MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma crocodyli MP145 chromosome

Total Repeats: 420

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014014	TAAGTA	2	12	1695	1706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294155302
2	NC_014014	AATAAG	2	12	4172	4183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294155305
3	NC_014014	TTAATG	2	12	6971	6982	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294155307
4	NC_014014	TAAAGA	2	12	8236	8247	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294155308
5	NC_014014	AAAACA	2	12	11618	11629	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	294155311
6	NC_014014	AGATAA	2	12	13174	13185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294155312
7	NC_014014	TAAAAA	2	12	13261	13272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294155312
8	NC_014014	TGAATT	2	12	14026	14037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294155314
9	NC_014014	TTCTGA	2	12	14791	14802	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294155314
10	NC_014014	TGTTAA	2	12	14830	14841	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294155314
11	NC_014014	ATTGAT	2	12	15008	15019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294155314
12	NC_014014	CAAATA	2	12	16911	16922	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294155316
13	NC_014014	TTGCTA	2	12	18950	18961	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294155318
14	NC_014014	TTTGAC	2	12	22439	22450	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294155321
15	NC_014014	AAAGAG	2	12	22845	22856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294155322
16	NC_014014	TCATTT	2	12	23042	23053	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294155322
17	NC_014014	AATGTT	2	12	23339	23350	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294155322
18	NC_014014	ACAAAA	2	12	27701	27712	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	294155324
19	NC_014014	TATTTT	2	12	28050	28061	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294155324
20	NC_014014	AAAAGC	2	12	29354	29365	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294155325
21	NC_014014	TTATTT	2	12	31323	31334	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294155328
22	NC_014014	CAAAAA	2	12	33339	33350	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	294155330
23	NC_014014	TAGAGA	2	12	36984	36995	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294155333
24	NC_014014	CAAAAA	2	12	41664	41675	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	294155339
25	NC_014014	ATTAAA	2	12	43505	43516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294155341
26	NC_014014	GATCTA	2	12	44252	44263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294155342
27	NC_014014	TTTATT	2	12	44791	44802	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294155342
28	NC_014014	AGACAT	2	12	45431	45442	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294155342
29	NC_014014	AAATTT	2	12	50383	50394	50 %	50 %	0 %	0 %	294155348
30	NC_014014	GTTTTG	2	12	52173	52184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294155350
31	NC_014014	GAAAAA	2	12	52407	52418	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294155350
32	NC_014014	GAACTT	2	12	52566	52577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294155350
33	NC_014014	ATTGTT	2	12	55197	55208	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294155352
34	NC_014014	TTCTTT	2	12	57300	57311	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294155353
35	NC_014014	ATTGCT	2	12	59269	59280	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294155353
36	NC_014014	CTGGGA	2	12	62869	62880	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294155356
37	NC_014014	TTTAAA	2	12	66113	66124	50 %	50 %	0 %	0 %	294155361
38	NC_014014	TTCTAT	2	12	66539	66550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294155362
39	NC_014014	TTTCAT	2	12	69210	69221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294155364
40	NC_014014	CTAAAA	2	12	70327	70338	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294155366
41	NC_014014	TATTTT	2	12	71216	71227	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294155367
42	NC_014014	CAAAAC	2	12	74318	74329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294155371
43	NC_014014	AAACAC	2	12	74683	74694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294155372
44	NC_014014	TTCTAA	2	12	82753	82764	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294155376
45	NC_014014	TGTTTT	2	12	84653	84664	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	294155378
46	NC_014014	AATATA	2	12	85011	85022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294155378
47	NC_014014	CAGAAT	2	12	85986	85997	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294155379
48	NC_014014	TGCAAA	2	12	88127	88138	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294155381
49	NC_014014	TGACAA	2	12	91899	91910	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294155383
50	NC_014014	TTTTAT	2	12	92891	92902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294155384
51	NC_014014	AAAAAT	2	12	93159	93170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294155384
52	NC_014014	TTGAAC	2	12	93439	93450	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294155384
53	NC_014014	TACAAA	2	12	95824	95835	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294155388
54	NC_014014	GCATTT	2	12	102825	102836	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294155393
55	NC_014014	TTTTTC	2	12	103043	103054	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294155394
56	NC_014014	ATCTTT	2	12	104680	104691	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294155394
57	NC_014014	TTTTTC	2	12	105269	105280	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294155394
58	NC_014014	TTACTT	2	12	108251	108262	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294155398
59	NC_014014	TAAATT	2	12	109776	109787	50 %	50 %	0 %	0 %	294155401
60	NC_014014	ATTGCG	2	12	114271	114282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294155404
61	NC_014014	GAAAAA	2	12	117710	117721	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294155407
