MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	ATCTAT	2	12	2467	2478	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014017	GATGTC	2	12	5995	6006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294496814
3	NC_014017	TTTCCA	2	12	8015	8026	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294496816
4	NC_014017	TACATT	2	12	11703	11714	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294496820
5	NC_014017	ATTTTT	2	12	16500	16511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294496824
6	NC_014017	TTAAAC	2	12	18269	18280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294496826
7	NC_014017	TTATTT	2	12	21270	21281	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014017	CAAGAT	2	12	22624	22635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496830
9	NC_014017	AATTAC	2	12	26058	26069	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014017	TGAGCG	2	12	27840	27851	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294496836
11	NC_014017	GAAGAT	2	12	27925	27936	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294496836
12	NC_014017	CAAGAA	2	12	27967	27978	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294496836
13	NC_014017	TAGAAC	2	12	29089	29100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496837
14	NC_014017	TTGGTT	2	12	34044	34055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014017	TAACGT	2	12	35545	35556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294496844
16	NC_014017	GTTACT	2	12	35838	35849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294496845
17	NC_014017	TTATGT	2	12	35895	35906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294496845
18	NC_014017	TTTTGC	2	12	41205	41216	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294496851
19	NC_014017	GGTTAT	2	12	43298	43309	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014017	AATTGA	2	12	44331	44342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294496855
21	NC_014017	TGAATG	2	12	46160	46171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496857
22	NC_014017	AGGCAC	2	12	47140	47151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014017	AAGATT	2	12	48895	48906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294496859
24	NC_014017	CCGGTT	2	12	53512	53523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014017	CCAATC	2	12	53536	53547	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014017	TTTCCA	2	12	57053	57064	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294496864
27	NC_014017	TGGAAA	2	12	58203	58214	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014017	CAATTG	2	12	59282	59293	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294496866

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.