MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	GATGTC	2	12	5995	6006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294496814
2	NC_014017	TTTCCA	2	12	8015	8026	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294496816
3	NC_014017	TACATT	2	12	11703	11714	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294496820
4	NC_014017	ATTTTT	2	12	16500	16511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294496824
5	NC_014017	TTAAAC	2	12	18269	18280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294496826
6	NC_014017	CAAGAT	2	12	22624	22635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496830
7	NC_014017	TGAGCG	2	12	27840	27851	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294496836
8	NC_014017	GAAGAT	2	12	27925	27936	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294496836
9	NC_014017	CAAGAA	2	12	27967	27978	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294496836
10	NC_014017	TAGAAC	2	12	29089	29100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496837
11	NC_014017	TAACGT	2	12	35545	35556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294496844
12	NC_014017	GTTACT	2	12	35838	35849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294496845
13	NC_014017	TTATGT	2	12	35895	35906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294496845
14	NC_014017	TTTTGC	2	12	41205	41216	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294496851
15	NC_014017	AATTGA	2	12	44331	44342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294496855
16	NC_014017	TGAATG	2	12	46160	46171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496857
17	NC_014017	AAGATT	2	12	48895	48906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294496859
18	NC_014017	TTTCCA	2	12	57053	57064	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294496864
19	NC_014017	CAATTG	2	12	59282	59293	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294496866

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.