MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	TTTTG	2	10	1532	1541	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014017	CAGCC	2	10	4585	4594	20 %	0 %	20 %	60 %	294496813
3	NC_014017	TTTGG	2	10	6061	6070	0 %	60 %	40 %	0 %	294496814
4	NC_014017	GGACC	2	10	7060	7069	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014017	TGTAG	2	10	7103	7112	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014017	ATTAA	2	10	8295	8304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014017	AACAT	2	10	10417	10426	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014017	GCTTG	2	10	11664	11673	0 %	40 %	40 %	20 %	294496820
9	NC_014017	TTTTA	2	10	17152	17161	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014017	TAAAA	2	10	17291	17300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014017	GATGC	2	10	18990	18999	20 %	20 %	40 %	20 %	294496826
12	NC_014017	GCCGC	2	10	19233	19242	0 %	0 %	40 %	60 %	294496826
13	NC_014017	CCATC	2	10	23113	23122	20 %	20 %	0 %	60 %	294496830
14	NC_014017	GCATC	2	10	23386	23395	20 %	20 %	20 %	40 %	294496830
15	NC_014017	TTCAC	2	10	30966	30975	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014017	TTGTT	2	10	31275	31284	0 %	80 %	20 %	0 %	294496840
17	NC_014017	GCAGA	2	10	32175	32184	40 %	0 %	40 %	20 %	294496841
18	NC_014017	TAAAT	2	10	33489	33498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014017	TTTCT	2	10	33660	33669	0 %	80 %	0 %	20 %	294496842
20	NC_014017	CCAAG	2	10	34928	34937	40 %	0 %	20 %	40 %	294496843
21	NC_014017	TTTGG	2	10	36063	36072	0 %	60 %	40 %	0 %	294496845
22	NC_014017	CGTCT	2	10	36119	36128	0 %	40 %	20 %	40 %	294496845
23	NC_014017	CTGAA	2	10	36962	36971	40 %	20 %	20 %	20 %	294496845
24	NC_014017	GTACG	2	10	37280	37289	20 %	20 %	40 %	20 %	294496845
25	NC_014017	CATTC	2	10	38231	38240	20 %	40 %	0 %	40 %	294496847
26	NC_014017	AAAGT	2	10	38440	38449	60 %	20 %	20 %	0 %	294496847
27	NC_014017	ATTGC	2	10	39409	39418	20 %	40 %	20 %	20 %	294496848
28	NC_014017	GAATG	2	10	39650	39659	40 %	20 %	40 %	0 %	294496848
29	NC_014017	CTATA	2	10	46597	46606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014017	TGGAT	2	10	50605	50614	20 %	40 %	40 %	0 %	294496860
31	NC_014017	GCCAT	2	10	51115	51124	20 %	20 %	20 %	40 %	294496860
32	NC_014017	TGGCT	2	10	51378	51387	0 %	40 %	40 %	20 %	294496860
33	NC_014017	CGGGG	2	10	53775	53784	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014017	AAAAG	2	10	54018	54027	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014017	AGCGC	2	10	54819	54828	20 %	0 %	40 %	40 %	294496862
36	NC_014017	TCGCC	2	10	55327	55336	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_014017	ATTAA	2	10	57333	57342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014017	AATCG	2	10	60116	60125	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014017	CCTCA	2	10	60198	60207	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_014017	CTGTA	2	10	60393	60402	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014017	GCTAA	2	10	63763	63772	40 %	20 %	20 %	20 %	294496869
42	NC_014017	ACCTT	2	10	67902	67911	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.