MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 chromosome

Total Repeats: 1988

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014019	TAGCAG	2	12	401	412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294496876
2	NC_014019	GCAAGA	2	12	5503	5514	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294496880
3	NC_014019	ATGCAA	2	12	7328	7339	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496881
4	NC_014019	ATTTTT	2	12	9141	9152	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014019	ATTAAA	2	12	15459	15470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496883
6	NC_014019	CCAACT	2	12	22534	22545	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294496888
7	NC_014019	AATTGA	2	12	26603	26614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294496893
8	NC_014019	TTAAAT	2	12	27757	27768	50 %	50 %	0 %	0 %	294496893
9	NC_014019	TTATAT	2	12	29695	29706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014019	ATTTTT	2	12	29856	29867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014019	GTGGAG	2	12	40839	40850	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014019	GTTGAA	2	12	43591	43602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496901
13	NC_014019	AAAGAA	2	12	44422	44433	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294496902
14	NC_014019	TTTTAT	2	12	47391	47402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294496907
15	NC_014019	AAAGGA	2	12	53800	53811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496913
16	NC_014019	ATGTTA	2	12	56112	56123	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014019	ATATTT	2	12	56464	56475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496918
18	NC_014019	TACAAT	2	12	60113	60124	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294496922
19	NC_014019	GATGTA	2	12	60985	60996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496923
20	NC_014019	TCGCTT	2	12	67881	67892	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294496929
21	NC_014019	TATCAT	2	12	80154	80165	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294496941
22	NC_014019	AATACG	2	12	81401	81412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496942
23	NC_014019	GTAGGT	2	12	82628	82639	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294496943
24	NC_014019	GAAAAG	2	12	84701	84712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496945
25	NC_014019	GGAAAA	2	12	88549	88560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496950
26	NC_014019	GAAAGA	2	12	89640	89651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496950
27	NC_014019	TTATAT	2	12	89915	89926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014019	ATTTTT	2	12	90072	90083	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014019	GTGAAG	2	12	97714	97725	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	294496954
30	NC_014019	CAGATG	2	12	104476	104487	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294496959
31	NC_014019	CCAGAT	2	12	107297	107308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294496961
32	NC_014019	TCAAAA	2	12	110382	110393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294496965
33	NC_014019	TGACTT	2	12	112204	112215	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294496969
34	NC_014019	CATTTA	2	12	112737	112748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294496970
35	NC_014019	TCTGGT	2	12	112802	112813	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294496970
36	NC_014019	GAAGCT	2	12	113335	113346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294496971
37	NC_014019	CTTGCT	2	12	114472	114483	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294496972
38	NC_014019	CTGTAG	2	12	114676	114687	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294496973
39	NC_014019	GAAGTA	2	12	115588	115599	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294496974
40	NC_014019	TAAAAG	2	12	122622	122633	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294496976
41	NC_014019	GCAAGA	2	12	124754	124765	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294496980
42	NC_014019	TATCAC	2	12	124772	124783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496980
43	NC_014019	AAACAG	2	12	124936	124947	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294496980
44	NC_014019	AGCGTG	2	12	125632	125643	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294496980
45	NC_014019	CAGTAA	2	12	128714	128725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496983
46	NC_014019	AAAGGT	2	12	128986	128997	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294496983
47	NC_014019	CAGTAA	2	12	129743	129754	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496985
48	NC_014019	AAAGGT	2	12	130015	130026	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294496985
49	NC_014019	TGATGT	2	12	131037	131048	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294496987
50	NC_014019	ACTGTT	2	12	134172	134183	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294496994
51	NC_014019	AGTATC	2	12	135493	135504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294496997
52	NC_014019	ACTGTA	2	12	136469	136480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294497000
53	NC_014019	AATCGA	2	12	136762	136773	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294497000
54	NC_014019	AAAGGT	2	12	136874	136885	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294497000
55	NC_014019	TAGTTG	2	12	137464	137475	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294497002
56	NC_014019	TGTTAA	2	12	138593	138604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294497005
57	NC_014019	AATTGC	2	12	139185	139196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294497005
58	NC_014019	TTGAAG	2	12	141539	141550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294497008
59	NC_014019	AAACAA	2	12	141872	141883	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014019	TTAATT	2	12	146401	146412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294497015
61	NC_014019	TATTGC	2	12	150335	150346	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294497021
62	NC_014019	ATATTC	2	12	151805	151816	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294497022
63	NC_014019	AATAAA	2	12	152166	152177	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014019	CGTAGG	2	12	153150	153161	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294497024
