MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	TTTTG	2	10	1532	1541	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014017	GGACC	2	10	7060	7069	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014017	TGTAG	2	10	7103	7112	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014017	ATTAA	2	10	8295	8304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014017	AACAT	2	10	10417	10426	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014017	TTTTA	2	10	17152	17161	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014017	TAAAA	2	10	17291	17300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014017	TTCAC	2	10	30966	30975	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014017	TAAAT	2	10	33489	33498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014017	CTATA	2	10	46597	46606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014017	CGGGG	2	10	53775	53784	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014017	AAAAG	2	10	54018	54027	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014017	TCGCC	2	10	55327	55336	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_014017	ATTAA	2	10	57333	57342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014017	AATCG	2	10	60116	60125	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014017	CCTCA	2	10	60198	60207	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_014017	CTGTA	2	10	60393	60402	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014017	ACCTT	2	10	67902	67911	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.