MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 2

Total Repeats: 12875

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014013	CGC	2	6	9	14	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146430
2	NC_014013	TCC	2	6	47	52	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146430
3	NC_014013	GAT	2	6	90	95	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294146430
4	NC_014013	CTT	2	6	105	110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294146430
5	NC_014013	CGC	2	6	268	273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146430
6	NC_014013	ACG	2	6	281	286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146430
7	NC_014013	CTG	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146430
8	NC_014013	ACC	2	6	343	348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294146430
9	NC_014013	CCA	2	6	395	400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294146430
10	NC_014013	CCG	2	6	429	434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146430
11	NC_014013	CGA	2	6	477	482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146430
12	NC_014013	GCG	2	6	554	559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146430
13	NC_014013	CGG	2	6	594	599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146430
14	NC_014013	CGC	2	6	715	720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146430
15	NC_014013	GCC	2	6	824	829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146430
16	NC_014013	ACG	2	6	856	861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146430
17	NC_014013	CGG	2	6	868	873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146430
18	NC_014013	GCC	3	9	895	903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146430
19	NC_014013	CAA	2	6	912	917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294146430
20	NC_014013	GGC	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146430
21	NC_014013	CCG	2	6	1167	1172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146430
22	NC_014013	GAA	2	6	1182	1187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294146430
23	NC_014013	GGC	2	6	1225	1230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014013	TGG	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014013	ACC	2	6	1302	1307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014013	TCT	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014013	CCG	2	6	1440	1445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014013	CCG	3	9	1564	1572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_014013	CAG	2	6	1842	1847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014013	TCG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146431
31	NC_014013	AGC	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146431
32	NC_014013	TCG	2	6	2037	2042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146431
33	NC_014013	AAG	2	6	2173	2178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294146431
34	NC_014013	CCA	2	6	2189	2194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294146431
35	NC_014013	GCG	2	6	2205	2210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146431
36	NC_014013	CGC	2	6	2223	2228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146431
37	NC_014013	CCG	2	6	2277	2282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146431
38	NC_014013	GCC	2	6	2300	2305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146431
39	NC_014013	CCG	2	6	2309	2314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146431
40	NC_014013	CAG	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146431
41	NC_014013	CCT	2	6	2486	2491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146431
42	NC_014013	AGC	2	6	2503	2508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146431
43	NC_014013	TCG	2	6	2551	2556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146431
44	NC_014013	GGC	2	6	2583	2588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146431
45	NC_014013	GCG	4	12	2624	2635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146431
46	NC_014013	GCC	2	6	2743	2748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146431
47	NC_014013	GCC	2	6	2762	2767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146431
48	NC_014013	GCC	2	6	2774	2779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146431
49	NC_014013	ATA	2	6	2860	2865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014013	CCT	2	6	2907	2912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146432
51	NC_014013	CAT	2	6	2971	2976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146432
52	NC_014013	CGA	2	6	3014	3019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146432
53	NC_014013	CAG	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146432
54	NC_014013	GCG	2	6	3299	3304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014013	AGC	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146433
56	NC_014013	TCC	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014013	CAT	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146434
58	NC_014013	GCG	2	6	4097	4102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146434
59	NC_014013	ATG	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294146434
60	NC_014013	GGC	2	6	4194	4199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146435
61	NC_014013	TTG	2	6	4252	4257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294146435
62	NC_014013	GCC	3	9	4261	4269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146435
63	NC_014013	GGC	2	6	4284	4289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146435
64	NC_014013	GCG	2	6	4294	4299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146435
65	NC_014013	GCG	2	6	4381	4386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146435
66	NC_014013	CGG	2	6	4400	4405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146435
67	NC_014013	TGG	2	6	4439	4444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294146435
68	NC_014013	CGC	2	6	4470	4475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146435
69	NC_014013	GCC	2	6	4492	4497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146435
70	NC_014013	AGC	2	6	4518	4523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146435
71	NC_014013	GCC	2	6	4537	4542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146435
72	NC_014013	GCG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146435
