MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 chromosome

Total Repeats: 1709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014019	TAGCAG	2	12	401	412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294496876
2	NC_014019	GCAAGA	2	12	5503	5514	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294496880
3	NC_014019	ATGCAA	2	12	7328	7339	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496881
4	NC_014019	ATTAAA	2	12	15459	15470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496883
5	NC_014019	CCAACT	2	12	22534	22545	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294496888
6	NC_014019	AATTGA	2	12	26603	26614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294496893
7	NC_014019	TTAAAT	2	12	27757	27768	50 %	50 %	0 %	0 %	294496893
8	NC_014019	GTTGAA	2	12	43591	43602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496901
9	NC_014019	AAAGAA	2	12	44422	44433	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294496902
10	NC_014019	TTTTAT	2	12	47391	47402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294496907
11	NC_014019	AAAGGA	2	12	53800	53811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496913
12	NC_014019	ATATTT	2	12	56464	56475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496918
13	NC_014019	TACAAT	2	12	60113	60124	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294496922
14	NC_014019	GATGTA	2	12	60985	60996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496923
15	NC_014019	TCGCTT	2	12	67881	67892	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294496929
16	NC_014019	TATCAT	2	12	80154	80165	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294496941
17	NC_014019	AATACG	2	12	81401	81412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496942
18	NC_014019	GTAGGT	2	12	82628	82639	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294496943
19	NC_014019	GAAAAG	2	12	84701	84712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496945
20	NC_014019	GGAAAA	2	12	88549	88560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496950
21	NC_014019	GAAAGA	2	12	89640	89651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496950
22	NC_014019	GTGAAG	2	12	97714	97725	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	294496954
23	NC_014019	CAGATG	2	12	104476	104487	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294496959
24	NC_014019	CCAGAT	2	12	107297	107308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294496961
25	NC_014019	TCAAAA	2	12	110382	110393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294496965
26	NC_014019	TGACTT	2	12	112204	112215	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294496969
27	NC_014019	CATTTA	2	12	112737	112748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294496970
28	NC_014019	TCTGGT	2	12	112802	112813	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294496970
29	NC_014019	GAAGCT	2	12	113335	113346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294496971
30	NC_014019	CTTGCT	2	12	114472	114483	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294496972
31	NC_014019	CTGTAG	2	12	114676	114687	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294496973
32	NC_014019	GAAGTA	2	12	115588	115599	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294496974
33	NC_014019	TAAAAG	2	12	122622	122633	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294496976
34	NC_014019	GCAAGA	2	12	124754	124765	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294496980
35	NC_014019	TATCAC	2	12	124772	124783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496980
36	NC_014019	AAACAG	2	12	124936	124947	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294496980
37	NC_014019	AGCGTG	2	12	125632	125643	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294496980
38	NC_014019	CAGTAA	2	12	128714	128725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496983
39	NC_014019	AAAGGT	2	12	128986	128997	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294496983
40	NC_014019	CAGTAA	2	12	129743	129754	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496985
41	NC_014019	AAAGGT	2	12	130015	130026	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294496985
42	NC_014019	TGATGT	2	12	131037	131048	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294496987
43	NC_014019	ACTGTT	2	12	134172	134183	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294496994
44	NC_014019	AGTATC	2	12	135493	135504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294496997
45	NC_014019	ACTGTA	2	12	136469	136480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294497000
46	NC_014019	AATCGA	2	12	136762	136773	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294497000
47	NC_014019	AAAGGT	2	12	136874	136885	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294497000
48	NC_014019	TAGTTG	2	12	137464	137475	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294497002
49	NC_014019	TGTTAA	2	12	138593	138604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294497005
50	NC_014019	AATTGC	2	12	139185	139196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294497005
51	NC_014019	TTGAAG	2	12	141539	141550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294497008
52	NC_014019	TTAATT	2	12	146401	146412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294497015
53	NC_014019	TATTGC	2	12	150335	150346	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294497021
54	NC_014019	ATATTC	2	12	151805	151816	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294497022
55	NC_014019	CGTAGG	2	12	153150	153161	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294497024
56	NC_014019	TTTGAA	2	12	153685	153696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294497025
57	NC_014019	GTATAG	2	12	161325	161336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294497026
58	NC_014019	TCGAAT	2	12	163002	163013	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294497029
59	NC_014019	TTTATC	2	12	168793	168804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294497033
60	NC_014019	TTTCTG	2	12	170174	170185	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294497034
61	NC_014019	TGTAAG	2	12	174875	174886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294497038
62	NC_014019	AAGCAG	2	12	179812	179823	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294497042
63	NC_014019	AAAATT	2	12	180699	180710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294497043
64	NC_014019	GAAATT	2	12	181587	181598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294497043
65	NC_014019	TTGAAA	2	12	182949	182960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294497045
66	NC_014019	TTTGTA	2	12	184383	184394	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294497046
67	NC_014019	TTTTAC	2	12	190526	190537	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294497052
68	NC_014019	AACAGG	2	12	195559	195570	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294497056
69	NC_014019	GTAAAA	2	12	196025	196036	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497056
70	NC_014019	AAATGA	2	12	198664	198675	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497059
