MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	CT	3	6	231	236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014017	TC	3	6	2424	2429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014017	TA	3	6	2524	2529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014017	TA	3	6	2531	2536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014017	AT	3	6	2887	2892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014017	AT	3	6	3051	3056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014017	GT	3	6	3282	3287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014017	AC	3	6	3368	3373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014017	AT	3	6	6443	6448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014017	AT	3	6	6641	6646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014017	AT	3	6	10341	10346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014017	AT	3	6	10596	10601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014017	AT	3	6	13511	13516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014017	AT	3	6	13609	13614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014017	TA	3	6	15679	15684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014017	TA	3	6	15687	15692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014017	TA	3	6	17256	17261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014017	CA	3	6	21144	21149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014017	AT	3	6	33239	33244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014017	AT	3	6	33261	33266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014017	TG	3	6	33609	33614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014017	AT	3	6	34114	34119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014017	TA	4	8	35349	35356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014017	AG	3	6	39000	39005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014017	AT	3	6	42516	42521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014017	TA	3	6	43081	43086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014017	GA	3	6	43258	43263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014017	AT	3	6	43600	43605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014017	CT	3	6	43835	43840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014017	AT	3	6	46732	46737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014017	TA	4	8	49398	49405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014017	AT	3	6	49484	49489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014017	AT	3	6	52230	52235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014017	GT	3	6	52501	52506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014017	GC	3	6	53807	53812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014017	TC	3	6	55531	55536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014017	GT	3	6	56238	56243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014017	GT	3	6	56395	56400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014017	GA	3	6	58430	58435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014017	AT	3	6	59970	59975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014017	AT	3	6	60092	60097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014017	TA	3	6	60380	60385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014017	AC	3	6	63273	63278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014017	TG	3	6	63294	63299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014017	AC	3	6	64526	64531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014017	TC	3	6	66686	66691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014017	GT	3	6	68100	68105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.