73	NC_014013	CGC	2	6	4633	4638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146435
74	NC_014013	CCG	2	6	4814	4819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146435
75	NC_014013	GCC	2	6	4834	4839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146435
76	NC_014013	ATC	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146435
77	NC_014013	GGT	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294146435
78	NC_014013	ATT	2	6	4923	4928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294146435
79	NC_014013	CGT	2	6	4965	4970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146435
80	NC_014013	GTT	2	6	4983	4988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294146435
81	NC_014013	AAC	2	6	5068	5073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014013	CCG	2	6	5297	5302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146436
83	NC_014013	GCG	2	6	5397	5402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146437
84	NC_014013	GCA	2	6	5476	5481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146437
85	NC_014013	CGG	2	6	5705	5710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014013	CGG	2	6	5720	5725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014013	GCC	2	6	5735	5740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014013	CTT	2	6	5799	5804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294146438
89	NC_014013	GCG	2	6	5809	5814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146438
90	NC_014013	CGG	2	6	5918	5923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146438
91	NC_014013	CGG	2	6	5990	5995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146438
92	NC_014013	GCA	2	6	6114	6119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146439
93	NC_014013	GAG	2	6	6217	6222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294146439
94	NC_014013	GGC	2	6	6439	6444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014013	GGC	2	6	6466	6471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014013	CGG	2	6	6550	6555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146440
97	NC_014013	CAG	2	6	6579	6584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146440
98	NC_014013	ATC	2	6	6597	6602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146440
99	NC_014013	CGC	2	6	6643	6648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146440
100	NC_014013	CGC	2	6	6653	6658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146440
101	NC_014013	CCT	2	6	6697	6702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146440
102	NC_014013	CTG	2	6	6717	6722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146440
103	NC_014013	ACG	2	6	6744	6749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146440
104	NC_014013	GCC	3	9	6771	6779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146440
105	NC_014013	CGC	2	6	6995	7000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146440
106	NC_014013	CGC	2	6	7027	7032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146440
107	NC_014013	AGC	2	6	7041	7046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146440
108	NC_014013	GTT	2	6	7064	7069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294146440
109	NC_014013	CTG	2	6	7131	7136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146440
110	NC_014013	ATT	2	6	7318	7323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294146440
111	NC_014013	GCA	2	6	7348	7353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146440
112	NC_014013	GCC	2	6	7377	7382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146440
113	NC_014013	CAG	2	6	7406	7411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146440
114	NC_014013	GAC	2	6	7412	7417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146440
115	NC_014013	ATT	2	6	7522	7527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294146440
116	NC_014013	GTC	2	6	7626	7631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146440
117	NC_014013	GGC	2	6	7812	7817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146440
118	NC_014013	CGG	2	6	7855	7860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146440
119	NC_014013	GCG	2	6	7995	8000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146440
120	NC_014013	TTC	3	9	8127	8135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294146440
121	NC_014013	AAG	2	6	8185	8190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014013	CCA	2	6	8350	8355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294146441
123	NC_014013	TTC	2	6	8417	8422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294146441
124	NC_014013	TCC	2	6	8535	8540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146441
125	NC_014013	GCG	2	6	8602	8607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146441
126	NC_014013	GCA	2	6	8659	8664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146441
127	NC_014013	CCG	2	6	8720	8725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146441
128	NC_014013	TCC	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_014013	GCG	2	6	8856	8861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014013	GAA	2	6	8897	8902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014013	GTT	2	6	8980	8985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294146442
132	NC_014013	TCT	2	6	9094	9099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294146442
133	NC_014013	CTG	2	6	9215	9220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146443
134	NC_014013	CTT	2	6	9239	9244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294146443
135	NC_014013	GGC	2	6	9293	9298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146443
136	NC_014013	CCA	2	6	9423	9428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294146443
137	NC_014013	CGG	2	6	9532	9537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146443
138	NC_014013	CAG	2	6	9589	9594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146443
139	NC_014013	CTG	2	6	9722	9727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146444
140	NC_014013	GCA	2	6	9781	9786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146444
141	NC_014013	GGC	2	6	9883	9888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146444
142	NC_014013	CGC	2	6	9913	9918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146444
143	NC_014013	GCT	2	6	9922	9927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146444
144	NC_014013	TGG	2	6	9969	9974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294146444
