MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	GCT	2	6	458	463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496809
2	NC_014017	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496809
3	NC_014017	GAC	2	6	555	560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496809
4	NC_014017	CGA	2	6	661	666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496809
5	NC_014017	GCC	2	6	892	897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496809
6	NC_014017	GCG	2	6	936	941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496809
7	NC_014017	GTG	3	9	1069	1077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496810
8	NC_014017	TGA	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496810
9	NC_014017	TTA	2	6	1146	1151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496810
10	NC_014017	TCA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496810
11	NC_014017	GTT	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496810
12	NC_014017	AAT	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496810
13	NC_014017	ATC	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496811
14	NC_014017	GGT	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496811
15	NC_014017	TGC	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496811
16	NC_014017	GCA	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496811
17	NC_014017	TGC	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496811
18	NC_014017	TGG	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496811
19	NC_014017	TGG	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496811
20	NC_014017	GGC	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496811
21	NC_014017	TTC	2	6	4273	4278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496813
22	NC_014017	TTC	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496813
23	NC_014017	GTA	2	6	4430	4435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496813
24	NC_014017	ATT	2	6	4498	4503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496813
25	NC_014017	AAT	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496813
26	NC_014017	TCG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496813
27	NC_014017	TCA	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496813
28	NC_014017	CTG	2	6	4885	4890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496813
29	NC_014017	ACG	2	6	4926	4931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496813
30	NC_014017	TAA	2	6	4939	4944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496813
31	NC_014017	TGC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496813
32	NC_014017	CCG	2	6	5100	5105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496813
33	NC_014017	CAT	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496813
34	NC_014017	TCA	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496813
35	NC_014017	AGC	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
36	NC_014017	AAC	2	6	5370	5375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496814
37	NC_014017	CCG	2	6	5567	5572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496814
38	NC_014017	CAG	2	6	5594	5599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
39	NC_014017	CAT	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496814
40	NC_014017	AGC	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
41	NC_014017	TAA	2	6	5694	5699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496814
42	NC_014017	AAG	2	6	5777	5782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496814
43	NC_014017	AGC	2	6	5826	5831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
44	NC_014017	ATC	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496814
45	NC_014017	ATA	2	6	5850	5855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496814
46	NC_014017	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496814
47	NC_014017	TCT	2	6	5869	5874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496814
48	NC_014017	CAC	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496814
49	NC_014017	AAC	2	6	6042	6047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496814
50	NC_014017	CAG	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
51	NC_014017	AGC	2	6	6267	6272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
52	NC_014017	CCA	2	6	7571	7576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496815
53	NC_014017	CAC	2	6	7756	7761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496815
54	NC_014017	CAG	2	6	7783	7788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496815
55	NC_014017	CTG	2	6	7799	7804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496815
56	NC_014017	GCT	2	6	7808	7813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496815
57	NC_014017	GGC	2	6	7911	7916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496815
58	NC_014017	TCA	2	6	7982	7987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496816
59	NC_014017	CTT	3	9	8108	8116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496816
60	NC_014017	CTT	2	6	8430	8435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496817
61	NC_014017	GAA	2	6	8462	8467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496817
62	NC_014017	GCC	2	6	8549	8554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496817
63	NC_014017	GTG	2	6	8573	8578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496817
64	NC_014017	CAA	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496817
65	NC_014017	GCC	2	6	8666	8671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496817
66	NC_014017	GCA	2	6	8747	8752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496817
67	NC_014017	TCT	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496817
68	NC_014017	ATA	2	6	9611	9616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496818
69	NC_014017	TCC	2	6	9647	9652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496818
70	NC_014017	GAT	2	6	9667	9672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496818
71	NC_014017	ATA	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496818
72	NC_014017	TCA	2	6	9701	9706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496818
73	NC_014017	TCA	2	6	9725	9730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496818
74	NC_014017	ATT	2	6	9853	9858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496818
75	NC_014017	ATA	2	6	9957	9962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496818
76	NC_014017	AGT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496818
77	NC_014017	TCT	2	6	10061	10066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496818
78	NC_014017	TAA	2	6	10143	10148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496818
79	NC_014017	ATT	2	6	10692	10697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496819
80	NC_014017	CCA	2	6	10809	10814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496819
81	NC_014017	GCA	2	6	10884	10889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496819
82	NC_014017	TTC	2	6	11022	11027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496819
83	NC_014017	ATA	2	6	11033	11038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496819
84	NC_014017	ACG	2	6	11318	11323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496819
85	NC_014017	ATT	2	6	11344	11349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496819
86	NC_014017	GCG	2	6	11432	11437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496819
87	NC_014017	GTG	2	6	11454	11459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496819
88	NC_014017	TTC	2	6	11465	11470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496819
89	NC_014017	AGG	2	6	11610	11615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294496819
90	NC_014017	ATC	2	6	11753	11758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496820
91	NC_014017	GTT	2	6	11772	11777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496820
92	NC_014017	CAA	2	6	11881	11886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496820
93	NC_014017	TGA	2	6	11940	11945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496820
94	NC_014017	ATT	2	6	12006	12011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496820
95	NC_014017	AAT	2	6	12074	12079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496821
96	NC_014017	AAG	2	6	12144	12149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496821
97	NC_014017	ATT	2	6	12155	12160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496821
98	NC_014017	AAT	2	6	12203	12208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496821
99	NC_014017	TAT	2	6	12209	12214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496821
100	NC_014017	TTA	2	6	12217	12222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496821
101	NC_014017	TAA	2	6	12271	12276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496821
102	NC_014017	CCA	2	6	12279	12284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496821
103	NC_014017	TCC	2	6	12302	12307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496821
104	NC_014017	ATT	2	6	12744	12749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496822
105	NC_014017	GCA	2	6	12751	12756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496822
106	NC_014017	CCG	2	6	12760	12765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496822
107	NC_014017	TTA	2	6	12784	12789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496822
108	NC_014017	TAT	3	9	12808	12816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496822
109	NC_014017	GAT	2	6	12918	12923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496822
110	NC_014017	GCT	2	6	13041	13046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496822
111	NC_014017	TCT	2	6	13126	13131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496822
112	NC_014017	TAC	2	6	14376	14381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496823
113	NC_014017	CAT	2	6	14389	14394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496823
114	NC_014017	GAT	2	6	14563	14568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496823
115	NC_014017	TTA	3	9	14625	14633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496823
116	NC_014017	TTC	2	6	14645	14650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496823
117	NC_014017	ATA	2	6	14705	14710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496823
118	NC_014017	TGG	2	6	14717	14722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496823
119	NC_014017	AAG	2	6	14763	14768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496823
120	NC_014017	AAT	2	6	14803	14808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496823
121	NC_014017	AAG	2	6	14892	14897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496823
122	NC_014017	TTC	2	6	14921	14926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496823
123	NC_014017	ATT	2	6	14933	14938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496823
124	NC_014017	CAA	2	6	14944	14949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496823
125	NC_014017	AAG	2	6	15018	15023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496823
126	NC_014017	TTC	2	6	15047	15052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496823
127	NC_014017	ATT	2	6	15059	15064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496823
128	NC_014017	CAG	2	6	15067	15072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496823
129	NC_014017	AGG	2	6	15089	15094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294496823
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257	NC_014017	TAA	2	6	25253	25258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496834
258	NC_014017	TTG	2	6	25290	25295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496834
259	NC_014017	AAT	2	6	25330	25335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496834
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270	NC_014017	TTA	2	6	26649	26654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496835
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