MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	C	6	6	1193	1198	0 %	0 %	0 %	100 %	294496810
2	NC_014017	A	7	7	3803	3809	100 %	0 %	0 %	0 %	294496812
3	NC_014017	T	7	7	4368	4374	0 %	100 %	0 %	0 %	294496813
4	NC_014017	G	6	6	8898	8903	0 %	0 %	100 %	0 %	294496817
5	NC_014017	T	6	6	8933	8938	0 %	100 %	0 %	0 %	294496817
6	NC_014017	T	7	7	9715	9721	0 %	100 %	0 %	0 %	294496818
7	NC_014017	T	6	6	9787	9792	0 %	100 %	0 %	0 %	294496818
8	NC_014017	A	7	7	11390	11396	100 %	0 %	0 %	0 %	294496819
9	NC_014017	A	6	6	13008	13013	100 %	0 %	0 %	0 %	294496822
10	NC_014017	A	6	6	14740	14745	100 %	0 %	0 %	0 %	294496823
11	NC_014017	T	6	6	14981	14986	0 %	100 %	0 %	0 %	294496823
12	NC_014017	T	6	6	15107	15112	0 %	100 %	0 %	0 %	294496823
13	NC_014017	A	6	6	15570	15575	100 %	0 %	0 %	0 %	294496823
14	NC_014017	T	7	7	18154	18160	0 %	100 %	0 %	0 %	294496825
15	NC_014017	T	6	6	20096	20101	0 %	100 %	0 %	0 %	294496828
16	NC_014017	T	7	7	20261	20267	0 %	100 %	0 %	0 %	294496828
17	NC_014017	T	6	6	21988	21993	0 %	100 %	0 %	0 %	294496830
18	NC_014017	G	8	8	23728	23735	0 %	0 %	100 %	0 %	294496830
19	NC_014017	G	6	6	24511	24516	0 %	0 %	100 %	0 %	294496832
20	NC_014017	A	7	7	25184	25190	100 %	0 %	0 %	0 %	294496834
21	NC_014017	G	6	6	26576	26581	0 %	0 %	100 %	0 %	294496835
22	NC_014017	G	9	9	26741	26749	0 %	0 %	100 %	0 %	294496835
23	NC_014017	A	6	6	27720	27725	100 %	0 %	0 %	0 %	294496836
24	NC_014017	A	6	6	28182	28187	100 %	0 %	0 %	0 %	294496837
25	NC_014017	A	6	6	28634	28639	100 %	0 %	0 %	0 %	294496837
26	NC_014017	C	7	7	30438	30444	0 %	0 %	0 %	100 %	294496839
27	NC_014017	T	7	7	30639	30645	0 %	100 %	0 %	0 %	294496839
28	NC_014017	T	7	7	32241	32247	0 %	100 %	0 %	0 %	294496841
29	NC_014017	A	7	7	32352	32358	100 %	0 %	0 %	0 %	294496841
30	NC_014017	C	7	7	33687	33693	0 %	0 %	0 %	100 %	294496842
31	NC_014017	T	6	6	34387	34392	0 %	100 %	0 %	0 %	294496843
32	NC_014017	T	6	6	34399	34404	0 %	100 %	0 %	0 %	294496843
33	NC_014017	A	6	6	35386	35391	100 %	0 %	0 %	0 %	294496844
34	NC_014017	T	6	6	35811	35816	0 %	100 %	0 %	0 %	294496845
35	NC_014017	A	6	6	36320	36325	100 %	0 %	0 %	0 %	294496845
36	NC_014017	T	6	6	37871	37876	0 %	100 %	0 %	0 %	294496846
37	NC_014017	T	6	6	38018	38023	0 %	100 %	0 %	0 %	294496847
38	NC_014017	A	6	6	38142	38147	100 %	0 %	0 %	0 %	294496847
39	NC_014017	A	6	6	38389	38394	100 %	0 %	0 %	0 %	294496847
40	NC_014017	G	6	6	38655	38660	0 %	0 %	100 %	0 %	294496847
41	NC_014017	G	7	7	40513	40519	0 %	0 %	100 %	0 %	294496850
42	NC_014017	G	6	6	42785	42790	0 %	0 %	100 %	0 %	294496854
43	NC_014017	T	6	6	45544	45549	0 %	100 %	0 %	0 %	294496857
44	NC_014017	T	8	8	48368	48375	0 %	100 %	0 %	0 %	294496859
45	NC_014017	T	6	6	48430	48435	0 %	100 %	0 %	0 %	294496859
46	NC_014017	T	7	7	48574	48580	0 %	100 %	0 %	0 %	294496859
47	NC_014017	T	6	6	48857	48862	0 %	100 %	0 %	0 %	294496859
48	NC_014017	C	6	6	50251	50256	0 %	0 %	0 %	100 %	294496860
49	NC_014017	C	8	8	50309	50316	0 %	0 %	0 %	100 %	294496860
50	NC_014017	A	7	7	51950	51956	100 %	0 %	0 %	0 %	294496861
51	NC_014017	T	7	7	55107	55113	0 %	100 %	0 %	0 %	294496862
52	NC_014017	T	6	6	59016	59021	0 %	100 %	0 %	0 %	294496866
53	NC_014017	T	6	6	59076	59081	0 %	100 %	0 %	0 %	294496866
54	NC_014017	G	6	6	61544	61549	0 %	0 %	100 %	0 %	294496868
55	NC_014017	T	6	6	62607	62612	0 %	100 %	0 %	0 %	294496868
56	NC_014017	A	7	7	63862	63868	100 %	0 %	0 %	0 %	294496869
57	NC_014017	T	6	6	64549	64554	0 %	100 %	0 %	0 %	294496871
58	NC_014017	T	6	6	67326	67331	0 %	100 %	0 %	0 %	294496874

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.