71	NC_014019	ATTGCC	2	12	204517	204528	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294497067
72	NC_014019	GAAGCC	2	12	218013	218024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294497076
73	NC_014019	AGCTGT	2	12	225821	225832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294497086
74	NC_014019	AGCTGT	2	12	226268	226279	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294497086
75	NC_014019	AACTGA	2	12	226604	226615	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294497086
76	NC_014019	TTCCTC	2	12	229355	229366	0 %	50 %	0 %	50 %	294497088
77	NC_014019	ACAGCT	2	12	232851	232862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294497090
78	NC_014019	TTAACA	2	12	234081	234092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294497091
79	NC_014019	AAAGAT	2	12	244477	244488	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497096
80	NC_014019	AAAGTA	2	12	244700	244711	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497097
81	NC_014019	TGGAGG	2	12	248079	248090	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	294497100
82	NC_014019	AATGCA	2	12	248167	248178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294497100
83	NC_014019	TCATAT	2	12	249264	249275	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294497101
84	NC_014019	GTTCAT	2	12	253875	253886	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294497105
85	NC_014019	TAATAT	2	12	255213	255224	50 %	50 %	0 %	0 %	294497106
86	NC_014019	AGGAGA	2	12	261208	261219	50 %	0 %	50 %	0 %	294497110
87	NC_014019	AAATGC	2	12	264650	264661	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294497113
88	NC_014019	CAGCTG	2	12	266223	266234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294497115
89	NC_014019	TTAAAA	2	12	271275	271286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294497118
90	NC_014019	GAAAAT	2	12	272631	272642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497120
91	NC_014019	TTTAGT	2	12	276825	276836	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294497123
92	NC_014019	AAGATG	2	12	276878	276889	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294497123
93	NC_014019	AAATTC	2	12	282816	282827	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294497127
94	NC_014019	ATGCTT	2	12	283347	283358	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294497128
95	NC_014019	TCAATT	2	12	292079	292090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294497137
96	NC_014019	GTATAC	2	12	294761	294772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294497140
97	NC_014019	GGAGAA	2	12	298418	298429	50 %	0 %	50 %	0 %	294497144
98	NC_014019	TCAAAC	2	12	299525	299536	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294497145
99	NC_014019	AGAAAT	2	12	307360	307371	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497154
100	NC_014019	TGTATC	2	12	308795	308806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294497155
101	NC_014019	AAGAAA	2	12	315217	315228	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294497160
102	NC_014019	GGAACA	2	12	320402	320413	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294497167
103	NC_014019	TTTAGG	2	12	320545	320556	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294497167
104	NC_014019	ATCAAA	2	12	324701	324712	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294497168
105	NC_014019	CTTGCT	2	12	328496	328507	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294497171
106	NC_014019	AAGCAG	2	12	333966	333977	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294497175
107	NC_014019	CATCTA	2	12	334830	334841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294497176
108	NC_014019	TCAGCA	2	12	336861	336872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294497177
109	NC_014019	GAATAG	2	12	340933	340944	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294497182
110	NC_014019	TTCTTT	2	12	341163	341174	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294497182
111	NC_014019	ACAAGC	2	12	343464	343475	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	294497184
112	NC_014019	ACAATA	2	12	344446	344457	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294497185
113	NC_014019	CATCTC	2	12	345386	345397	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	294497185
114	NC_014019	TAATGG	2	12	349911	349922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294497190
115	NC_014019	TCACCA	2	12	351504	351515	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294497193
116	NC_014019	TTTCAT	2	12	357088	357099	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294497199
117	NC_014019	TTAAAA	2	12	359768	359779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294497202
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231	NC_014019	ATTCCA	2	12	732077	732088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294497535
232	NC_014019	TTCCTG	2	12	732096	732107	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294497535
233	NC_014019	CCTGTA	2	12	735913	735924	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294497539
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336	NC_014019	ATGTGC	2	12	1060390	1060401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294497852
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339	NC_014019	CCTTGC	2	12	1065122	1065133	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	294497856
340	NC_014019	TATACG	2	12	1065201	1065212	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294497856
341	NC_014019	TTCTTT	2	12	1065548	1065559	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294497856
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343	NC_014019	GCTGAT	2	12	1083073	1083084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294497875
344	NC_014019	AAGATA	2	12	1086213	1086224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294497878
345	NC_014019	AAGGAA	2	12	1089620	1089631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294497880
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350	NC_014019	AAATTA	2	12	1097645	1097656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294497888
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370	NC_014019	AATTGG	2	12	1148734	1148745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294497929
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446	NC_014019	AAAAGC	2	12	1375335	1375346	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294498159
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449	NC_014019	CTCAGT	2	12	1392503	1392514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294498178
450	NC_014019	TACTCT	2	12	1398676	1398687	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294498184
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453	NC_014019	CAATCA	2	12	1419637	1419648	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294498210
454	NC_014019	GCTTGC	2	12	1421114	1421125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294498211
455	NC_014019	TTTCTG	2	12	1425873	1425884	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294498215
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