MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 2

Total Repeats: 243

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014013	CGGA	2	8	1418	1425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014013	CCAC	2	8	1627	1634	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_014013	TGGG	2	8	3424	3431	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014013	AACA	2	8	5105	5112	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014013	GGCA	2	8	5590	5597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014013	CCCG	2	8	5621	5628	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_014013	AGGG	2	8	5655	5662	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014013	GGAT	2	8	8834	8841	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014013	CAAG	2	8	8948	8955	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014013	CATG	2	8	10676	10683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014013	CCTG	2	8	14771	14778	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014013	GAAG	2	8	15030	15037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014013	AAAT	2	8	16647	16654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014013	GGCG	2	8	18950	18957	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014013	AGCC	2	8	21572	21579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014013	CCTC	2	8	32100	32107	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_014013	AGGA	2	8	35094	35101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014013	GTCT	2	8	47574	47581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014013	ATGT	2	8	54639	54646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014013	ATTG	2	8	54653	54660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014013	GAGG	2	8	55561	55568	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014013	GCTG	2	8	57163	57170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014013	GGGA	2	8	60146	60153	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014013	AGCG	2	8	63050	63057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014013	CGCA	2	8	63058	63065	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014013	GCGG	2	8	63133	63140	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014013	TCCC	2	8	63166	63173	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_014013	GGCG	2	8	64950	64957	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014013	AGAA	2	8	65879	65886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014013	CCAC	2	8	65938	65945	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_014013	CCTG	2	8	82581	82588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014013	GATT	2	8	90558	90565	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014013	GCGG	2	8	90830	90837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014013	GCCG	2	8	93782	93789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014013	GGAT	2	8	93957	93964	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014013	GCGG	2	8	106890	106897	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014013	TGCT	2	8	108925	108932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014013	ACAT	2	8	108950	108957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014013	GGGA	2	8	109006	109013	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014013	TTTG	2	8	110819	110826	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014013	GCCA	2	8	115155	115162	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014013	GGAT	2	8	119117	119124	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014013	GTAA	2	8	119167	119174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014013	GAAC	2	8	119276	119283	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014013	GTGA	2	8	119621	119628	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014013	GGTG	2	8	119858	119865	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014013	TTGG	2	8	120997	121004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014013	GCGA	2	8	121699	121706	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014013	TTAG	2	8	121733	121740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014013	CAGA	2	8	122379	122386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014013	AAAG	2	8	122523	122530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014013	ACCG	2	8	122670	122677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014013	CAGG	2	8	122900	122907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014013	CCTC	2	8	124088	124095	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_014013	ACCC	2	8	124369	124376	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_014013	TCGG	2	8	127590	127597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014013	CGTC	2	8	128926	128933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014013	CGGG	2	8	131555	131562	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014013	CATG	2	8	131743	131750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014013	CATG	2	8	136005	136012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014013	CGCA	2	8	136273	136280	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014013	TCGT	2	8	138781	138788	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014013	AGCA	2	8	139444	139451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014013	AGAA	2	8	139649	139656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014013	TGCC	2	8	145181	145188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014013	TCCT	2	8	156268	156275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014013	TTCG	2	8	158114	158121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014013	CCGG	2	8	168116	168123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014013	CGGT	2	8	183512	183519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014013	CCTC	2	8	189125	189132	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_014013	GCGG	2	8	195130	195137	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014013	CAAA	2	8	198136	198143	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014013	GCCG	2	8	204975	204982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014013	TGCT	2	8	210889	210896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014013	GCAG	2	8	215914	215921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014013	CCTG	2	8	215951	215958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014013	GGCC	2	8	218573	218580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014013	GCCA	2	8	228627	228634	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014013	TTCC	2	8	235954	235961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014013	GGCT	2	8	254266	254273	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014013	GCCG	2	8	256956	256963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014013	CCGG	2	8	257687	257694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014013	CGTC	2	8	272896	272903	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014013	GGCA	2	8	287347	287354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014013	CTAA	2	8	287471	287478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014013	CTTC	2	8	287537	287544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014013	ATCC	2	8	288967	288974	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014013	TCGG	2	8	290199	290206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014013	GCAG	2	8	298578	298585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014013	TCAA	2	8	298623	298630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014013	AGAA	2	8	304054	304061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014013	AAGG	2	8	304214	304221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014013	GCCC	2	8	304759	304766	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_014013	TCGT	2	8	307667	307674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014013	TGGC	2	8	307818	307825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014013	CGGA	2	8	308232	308239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014013	GACG	2	8	308281	308288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014013	GGAT	2	8	308418	308425	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014013	GTAA	2	8	308469	308476	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014013	GAAC	2	8	308578	308585	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014013	GTGA	2	8	308923	308930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014013	GGTG	2	8	309160	309167	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014013	TGTT	2	8	310491	310498	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014013	GCGA	2	8	311167	311174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014013	TTAG	2	8	311201	