23	NC_014022	T	6	6	49640	49645	0 %	100 %	0 %	0 %	294502036
24	NC_014022	T	6	6	55177	55182	0 %	100 %	0 %	0 %	294502041
25	NC_014022	A	6	6	56309	56314	100 %	0 %	0 %	0 %	294502042
26	NC_014022	T	7	7	62046	62052	0 %	100 %	0 %	0 %	294502046
27	NC_014022	A	6	6	65065	65070	100 %	0 %	0 %	0 %	294502047
28	NC_014022	T	7	7	67514	67520	0 %	100 %	0 %	0 %	294502049
29	NC_014022	T	6	6	67657	67662	0 %	100 %	0 %	0 %	294502050
30	NC_014022	T	6	6	67730	67735	0 %	100 %	0 %	0 %	294502050
31	NC_014022	T	6	6	68116	68121	0 %	100 %	0 %	0 %	294502050
32	NC_014022	T	6	6	68464	68469	0 %	100 %	0 %	0 %	294502050
33	NC_014022	A	7	7	68531	68537	100 %	0 %	0 %	0 %	294502050
34	NC_014022	T	6	6	68589	68594	0 %	100 %	0 %	0 %	294502050
35	NC_014022	T	8	8	68840	68847	0 %	100 %	0 %	0 %	294502050
36	NC_014022	C	6	6	69057	69062	0 %	0 %	0 %	100 %	294502050
37	NC_014022	C	6	6	69179	69184	0 %	0 %	0 %	100 %	294502050
38	NC_014022	C	6	6	70343	70348	0 %	0 %	0 %	100 %	294502051
39	NC_014022	T	6	6	71475	71480	0 %	100 %	0 %	0 %	294502052
40	NC_014022	T	6	6	71878	71883	0 %	100 %	0 %	0 %	294502052
41	NC_014022	A	7	7	73606	73612	100 %	0 %	0 %	0 %	294502053
42	NC_014022	T	9	9	77923	77931	0 %	100 %	0 %	0 %	294502057
43	NC_014022	T	6	6	77981	77986	0 %	100 %	0 %	0 %	294502057
44	NC_014022	T	6	6	78082	78087	0 %	100 %	0 %	0 %	294502057
45	NC_014022	T	7	7	78280	78286	0 %	100 %	0 %	0 %	294502057
46	NC_014022	T	6	6	78582	78587	0 %	100 %	0 %	0 %	294502057
47	NC_014022	T	7	7	78744	78750	0 %	100 %	0 %	0 %	294502057
48	NC_014022	G	6	6	78936	78941	0 %	0 %	100 %	0 %	294502057
49	NC_014022	T	6	6	82195	82200	0 %	100 %	0 %	0 %	294502060
50	NC_014022	T	6	6	82256	82261	0 %	100 %	0 %	0 %	294502060
51	NC_014022	A	6	6	88309	88314	100 %	0 %	0 %	0 %	294502064
52	NC_014022	A	6	6	89443	89448	100 %	0 %	0 %	0 %	294502065
53	NC_014022	A	6	6	92238	92243	100 %	0 %	0 %	0 %	294502068
54	NC_014022	A	7	7	92253	92259	100 %	0 %	0 %	0 %	294502068

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.