145	NC_014013	GGC	2	6	10025	10030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146444
146	NC_014013	GGC	2	6	10046	10051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146444
147	NC_014013	CCG	2	6	10068	10073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146444
148	NC_014013	CGG	2	6	10105	10110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146444
149	NC_014013	CTG	2	6	10160	10165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146444
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153	NC_014013	CGG	2	6	10300	10305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146444
154	NC_014013	CTG	2	6	10307	10312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146444
155	NC_014013	GTC	2	6	10343	10348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146444
156	NC_014013	TGG	2	6	10365	10370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294146444
157	NC_014013	GGA	2	6	10448	10453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294146444
158	NC_014013	GAG	2	6	10506	10511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294146444
159	NC_014013	CTG	2	6	10553	10558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146444
160	NC_014013	CTG	2	6	10616	10621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146444
161	NC_014013	GCT	2	6	10627	10632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146444
162	NC_014013	GCG	2	6	10635	10640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146444
163	NC_014013	GCC	2	6	10688	10693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_014013	GAG	2	6	10741	10746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014013	CCT	2	6	10762	10767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_014013	TCT	2	6	10816	10821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_014013	CCG	2	6	10864	10869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146445
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186	NC_014013	CAC	2	6	11971	11976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294146445
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188	NC_014013	CGC	2	6	12094	12099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
189	NC_014013	CGC	2	6	12200	12205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146446
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239	NC_014013	TGA	2	6	14794	14799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
240	NC_014013	GGC	2	6	14888	14893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146449
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244	NC_014013	CCG	2	6	15024	15029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
245	NC_014013	GAA	2	6	15047	15052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
246	NC_014013	AGG	2	6	15053	15058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
247	NC_014013	CAT	2	6	15105	15110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146450
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249	NC_014013	CGA	2	6	15230	15235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146450
250	NC_014013	GCA	2	6	15361	15366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_014013	TGA	2	6	15420	15425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294146451
252	NC_014013	CAG	2	6	15575	15580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146451
253	NC_014013	CTC	2	6	15595	15600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146451
254	NC_014013	TGC	2	6	15630	15635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146451
255	NC_014013	CCG	2	6	15636	15641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146451
256	NC_014013	AGC	2	6	15665	15670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146451
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258	NC_014013	CTG	2	6	15769	15774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146451
259	NC_014013	CAG	2	6	15877	15882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146451
260	NC_014013	GCC	2	6	15914	15919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146451
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262	NC_014013	CAG	2	6	16148	16153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146451
263	NC_014013	CGT	2	6	16239	16244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146451
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270	NC_014013	CTT	2	6	16591	16596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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374	NC_014013	TCC	2	6	21631	21636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146454
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382	NC_014013	CTC	2	6	21828	21833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146454
383	NC_014013	TCC	2	6	21892	21897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146454
384	NC_014013	CAG	2	6	21915	21920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146454
385	NC_014013	CGC	2	6	21966	21971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146454
386	NC_014013	CTG	2	6	21999	22004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146454
387	NC_014013	GGA	2	6	22013	22018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294146454
388	NC_014013	GCC	3	9	22045	22053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146454
389	NC_014013	CGG	2	6	22095	22100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146454
390	NC_014013	CGA	2	6	22112	22117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146454
391	NC_014013	CGG	2	6	22203	22208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_014013	GAC	2	6	22270	22275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146455
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402	NC_014013	CAG	2	6	22612	22617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146455
403	NC_014013	GCC	2	6	22631	22636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146455
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465	NC_014013	CAG	2	6	25243	25248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146459
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499	NC_014013	GGC	2	6	26600	26605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146461
500	NC_014013	CAG	2	6	26657	26662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146461

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