62	NC_014014	CTGATA	2	12	118337	118348	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294155408
63	NC_014014	TTTTAA	2	12	120740	120751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294155411
64	NC_014014	AAAGGA	2	12	123749	123760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294155415
65	NC_014014	AAGTTG	2	12	124128	124139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294155415
66	NC_014014	AAAGAA	2	12	124193	124204	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294155415
67	NC_014014	AAAAGG	2	12	132232	132243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294155432
68	NC_014014	CTAAAA	2	12	138965	138976	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294155437
69	NC_014014	AAAGAA	2	12	140586	140597	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294155442
70	NC_014014	CAAAAG	2	12	142092	142103	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294155444
71	NC_014014	AATTTT	2	12	142501	142512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294155445
72	NC_014014	CTCTTC	2	12	143163	143174	0 %	50 %	0 %	50 %	294155445
73	NC_014014	TAATTA	2	12	145564	145575	50 %	50 %	0 %	0 %	294155447
74	NC_014014	TAGAAA	2	12	147622	147633	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294155448
75	NC_014014	TCAATT	2	12	153323	153334	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294155455
76	NC_014014	ATTGAA	2	12	153629	153640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294155455
77	NC_014014	GCAATT	2	12	153876	153887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294155456
78	NC_014014	TGAATT	2	12	154931	154942	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294155456
79	NC_014014	TTAAAT	2	12	155608	155619	50 %	50 %	0 %	0 %	294155456
80	NC_014014	AAAAGT	2	12	156017	156028	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294155456
81	NC_014014	AACTTA	2	12	156292	156303	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294155456
82	NC_014014	TACAAA	2	12	156419	156430	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294155456
83	NC_014014	TAAAGA	2	12	156833	156844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294155457
84	NC_014014	AAAGTT	2	12	157170	157181	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294155457
85	NC_014014	TAAAAG	2	12	157453	157464	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294155457
86	NC_014014	TTAATA	2	12	157465	157476	50 %	50 %	0 %	0 %	294155457
87	NC_014014	TATTTT	2	12	158760	158771	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294155459
88	NC_014014	AAACAA	2	12	159164	159175	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	294155459
89	NC_014014	TGGATT	2	12	172769	172780	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294155462
90	NC_014014	TTTAAT	2	12	173408	173419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294155462
91	NC_014014	AGCAGA	2	12	183828	183839	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294155468
92	NC_014014	AATAGA	2	12	186751	186762	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294155469
93	NC_014014	GCTATT	2	12	188626	188637	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294155470
94	NC_014014	ATTTCT	2	12	188926	188937	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294155471
95	NC_014014	TATTTA	2	12	190294	190305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294155472
96	NC_014014	ATATTA	2	12	190399	190410	50 %	50 %	0 %	0 %	294155472
97	NC_014014	CACTAA	2	12	205255	205266	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294155487
98	NC_014014	ATTGTA	2	12	209945	209956	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294155494
99	NC_014014	TATTAC	2	12	210564	210575	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294155495
100	NC_014014	TAAAAA	2	12	211870	211881	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294155496
101	NC_014014	AACAGC	2	12	217215	217226	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	294155499
102	NC_014014	GAAACA	2	12	217423	217434	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294155499
103	NC_014014	TTCTTT	2	12	220008	220019	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294155500
104	NC_014014	CCAGCA	3	18	221797	221814	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294155500
105	NC_014014	ATTTAT	2	12	226593	226604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294155505
106	NC_014014	TCATTT	2	12	227272	227283	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294155506
107	NC_014014	CAAAAA	2	12	230405	230416	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	294155508
108	NC_014014	CTTTAA	2	12	231088	231099	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294155509
109	NC_014014	AAGGTC	2	12	233854	233865	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294155511
110	NC_014014	ATTTGA	2	12	236780	236791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294155514
111	NC_014014	TAAAAA	2	12	236903	236914	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294155514
112	NC_014014	AAAATA	2	12	240281	240292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294155517
113	NC_014014	TGATAA	2	12	241824	241835	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294155517
114	NC_014014	AAATAT	2	12	241909	241920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294155517
115	NC_014014	AATTAA	2	12	242351	242362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294155518
116	NC_014014	TTTTAT	2	12	242439	242450	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294155518
117	NC_014014	TAAAAG	2	12	242732	242743	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294155518
118	NC_014014	TTCATC	2	12	250049	250060	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294155523
119	NC_014014	TACAAA	2	12	250274	250285	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294155523
120	NC_014014	ATATAA	2	12	257888	257899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294155528
121	NC_014014	TTAGAA	2	12	258018	258029	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294155529
122	NC_014014	TAAAGT	2	12	258073	258084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294155529
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.