65	NC_014019	TGCTTT	2	12	153626	153637	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014019	TTTGAA	2	12	153685	153696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294497025
67	NC_014019	ATTTTT	2	12	154981	154992	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014019	GTATAG	2	12	161325	161336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294497026
69	NC_014019	TCGAAT	2	12	163002	163013	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294497029
70	NC_014019	TTTATC	2	12	168793	168804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294497033
71	NC_014019	TTTCTG	2	12	170174	170185	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294497034
72	NC_014019	TGTAAG	2	12	174875	174886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294497038
73	NC_014019	AAGCAG	2	12	179812	179823	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294497042
74	NC_014019	AAAATT	2	12	180699	180710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294497043
75	NC_014019	GAAATT	2	12	181587	181598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294497043
76	NC_014019	TTGAAA	2	12	182949	182960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294497045
77	NC_014019	TTTGTA	2	12	184383	184394	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294497046
78	NC_014019	TTTTAC	2	12	190526	190537	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294497052
79	NC_014019	CTTTGT	2	12	191949	191960	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014019	AACAGG	2	12	195559	195570	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294497056
81	NC_014019	GTAAAA	2	12	196025	196036	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497056
82	NC_014019	AAATGA	2	12	198664	198675	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497059
83	NC_014019	ATTGCC	2	12	204517	204528	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294497067
84	NC_014019	TCATTT	2	12	211059	211070	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014019	ATTTTT	2	12	211558	211569	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014019	GAAGCC	2	12	218013	218024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294497076
87	NC_014019	GGACAA	2	12	221808	221819	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014019	GTTGAG	2	12	225051	225062	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014019	AGCTGT	2	12	225821	225832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294497086
90	NC_014019	AGCTGT	2	12	226268	226279	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294497086
91	NC_014019	AACTGA	2	12	226604	226615	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294497086
92	NC_014019	TTCCTC	2	12	229355	229366	0 %	50 %	0 %	50 %	294497088
93	NC_014019	ACAGCT	2	12	232851	232862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294497090
94	NC_014019	TTAACA	2	12	234081	234092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294497091
95	NC_014019	ATTTTT	2	12	235383	235394	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014019	AAAGAT	2	12	244477	244488	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497096
97	NC_014019	AAAGTA	2	12	244700	244711	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497097
98	NC_014019	TGGAGG	2	12	248079	248090	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	294497100
99	NC_014019	AATGCA	2	12	248167	248178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294497100
100	NC_014019	TCATAT	2	12	249264	249275	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294497101
101	NC_014019	GTTCAT	2	12	253875	253886	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294497105
102	NC_014019	TAATAT	2	12	255213	255224	50 %	50 %	0 %	0 %	294497106
103	NC_014019	AGGAGA	2	12	261208	261219	50 %	0 %	50 %	0 %	294497110
104	NC_014019	AAATGC	2	12	264650	264661	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294497113
105	NC_014019	CAGCTG	2	12	266223	266234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294497115
106	NC_014019	TTAAAA	2	12	271275	271286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294497118
107	NC_014019	GAAAAT	2	12	272631	272642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497120
108	NC_014019	GCAGAA	2	12	275562	275573	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014019	TTTAGT	2	12	276825	276836	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294497123
110	NC_014019	AAGATG	2	12	276878	276889	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294497123
111	NC_014019	AAATTC	2	12	282816	282827	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294497127
112	NC_014019	ATGCTT	2	12	283347	283358	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294497128
113	NC_014019	TCAATT	2	12	292079	292090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294497137
114	NC_014019	GTATAC	2	12	294761	294772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294497140
115	NC_014019	GGAGAA	2	12	298418	298429	50 %	0 %	50 %	0 %	294497144
116	NC_014019	TCAAAC	2	12	299525	299536	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294497145
117	NC_014019	AGAAAT	2	12	307360	307371	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497154
118	NC_014019	TGTATC	2	12	308795	308806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294497155
119	NC_014019	AAGAAA	2	12	315217	315228	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294497160
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139	NC_014019	ACTGGA	2	12	379005	379016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294497219
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224	NC_014019	TAAAAA	2	12	634879	634890	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
225	NC_014019	GTCATC	2	12	638282	638293	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294497448
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235	NC_014019	GAAGCG	2	12	660356	660367	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294497466
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237	NC_014019	CAGATC	2	12	663635	663646	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294497468
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350	NC_014019	CAGGAG	2	12	922063	922074	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294497709