311208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014013	CAGA	2	8	311847	311854	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014013	AAAG	2	8	311991	311998	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014013	ACCG	2	8	312138	312145	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014013	CAGG	2	8	312368	312375	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014013	CCTC	2	8	313556	313563	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_014013	AAAC	2	8	313720	313727	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014013	ACCC	2	8	313840	313847	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_014013	GCCA	2	8	316471	316478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014013	GGAG	2	8	316556	316563	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014013	TCCC	2	8	331706	331713	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_014013	TTCA	2	8	334362	334369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014013	TCCC	2	8	334928	334935	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_014013	CATT	2	8	336217	336224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014013	GATC	2	8	336262	336269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014013	GGAG	2	8	336322	336329	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014013	CCCT	2	8	344565	344572	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
122	NC_014013	GTCA	2	8	351711	351718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014013	ACGG	2	8	376233	376240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014013	CGCC	2	8	376450	376457	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_014013	CCTG	2	8	377196	377203	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014013	CGTC	2	8	377310	377317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014013	TCCG	2	8	377334	377341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014013	ATCG	2	8	384615	384622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014013	GCGG	2	8	384735	384742	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014013	CCTG	2	8	393549	393556	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014013	CGGC	2	8	398723	398730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014013	AAGA	2	8	398942	398949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014013	CCCT	2	8	401289	401296	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_014013	CAGG	2	8	412234	412241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014013	CAGG	2	8	412349	412356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014013	GAAA	2	8	413291	413298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014013	CGGC	2	8	420495	420502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014013	CTGT	2	8	420523	420530	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014013	GGTC	2	8	424770	424777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014013	GGCA	2	8	424885	424892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014013	TTGC	2	8	430908	430915	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014013	GAAC	2	8	433201	433208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014013	ACCC	2	8	437068	437075	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_014013	GCGG	2	8	438668	438675	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014013	ATCC	2	8	438688	438695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014013	AGCC	2	8	446402	446409	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014013	TGGG	2	8	449568	449575	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014013	CCCG	2	8	461361	461368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_014013	GGTC	2	8	461568	461575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014013	CAGG	2	8	466695	466702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014013	ATTT	2	8	470284	470291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014013	CCGC	2	8	472565	472572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
153	NC_014013	GCCG	2	8	472579	472586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_014013	GCAG	2	8	474660	474667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_014013	GGGA	2	8	474703	474710	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014013	CCGG	2	8	476402	476409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_014013	CCAC	2	8	477892	477899	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
158	NC_014013	CTGG	2	8	480999	481006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_014013	GCGG	2	8	481116	481123	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
160	NC_014013	GCGG	2	8	481199	481206	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
161	NC_014013	TCCA	2	8	483512	483519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_014013	CCGG	2	8	492964	492971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
163	NC_014013	CCGA	2	8	503438	503445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
164	NC_014013	CGGG	2	8	503475	503482	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
165	NC_014013	CCCG	2	8	505944	505951	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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167	NC_014013	CGAC	2	8	507051	507058	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
168	NC_014013	CGGC	2	8	508347	508354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
169	NC_014013	GCCG	2	8	511696	511703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
170	NC_014013	GGCA	2	8	512439	512446	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
171	NC_014013	ATTA	2	8	512530	512537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014013	CCAC	2	8	514176	514183	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
173	NC_014013	TGCC	2	8	514203	514210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
174	NC_014013	TGAT	2	8	523017	523024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_014013	GCAG	2	8	538591	538598	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
177	NC_014013	GCAG	2	8	541483	541490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
178	NC_014013	CGAG	2	8	543658	543665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
179	NC_014013	AGGT	2	8	543892	543899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014013	GGCG	2	8	544359	544366	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
181	NC_014013	CTTC	2	8	544504	544511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_014013	CTTC	2	8	546538	546545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
183	NC_014013	CGGA	2	8	548590	548597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
184	NC_014013	CGAG	2	8	551677	551684	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
185	NC_014013	CGAG	2	8	554160	554167	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
186	NC_014013	TTTG	2	8	556429	556436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014013	GGTA	2	8	556440	556447	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014013	TACC	2	8	556534	556541	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
189	NC_014013	TTGA	2	8	559613	559620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014013	TTGA	2	8	559681	559688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014013	TGCC	2	8	561054	561061	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
193	NC_014013	CGGC	2	8	562300	562307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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195	NC_014013	GAAC	2	8	566346	566353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
196	NC_014013	CGCC	2	8	567623	567630	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
197	NC_014013	GGAC	2	8	569968	569975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
198	NC_014013	TCGG	2	8	570146	570153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
199	NC_014013	GCCG	2	8	570714	570721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
200	NC_014013	GCCG	2	8	570728	570735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
201	NC_014013	GCGG	2	8	572670	572677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
202	NC_014013	CGGC	2	8	573578	573585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
203	NC_014013	GACC	2	8	576450	576457	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
204	NC_014013	TGAC	2	8	582180	582187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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221	NC_014013	AAGA	2	8	621521	621528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_014013	CGGC	2	8	681609	681616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
242	NC_014013	TCCC	2	8	681696	681703	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
243	NC_014013	CCCG	2	8	681771	681778	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.