MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	C	6	6	1193	1198	0 %	0 %	0 %	100 %	294496810
2	NC_014017	T	6	6	1570	1575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014017	T	6	6	2388	2393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014017	A	6	6	2761	2766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014017	A	7	7	3408	3414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014017	T	6	6	3415	3420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014017	A	9	9	3449	3457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014017	A	7	7	3803	3809	100 %	0 %	0 %	0 %	294496812
9	NC_014017	T	7	7	4368	4374	0 %	100 %	0 %	0 %	294496813
10	NC_014017	A	6	6	6409	6414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014017	A	6	6	6701	6706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014017	G	7	7	7196	7202	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014017	G	6	6	8898	8903	0 %	0 %	100 %	0 %	294496817
14	NC_014017	T	6	6	8933	8938	0 %	100 %	0 %	0 %	294496817
15	NC_014017	T	7	7	9019	9025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014017	T	6	6	9533	9538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014017	T	7	7	9715	9721	0 %	100 %	0 %	0 %	294496818
18	NC_014017	T	6	6	9787	9792	0 %	100 %	0 %	0 %	294496818
19	NC_014017	A	6	6	10479	10484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014017	A	7	7	11390	11396	100 %	0 %	0 %	0 %	294496819
21	NC_014017	A	6	6	12397	12402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014017	A	6	6	12508	12513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014017	C	8	8	12711	12718	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_014017	A	6	6	13008	13013	100 %	0 %	0 %	0 %	294496822
25	NC_014017	A	7	7	13168	13174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014017	A	6	6	13176	13181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014017	A	6	6	13243	13248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014017	T	6	6	13251	13256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014017	G	7	7	13658	13664	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014017	T	6	6	13862	13867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014017	A	6	6	14057	14062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014017	A	6	6	14740	14745	100 %	0 %	0 %	0 %	294496823
33	NC_014017	T	6	6	14981	14986	0 %	100 %	0 %	0 %	294496823
34	NC_014017	T	6	6	15107	15112	0 %	100 %	0 %	0 %	294496823
35	NC_014017	A	6	6	15570	15575	100 %	0 %	0 %	0 %	294496823
36	NC_014017	A	6	6	16174	16179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014017	A	6	6	16731	16736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014017	C	7	7	16934	16940	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_014017	T	6	6	16989	16994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014017	T	7	7	18154	18160	0 %	100 %	0 %	0 %	294496825
41	NC_014017	G	6	6	19396	19401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014017	T	6	6	20096	20101	0 %	100 %	0 %	0 %	294496828
43	NC_014017	T	7	7	20261	20267	0 %	100 %	0 %	0 %	294496828
44	NC_014017	T	6	6	21988	21993	0 %	100 %	0 %	0 %	294496830
45	NC_014017	G	8	8	23728	23735	0 %	0 %	100 %	0 %	294496830
46	NC_014017	G	6	6	24511	24516	0 %	0 %	100 %	0 %	294496832
47	NC_014017	A	7	7	25184	25190	100 %	0 %	0 %	0 %	294496834
48	NC_014017	T	6	6	26171	26176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014017	G	6	6	26576	26581	0 %	0 %	100 %	0 %	294496835
50	NC_014017	G	9	9	26741	26749	0 %	0 %	100 %	0 %	294496835
51	NC_014017	A	6	6	27720	27725	100 %	0 %	0 %	0 %	294496836
52	NC_014017	A	6	6	28182	28187	100 %	0 %	0 %	0 %	294496837
53	NC_014017	A	6	6	28634	28639	100 %	0 %	0 %	0 %	294496837
54	NC_014017	C	7	7	30438	30444	0 %	0 %	0 %	100 %	294496839
55	NC_014017	T	7	7	30639	30645	0 %	100 %	0 %	0 %	294496839
56	NC_014017	T	7	7	32241	32247	0 %	100 %	0 %	0 %	294496841
57	NC_014017	A	7	7	32352	32358	100 %	0 %	0 %	0 %	294496841
58	NC_014017	T	8	8	33344	33351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014017	T	7	7	33429	33435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014017	C	7	7	33687	33693	0 %	0 %	0 %	100 %	294496842
61	NC_014017	T	6	6	34387	34392	0 %	100 %	0 %	0 %	294496843
62	NC_014017	T	6	6	34399	34404	0 %	100 %	0 %	0 %	294496843