351	NC_014019	ATGGTG	2	12	922914	922925	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
352	NC_014019	TTTTTG	2	12	925453	925464	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	294497712
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354	NC_014019	TCATAA	2	12	928134	928145	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294497714
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359	NC_014019	ATATGC	2	12	961752	961763	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294497747
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446	NC_014019	TACTTC	2	12	1174411	1174422	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294497952
447	NC_014019	TCAGGA	2	12	1181699	1181710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294497962
448	NC_014019	ATTTTT	2	12	1185460	1185471	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_014019	GAAATG	2	12	1186139	1186150	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294497968
450	NC_014019	TGAATG	2	12	1189810	1189821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294497972
451	NC_014019	CCTTTT	2	12	1191863	1191874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294497975
452	NC_014019	TGAAAA	2	12	1198245	1198256	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497981
453	NC_014019	CGGATG	2	12	1199950	1199961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294497983
454	NC_014019	GAACAA	2	12	1209297	1209308	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294497989
455	NC_014019	ATTGAT	2	12	1210263	1210274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294497989
456	NC_014019	TGAGCT	2	12	1212719	1212730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294497992
457	NC_014019	CTTAAA	2	12	1214050	1214061	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294497994
458	NC_014019	TCTATT	2	12	1224389	1224400	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294498006
459	NC_014019	TTGAAT	2	12	1232334	1232345	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294498013
460	NC_014019	TATCAA	2	12	1233367	1233378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294498014
461	NC_014019	GCAAAG	2	12	1235624	1235635	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294498016
462	NC_014019	GGCATT	2	12	1241224	1241235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294498022
463	NC_014019	TTCCTG	2	12	1243051	1243062	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294498023
464	NC_014019	AAAAGA	2	12	1243774	1243785	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294498024
465	NC_014019	ACGATT	2	12	1262232	1262243	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294498040
466	NC_014019	TATGAA	2	12	1263715	1263726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294498042
467	NC_014019	GAAGCT	2	12	1268066	1268077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294498048
468	NC_014019	TTCGGT	2	12	1270904	1270915	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294498054
469	NC_014019	GGCTTT	2	12	1270970	1270981	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294498054
470	NC_014019	TTGGGG	2	12	1270990	1271001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294498054
471	NC_014019	TTATTG	2	12	1272398	1272409	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294498055
472	NC_014019	AAAATG	2	12	1273606	1273617	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294498057
473	NC_014019	TTGCCA	2	12	1279334	1279345	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294498061
474	NC_014019	AGACGT	2	12	1284672	1284683	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294498066
475	NC_014019	GAAGCG	2	12	1285206	1285217	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
476	NC_014019	TTACGA	2	12	1285600	1285611	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294498067
477	NC_014019	GAAGCA	2	12	1287229	1287240	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294498068
478	NC_014019	ATTGCT	2	12	1289942	1289953	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294498071
479	NC_014019	CAATTC	2	12	1291437	1291448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294498071
480	NC_014019	TTTAGG	2	12	1291450	1291461	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294498071
481	NC_014019	AATAGT	2	12	1292512	1292523	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294498073
482	NC_014019	ATTACC	2	12	1294627	1294638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294498075
483	NC_014019	TCACAA	2	12	1295476	1295487	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
484	NC_014019	ATCTTC	2	12	1295625	1295636	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294498076
485	NC_014019	CTTTTG	2	12	1297370	1297381	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294498078
486	NC_014019	GGATAA	2	12	1307047	1307058	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294498088
487	NC_014019	GAATTT	2	12	1307535	1307546	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294498089
488	NC_014019	AAAAGG	2	12	1315258	1315269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294498098
489	NC_014019	AAAAAT	2	12	1316808	1316819	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294498100
490	NC_014019	ACTAAC	2	12	1318633	1318644	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
491	NC_014019	TGACTA	2	12	1319273	1319284	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294498103
492	NC_014019	CAAGAA	2	12	1322437	1322448	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294498105
493	NC_014019	ACAGAA	2	12	1323310	1323321	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294498105
494	NC_014019	ATTGAT	2	12	1323764	1323775	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294498106
495	NC_014019	GCAGAT	2	12	1324289	1324300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294498106
496	NC_014019	AATTTG	2	12	1325084	1325095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294498107
497	NC_014019	TTTCAT	2	12	1326041	1326052	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294498107
498	NC_014019	CTACAG	2	12	1332581	1332592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294498115
499	NC_014019	CTGAGC	2	12	1334441	1334452	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294498116
500	NC_014019	GATGTT	2	12	1338095	1338106	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294498119

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