MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	CTGG	2	8	109	116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014017	GTTC	2	8	148	155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014017	ATTT	2	8	1655	1662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014017	AGCC	2	8	3031	3038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014017	GGAT	2	8	3545	3552	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014017	AGAT	2	8	3607	3614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014017	TAAA	2	8	4188	4195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014017	CTTT	2	8	6604	6611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014017	TCAG	2	8	6716	6723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014017	CCCT	2	8	7408	7415	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_014017	CGAC	2	8	9319	9326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014017	ATAA	2	8	13278	13285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014017	TTAT	2	8	13446	13453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014017	AATG	2	8	14227	14234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014017	ATTT	2	8	14294	14301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014017	TTAT	2	8	15718	15725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014017	ATAA	2	8	15773	15780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014017	TTAA	2	8	17308	17315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014017	ATCG	2	8	24935	24942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014017	GTAG	2	8	26273	26280	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014017	TGTT	2	8	33393	33400	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014017	GAAA	2	8	33438	33445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014017	AGGG	2	8	33621	33628	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014017	CGCA	2	8	34078	34085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014017	TTAT	2	8	35320	35327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014017	TTCT	2	8	37993	38000	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014017	ACTA	2	8	38938	38945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014017	AAAT	2	8	39062	39069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014017	CAAA	2	8	39156	39163	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014017	ATAA	2	8	42679	42686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014017	TGTC	2	8	43700	43707	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014017	TACA	2	8	44666	44673	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014017	GACG	2	8	44802	44809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014017	TTAT	2	8	44825	44832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014017	TTTA	2	8	45134	45141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014017	AATA	2	8	45150	45157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014017	TTAA	2	8	46581	46588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014017	GCTG	2	8	46894	46901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014017	CGGA	2	8	47060	47067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014017	GGGA	2	8	47689	47696	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014017	CTTT	2	8	48018	48025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014017	CAGG	2	8	48161	48168	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014017	AGAA	2	8	48203	48210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014017	CCCT	2	8	52709	52716	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_014017	GGGC	2	8	53954	53961	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014017	TTAT	3	12	54000	54011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014017	GCCA	2	8	55425	55432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014017	CACT	2	8	55461	55468	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014017	TCTG	2	8	55558	55565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014017	TGAA	2	8	55618	55625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014017	CAGT	2	8	55911	55918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014017	ATCC	2	8	56138	56145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014017	GCAG	2	8	58228	58235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014017	CCTC	2	8	60339	60346	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_014017	CCTG	2	8	63213	63220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014017	ATAA	2	8	64407	64414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014017	ACAA	2	8	64873	64880	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014017	GGGA	2	8	66090	66097	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014017	GCCA	2	8	67504	67511	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014017	GCGG	2	8	67927	67934	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014017	CGCC	2	8	68322	68329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.