MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	CT	3	6	231	236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014017	CG	3	6	699	704	0 %	0 %	50 %	50 %	294496809
3	NC_014017	TA	3	6	1135	1140	50 %	50 %	0 %	0 %	294496810
4	NC_014017	AT	3	6	1228	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	294496810
5	NC_014017	AT	3	6	1243	1248	50 %	50 %	0 %	0 %	294496810
6	NC_014017	TC	3	6	2424	2429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014017	TA	3	6	2524	2529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014017	TA	3	6	2531	2536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014017	AT	3	6	2887	2892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014017	AT	3	6	3051	3056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014017	GT	3	6	3282	3287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014017	AC	3	6	3368	3373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014017	TC	3	6	4396	4401	0 %	50 %	0 %	50 %	294496813
14	NC_014017	GA	4	8	4623	4630	50 %	0 %	50 %	0 %	294496813
15	NC_014017	AT	3	6	6443	6448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014017	AT	3	6	6641	6646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014017	AC	3	6	7480	7485	50 %	0 %	0 %	50 %	294496815
18	NC_014017	AT	3	6	7595	7600	50 %	50 %	0 %	0 %	294496815
19	NC_014017	CA	3	6	7607	7612	50 %	0 %	0 %	50 %	294496815
20	NC_014017	TG	3	6	8504	8509	0 %	50 %	50 %	0 %	294496817
21	NC_014017	AG	3	6	9743	9748	50 %	0 %	50 %	0 %	294496818
22	NC_014017	AT	3	6	10341	10346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014017	AT	3	6	10596	10601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014017	GA	3	6	10957	10962	50 %	0 %	50 %	0 %	294496819
25	NC_014017	TC	3	6	11401	11406	0 %	50 %	0 %	50 %	294496819
26	NC_014017	TA	3	6	12106	12111	50 %	50 %	0 %	0 %	294496821
27	NC_014017	TA	4	8	12322	12329	50 %	50 %	0 %	0 %	294496821
28	NC_014017	AT	3	6	13511	13516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014017	AT	3	6	13609	13614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014017	CT	3	6	14495	14500	0 %	50 %	0 %	50 %	294496823
31	NC_014017	CT	3	6	15324	15329	0 %	50 %	0 %	50 %	294496823
32	NC_014017	TA	3	6	15679	15684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014017	TA	3	6	15687	15692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014017	TA	3	6	17256	17261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014017	CT	3	6	17678	17683	0 %	50 %	0 %	50 %	294496825
36	NC_014017	CA	3	6	19773	19778	50 %	0 %	0 %	50 %	294496827
37	NC_014017	AG	3	6	19840	19845	50 %	0 %	50 %	0 %	294496827
38	NC_014017	CA	3	6	21144	21149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014017	GA	3	6	21426	21431	50 %	0 %	50 %	0 %	294496829
40	NC_014017	AT	3	6	22027	22032	50 %	50 %	0 %	0 %	294496830
41	NC_014017	AT	3	6	22083	22088	50 %	50 %	0 %	0 %	294496830
42	NC_014017	GA	3	6	22363	22368	50 %	0 %	50 %	0 %	294496830
43	NC_014017	AT	3	6	23206	23211	50 %	50 %	0 %	0 %	294496830
44	NC_014017	CG	3	6	23309	23314	0 %	0 %	50 %	50 %	294496830
45	NC_014017	AG	3	6	23397	23402	50 %	0 %	50 %	0 %	294496830
46	NC_014017	GC	3	6	24085	24090	0 %	0 %	50 %	50 %	294496831
47	NC_014017	CT	3	6	27153	27158	0 %	50 %	0 %	50 %	294496835
48	NC_014017	AG	3	6	28382	28387	50 %	0 %	50 %	0 %	294496837
49	NC_014017	CG	3	6	28942	28947	0 %	0 %	50 %	50 %	294496837
50	NC_014017	GC	3	6	29027	29032	0 %	0 %	50 %	50 %	294496837
51	NC_014017	CA	3	6	30125	30130	50 %	0 %	0 %	50 %	294496838
52	NC_014017	CT	3	6	31636	31641	0 %	50 %	0 %	50 %	294496840
53	NC_014017	GC	3	6	32043	32048	0 %	0 %	50 %	50 %	294496841
54	NC_014017	AT	3	6	32621	32626	50 %	50 %	0 %	0 %	294496841
55	NC_014017	AT	3	6	33239	33244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014017	AT	3	6	33261	33266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014017	TG	3	6	33609	33614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014017	CA	3	6	33753	33758	50 %	0 %	0 %	50 %	294496842
59	NC_014017	CT	3	6	33905	33910	0 %	50 %	0 %	50 %	294496842
60	NC_014017	AT	3	6	34114	34119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014017	TA	3	6	34230	34235	50 %	50 %	0 %	0 %	294496843
