MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 chromosome

Total Repeats: 279

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014019	ATTTTT	2	12	9141	9152	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014019	TTATAT	2	12	29695	29706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014019	ATTTTT	2	12	29856	29867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014019	GTGGAG	2	12	40839	40850	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014019	ATGTTA	2	12	56112	56123	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014019	TTATAT	2	12	89915	89926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014019	ATTTTT	2	12	90072	90083	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014019	AAACAA	2	12	141872	141883	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014019	AATAAA	2	12	152166	152177	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014019	TGCTTT	2	12	153626	153637	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014019	ATTTTT	2	12	154981	154992	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014019	CTTTGT	2	12	191949	191960	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014019	TCATTT	2	12	211059	211070	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014019	ATTTTT	2	12	211558	211569	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014019	GGACAA	2	12	221808	221819	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014019	GTTGAG	2	12	225051	225062	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014019	ATTTTT	2	12	235383	235394	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014019	GCAGAA	2	12	275562	275573	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014019	TGTATA	2	12	377191	377202	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014019	AATAGG	2	12	389970	389981	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014019	TTTTTA	2	12	398802	398813	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014019	AAGTAA	2	12	413538	413549	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014019	ATTTTT	2	12	434423	434434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014019	AAAAGG	2	12	463027	463038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014019	AAGCTT	2	12	465449	465460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014019	CTAAAA	2	12	476755	476766	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014019	ATAAAA	2	12	479201	479212	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014019	ATGAAA	2	12	487828	487839	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014019	TATGTT	2	12	491205	491216	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014019	ATAAAA	2	12	503221	503232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014019	ATAAAA	2	12	518010	518021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014019	GCGCTT	2	12	549814	549825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014019	ATTTTT	2	12	576252	576263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014019	TCATAT	2	12	582254	582265	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014019	ATTTTT	2	12	586574	586585	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014019	TAAAAA	2	12	634879	634890	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014019	TAAAAA	2	12	660028	660039	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014019	CGCTAT	2	12	675741	675752	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014019	ATGGTG	2	12	677241	677252	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014019	AATTGT	2	12	703004	703015	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014019	TAATCC	2	12	703723	703734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014019	ATAGAA	2	12	720497	720508	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014019	ATTTTC	2	12	721842	721853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014019	TATTGC	2	12	778470	778481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014019	AGTAAT	2	12	779519	779530	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014019	TAAAAT	2	12	810565	810576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014019	ATTTTC	2	12	818194	818205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014019	TTTAAA	2	12	825432	825443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014019	AAAAGA	2	12	843035	843046	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014019	AGTTAA	2	12	856735	856746	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014019	TATTTC	2	12	902266	902277	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014019	ATGGTG	2	12	922914	922925	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014019	GTTTTG	2	12	952907	952918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014019	AGATTT	2	12	972942	972953	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014019	AGGGAA	2	12	1009211	1009222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014019	ATTCAC	2	12	1013004	1013015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014019	TCTTTT	2	12	1037262	1037273	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014019	CAAAGA	2	12	1064785	1064796	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014019	AAAAGC	2	12	1119156	1119167	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014019	CTAGAC	2	12	1145261	1145272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014019	AGTCAA	2	12	1146359	1146370	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014019	ATTTTT	2	12	1185460	1185471	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014019	GAAGCG	2	12	1285206	1285217	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014019	TCACAA	2	12	1295476	1295487	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014019	ACTAAC	2	12	1318633	1318644	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014019	TTATCA	2	12	1389952	1389963	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014019	TTTTGT	2	12	1408703	1408714	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014019	TTACCT	2	12	1481824	1481835	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014019	ATTAAA	2	12	1587303	1587314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014019	AGTTAA	2	12	1589091	1589102	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014019	GATTTA	2	12	1589247	1589258	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014019	GGGAAA	2	12	1612918	1612929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014019	ACTTAG	2	12	1634479	1634490	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014019	CAAGAA	2	12	1641536	1641547	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014019	TTTTTA	2	12	1642564	1642575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014019	TTTAAA	2	12	1647126	1647137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014019	ATATAC	2	12	1652858	1652869	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014019	ACGTTA	2	12	1667056	1667067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014019	TCATTA	2	12	1667140	1667151	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014019	GTTTAT	2	12	1672347	1672358	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014019	AAATGG	2	12	1673558	1673569	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014019	AAGAAA	2	12	1675004	1675015	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014019	ATCCTA	2	12	1675154	1675165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014019	TAATTT	2	12	1676770	1676781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014019	TTTTCT	2	12	1682066	1682077	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014019	CTTAAA	2	12	1685921	1685932	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014019	AAAATC	2	12	1687614	1687625	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014019	TATAAA	2	12	1691420	1691431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014019	GAAATT	2	12	1693079	1693090	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014019	TAAGCT	2	12	1694040	1694051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014019	TTTTTA	2	12	1717056	1717067	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014019	ATAAAG	2	12	1718725	1718736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014019	TACTTT	2	12	1725984	1725995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014019	TTTTCA	2	12	1743665	1743676	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014019	CAAGTA	2	12	1759303	1759314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014019	GCTGGA	2	12	1767297	1767308	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014019	AATAGA	2	12	1780522	1780533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014019	GATTTA	2	12	1783040	1783051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014019	TAAAAA	2	12	1784023	1784034	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014019	GAAAGA	2	12	1785227	1785238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014019	ACTTAA	2	12	1786826	1786837	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014019	TAAATA	2	12	1814338	1814349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014019	AAAGAA	2	12	1816612	1816623	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014019	ACTAAT	2	12	1817687	1817698	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014019	GATATA	2	12	1828858	1828869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014019	AAAATA	2	12	1830918	1830929	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014019	TGTTTC	2	12	1831295	1831306	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014019	CATGCA	2	12	1856565	1856576	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014019	TAAATA	2	12	1866268	1866279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014019	AAAAAT	2	12	1883894	1883905	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014019	AATAAA	2	12	1888730	1888741	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014019	AGCGCA	2	12	1890043	1890054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014019	ATCATT	2	12	1900608	1900619	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014019	TTAACG	2	12	1911179	1911190	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014019	TTTTAT	2	12	1920174	1920185	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014019	CTTTAT	2	12	1937342	1937353	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014019	TAGGTT	2	12	1944321	1944332	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014019	GAAGAG	2	12	1949727	1949738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014019	GAAAAT	2	12	1950420	1950431	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014019	AAAAGA	2	12	2008427	2008438	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014019	AAAATA	2	12	2021368	2021379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014019	AAAATG	2	12	2033452	2033463	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014019	CAAGAC	2	12	2149006	2149017	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014019	TGAAAG	2	12	2193211	2193222	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014019	TCAAAG	2	12	2198967	2198978	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014019	GACATA	2	12	2216066	2216077	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014019	TATTGT	2	12	2241329	2241340	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014019	AAGCAG	2	12	2241376	2241387	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014019	AAGGCT	2	12	2264658	2264669	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014019	TTATTT	2	12	2272447	2272458	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014019	AAAATA	2	12	2277075	2277086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014019	TATTTA	2	12	2302116	2302127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014019	TATTGA	2	12	2305870	2305881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014019	TTTCAG	2	12	2306670	2306681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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136	NC_014019	TTAATT	2	12	2324866	2324877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_014019	TTTCCT	2	12	2347772	2347783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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251	NC_014019	ATGAGA	2	12	4316476	4316487	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.