63	NC_014017	T	8	8	34981	34988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014017	T	7	7	35254	35260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014017	A	6	6	35386	35391	100 %	0 %	0 %	0 %	294496844
66	NC_014017	T	6	6	35811	35816	0 %	100 %	0 %	0 %	294496845
67	NC_014017	A	6	6	36320	36325	100 %	0 %	0 %	0 %	294496845
68	NC_014017	T	6	6	37871	37876	0 %	100 %	0 %	0 %	294496846
69	NC_014017	T	6	6	38018	38023	0 %	100 %	0 %	0 %	294496847
70	NC_014017	A	6	6	38142	38147	100 %	0 %	0 %	0 %	294496847
71	NC_014017	A	6	6	38389	38394	100 %	0 %	0 %	0 %	294496847
72	NC_014017	G	6	6	38655	38660	0 %	0 %	100 %	0 %	294496847
73	NC_014017	A	6	6	38951	38956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014017	G	7	7	40513	40519	0 %	0 %	100 %	0 %	294496850
75	NC_014017	T	6	6	42608	42613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014017	A	7	7	42642	42648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014017	G	6	6	42785	42790	0 %	0 %	100 %	0 %	294496854
78	NC_014017	G	6	6	43402	43407	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014017	C	6	6	43556	43561	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_014017	A	7	7	43877	43883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014017	A	6	6	44854	44859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014017	T	6	6	45544	45549	0 %	100 %	0 %	0 %	294496857
83	NC_014017	A	6	6	46612	46617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014017	T	6	6	46620	46625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014017	T	6	6	46711	46716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014017	T	6	6	46756	46761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014017	A	6	6	46762	46767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014017	T	6	6	47746	47751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014017	T	6	6	48008	48013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014017	T	8	8	48368	48375	0 %	100 %	0 %	0 %	294496859
91	NC_014017	T	6	6	48430	48435	0 %	100 %	0 %	0 %	294496859
92	NC_014017	T	7	7	48574	48580	0 %	100 %	0 %	0 %	294496859
93	NC_014017	T	6	6	48857	48862	0 %	100 %	0 %	0 %	294496859
94	NC_014017	T	6	6	49411	49416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014017	C	6	6	50251	50256	0 %	0 %	0 %	100 %	294496860
96	NC_014017	C	8	8	50309	50316	0 %	0 %	0 %	100 %	294496860
97	NC_014017	A	7	7	51950	51956	100 %	0 %	0 %	0 %	294496861
98	NC_014017	T	6	6	53144	53149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014017	T	7	7	53841	53847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014017	A	6	6	54099	54104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014017	T	7	7	55107	55113	0 %	100 %	0 %	0 %	294496862
102	NC_014017	T	6	6	55650	55655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014017	C	6	6	55975	55980	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_014017	A	6	6	58513	58518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014017	T	6	6	59016	59021	0 %	100 %	0 %	0 %	294496866
106	NC_014017	T	6	6	59076	59081	0 %	100 %	0 %	0 %	294496866
107	NC_014017	T	8	8	59666	59673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014017	A	6	6	60045	60050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014017	A	9	9	60187	60195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014017	A	7	7	60264	60270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014017	T	7	7	60323	60329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014017	A	6	6	60351	60356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014017	A	7	7	60360	60366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014017	A	7	7	60481	60487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014017	G	6	6	61544	61549	0 %	0 %	100 %	0 %	294496868
116	NC_014017	T	6	6	62607	62612	0 %	100 %	0 %	0 %	294496868
117	NC_014017	T	6	6	63313	63318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014017	A	7	7	63862	63868	100 %	0 %	0 %	0 %	294496869
119	NC_014017	T	6	6	64549	64554	0 %	100 %	0 %	0 %	294496871
120	NC_014017	A	6	6	65223	65228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014017	T	7	7	66676	66682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014017	A	8	8	66861	66868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014017	T	6	6	67326	67331	0 %	100 %	0 %	0 %	294496874

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.