MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	CTG	2	6	198	203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014017	ACA	2	6	281	286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014017	GCT	2	6	458	463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496809
4	NC_014017	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496809
5	NC_014017	GAC	2	6	555	560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496809
6	NC_014017	CGA	2	6	661	666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496809
7	NC_014017	GCC	2	6	892	897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496809
8	NC_014017	GCG	2	6	936	941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496809
9	NC_014017	TAA	2	6	1029	1034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014017	CAA	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014017	GTG	3	9	1069	1077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496810
12	NC_014017	TGA	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496810
13	NC_014017	TTA	2	6	1146	1151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496810
14	NC_014017	TCA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496810
15	NC_014017	GTT	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496810
16	NC_014017	AAT	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496810
17	NC_014017	ATA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014017	AAC	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014017	CAG	2	6	1561	1566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014017	TAA	2	6	1629	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014017	ATC	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014017	AGC	2	6	1701	1706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014017	ATC	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496811
24	NC_014017	GGT	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496811
25	NC_014017	TGC	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496811
26	NC_014017	GCA	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496811
27	NC_014017	TGC	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496811
28	NC_014017	TGG	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496811
29	NC_014017	TGG	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496811
30	NC_014017	GGC	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496811
31	NC_014017	TAC	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014017	GCA	2	6	2487	2492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014017	TCA	2	6	2711	2716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014017	GCA	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014017	TGC	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014017	CGC	2	6	3098	3103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014017	CAG	2	6	3119	3124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014017	CAC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014017	TCA	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014017	CAT	2	6	3572	3577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014017	TGA	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014017	CCG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014017	GTT	2	6	3663	3668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014017	ATT	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014017	AAG	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014017	TCT	2	6	4150	4155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014017	TTC	2	6	4273	4278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496813
48	NC_014017	TTC	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496813
49	NC_014017	GTA	2	6	4430	4435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496813
50	NC_014017	ATT	2	6	4498	4503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496813
51	NC_014017	AAT	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496813
52	NC_014017	TCG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496813
53	NC_014017	TCA	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496813
54	NC_014017	CTG	2	6	4885	4890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496813
55	NC_014017	ACG	2	6	4926	4931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496813
56	NC_014017	TAA	2	6	4939	4944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496813
57	NC_014017	TGC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496813
58	NC_014017	CCG	2	6	5100	5105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496813
59	NC_014017	CAT	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496813
60	NC_014017	TCA	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496813
61	NC_014017	AGC	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
62	NC_014017	AAC	2	6	5370	5375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496814
63	NC_014017	CCG	2	6	5567	5572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496814
64	NC_014017	CAG	2	6	5594	5599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
65	NC_014017	CAT	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496814
66	NC_014017	AGC	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
67	NC_014017	TAA	2	6	5694	5699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496814
68	NC_014017	AAG	2	6	5777	5782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496814
69	NC_014017	AGC	2	6	5826	5831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
70	NC_014017	ATC	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496814
71	NC_014017	ATA	2	6	5850	5855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496814
72	NC_014017	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496814
73	NC_014017	TCT	2	6	5869	5874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496814
74	NC_014017	CAC	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496814
75	NC_014017	AAC	2	6	6042	6047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496814
76	NC_014017	CAG	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
77	NC_014017	AGC	2	6	6267	6272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
78	NC_014017	TAT	2	6	6369	6374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014017	AAC	2	6	6422	6427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014017	CGC	2	6	6467	6472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014017	GAC	2	6	6549	6554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014017	CTG	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014017	TCG	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014017	CAG	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014017	CAC	2	6	6813	6818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014017	CGC	2	6	6931	6936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014017	CAT	2	6	6958	6963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014017	TTA	2	6	7070	7075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014017	CCA	2	6	7180	7185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014017	TGT	2	6	7203	7208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014017	ATG	2	6	7246	7251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014017	AGC	2	6	7274	7279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014017	TCC	2	6	7368	7373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014017	CAG	2	6	7429	7434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014017	CCA	2	6	7571	7576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496815
96	NC_014017	CAC	2	6	7756	7761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496815
97	NC_014017	CAG	2	6	7783	7788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496815
98	NC_014017	CTG	2	6	7799	7804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496815
99	NC_014017	GCT	2	6	7808	7813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496815
100	NC_014017	GGC	2	6	7911	7916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496815
101	NC_014017	TCA	2	6	7982	7987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496816
102	NC_014017	CTT	3	9	8108	8116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496816
103	NC_014017	CTT	2	6	8430	8435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496817
104	NC_014017	GAA	2	6	8462	8467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496817
105	NC_014017	GCC	2	6	8549	8554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496817
106	NC_014017	GTG	2	6	8573	8578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496817
107	NC_014017	CAA	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496817
108	NC_014017	GCC	2	6	8666	8671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496817
109	NC_014017	GCA	2	6	8747	8752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496817
110	NC_014017	TCT	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496817
111	NC_014017	CAC	2	6	9043	9048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014017	ATC	2	6	9116	9121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014017	TGA	2	6	9187	9192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014017	ATC	2	6	9249	9254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014017	GTT	2	6	9385	9390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014017	GCG	2	6	9398	9403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014017	AGG	2	6	9417	9422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014017	GAT	2	6	9515	9520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014017	ATA	2	6	9611	9616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496818
120	NC_014017	TCC	2	6	9647	9652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496818
121	NC_014017	GAT	2	6	9667	9672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496818
122	NC_014017	ATA	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496818
123	NC_014017	TCA	2	6	9701	9706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496818
124	NC_014017	TCA	2	6	9725	9730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496818
125	NC_014017	ATT	2	6	9853	9858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496818
126	NC_014017	ATA	2	6	9957	9962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496818
127	NC_014017	AGT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496818
128	NC_014017	TCT	2	6	10061	10066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496818
129	NC_014017	TAA	2	6	10143	10148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496818
130	NC_014017	TAC	2	6	10156	10161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014017	TAA	2	6	10192	10197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014017	TCC	2	6	10295	10300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014017	ATT	2	6	10309	10314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014017	ATT	2	6	10348	10353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014017	TAT	2	6	10381	10386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_014017	TCT	2	6	19026	19031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496826
266	NC_014017	TTC	2	6	19065	19070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496826
267	NC_014017	CTT	2	6	19123	19128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496826
268	NC_014017	AAT	2	6	19257	19262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496826
269	NC_014017	CTT	2	6	19270	19275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496826
270	NC_014017	TGT	2	6	19278	19283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496826
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272	NC_014017	TTG	2	6	19382	19387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_014017	GAC	2	6	19724	19729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496827
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280	NC_014017	TAT	2	6	20177	20182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496828
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282	NC_014017	ACT	2	6	20415	20420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496828
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297	NC_014017	CAT	2	6	20977	20982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_014017	TCA	2	6	21050	21055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_014017	CGG	2	6	21087	21092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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302	NC_014017	CCT	2	6	21253	21258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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