62	NC_014017	TC	3	6	34615	34620	0 %	50 %	0 %	50 %	294496843
63	NC_014017	TA	4	8	35349	35356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014017	GT	3	6	37581	37586	0 %	50 %	50 %	0 %	294496845
65	NC_014017	CG	3	6	37845	37850	0 %	0 %	50 %	50 %	294496846
66	NC_014017	AG	3	6	39000	39005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014017	AC	3	6	40372	40377	50 %	0 %	0 %	50 %	294496850
68	NC_014017	AG	3	6	41676	41681	50 %	0 %	50 %	0 %	294496852
69	NC_014017	TC	3	6	41903	41908	0 %	50 %	0 %	50 %	294496853
70	NC_014017	GC	3	6	41933	41938	0 %	0 %	50 %	50 %	294496853
71	NC_014017	AT	3	6	42516	42521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014017	TA	3	6	43081	43086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014017	GA	3	6	43258	43263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014017	AT	3	6	43600	43605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014017	CT	3	6	43835	43840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014017	GC	4	8	45987	45994	0 %	0 %	50 %	50 %	294496857
77	NC_014017	GT	3	6	46065	46070	0 %	50 %	50 %	0 %	294496857
78	NC_014017	CT	3	6	46421	46426	0 %	50 %	0 %	50 %	294496857
79	NC_014017	CT	3	6	46512	46517	0 %	50 %	0 %	50 %	294496857
80	NC_014017	AT	3	6	46732	46737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014017	TC	4	8	48557	48564	0 %	50 %	0 %	50 %	294496859
82	NC_014017	AT	3	6	49002	49007	50 %	50 %	0 %	0 %	294496859
83	NC_014017	TA	4	8	49398	49405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014017	AT	3	6	49484	49489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014017	TC	3	6	49579	49584	0 %	50 %	0 %	50 %	294496860
86	NC_014017	GC	3	6	50020	50025	0 %	0 %	50 %	50 %	294496860
87	NC_014017	GT	3	6	50052	50057	0 %	50 %	50 %	0 %	294496860
88	NC_014017	GT	3	6	51038	51043	0 %	50 %	50 %	0 %	294496860
89	NC_014017	GT	3	6	51461	51466	0 %	50 %	50 %	0 %	294496860
90	NC_014017	AG	3	6	51536	51541	50 %	0 %	50 %	0 %	294496860
91	NC_014017	GC	3	6	51973	51978	0 %	0 %	50 %	50 %	294496861
92	NC_014017	CA	3	6	52080	52085	50 %	0 %	0 %	50 %	294496861
93	NC_014017	CA	3	6	52168	52173	50 %	0 %	0 %	50 %	294496861
94	NC_014017	AT	3	6	52230	52235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014017	GT	3	6	52501	52506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014017	GC	3	6	53807	53812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014017	GC	3	6	54517	54522	0 %	0 %	50 %	50 %	294496862
98	NC_014017	CG	3	6	55022	55027	0 %	0 %	50 %	50 %	294496862
99	NC_014017	TG	3	6	55166	55171	0 %	50 %	50 %	0 %	294496862
100	NC_014017	TC	3	6	55531	55536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014017	GT	3	6	56238	56243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014017	GT	3	6	56395	56400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014017	AT	3	6	56633	56638	50 %	50 %	0 %	0 %	294496863
104	NC_014017	CA	3	6	56645	56650	50 %	0 %	0 %	50 %	294496863
105	NC_014017	CG	3	6	57876	57881	0 %	0 %	50 %	50 %	294496865
106	NC_014017	GA	3	6	58430	58435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014017	TC	3	6	59255	59260	0 %	50 %	0 %	50 %	294496866
108	NC_014017	AT	3	6	59970	59975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014017	AT	3	6	60092	60097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014017	TA	3	6	60380	60385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014017	TG	3	6	60739	60744	0 %	50 %	50 %	0 %	294496867
112	NC_014017	TC	3	6	61217	61222	0 %	50 %	0 %	50 %	294496868
113	NC_014017	AC	3	6	63273	63278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014017	TG	3	6	63294	63299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014017	CG	3	6	63384	63389	0 %	0 %	50 %	50 %	294496869
116	NC_014017	GT	3	6	63626	63631	0 %	50 %	50 %	0 %	294496869
117	NC_014017	GA	3	6	63753	63758	50 %	0 %	50 %	0 %	294496869
118	NC_014017	TA	3	6	64157	64162	50 %	50 %	0 %	0 %	294496870
119	NC_014017	AC	3	6	64526	64531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014017	GA	3	6	65441	65446	50 %	0 %	50 %	0 %	294496872
121	NC_014017	TC	3	6	66686	66691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014017	GT	3	6	68100	68105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.